FuNGI

A7TMM7

Protein Details

Accession

A7TMM7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-33	GKASGSFKKPKKTYQVNEQFTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-23	KKRPRSGDGKASGSFKKPKK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	vpo:Kpol_1066p5 -
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MPIKKRPRSGDGKASGSFKKPKKTYQVNEQFTSQDIWKSLDRIRKTHNNVDSIIPNSSLFVVFYPSFSKQEVESCVSALFEYIDSSKVKIHEVKNKDNIRFISITNFSILDCSLILTVLFIFKNKKWVAPNNYDYFQTLKDININGSFYIPNSTLYQSEEVIDPKLRKSSTPFVKSIIPRYQSMADFIECSISSTDQKSVSSFINEVTTFFSRLKYSKKVVTSRQFKESLEQHLQKFELQITEMFLKPFQLFDTESVTNNNSALIESSKNNLSKYIENLKNYNENTAITKREETASQVSTTKRTAKKQLMTNNFDQSKRNYTAASTVTTTIATNTTTSITTTTKNPVSRYSNNEYSPANNTTKNTTQGDQTSSHRPNFMTQEEIKDHCLATIKASIDLVKSKSPYQILRAYVKCPRQNYIDLIYQHLNELRSSTNCNIVILHLNNLHEAQPWFNSLDISKYTNFSQQPHQTTVRIISIGGVGEHILNALDQISNILN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.61
3	0.6
4	0.6
5	0.57
6	0.6
7	0.6
8	0.65
9	0.71
10	0.78
11	0.78
12	0.8
13	0.84
14	0.81
15	0.78
16	0.71
17	0.61
18	0.52
19	0.47
20	0.37
21	0.3
22	0.24
23	0.24
24	0.24
25	0.27
26	0.32
27	0.37
28	0.4
29	0.41
30	0.49
31	0.56
32	0.62
33	0.67
34	0.68
35	0.64
36	0.61
37	0.6
38	0.56
39	0.48
40	0.41
41	0.33
42	0.26
43	0.22
44	0.21
45	0.17
46	0.12
47	0.1
48	0.13
49	0.12
50	0.14
51	0.17
52	0.19
53	0.21
54	0.21
55	0.22
56	0.19
57	0.24
58	0.27
59	0.28
60	0.25
61	0.24
62	0.23
63	0.22
64	0.2
65	0.16
66	0.12
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.11
71	0.11
72	0.12
73	0.15
74	0.16
75	0.2
76	0.26
77	0.32
78	0.39
79	0.47
80	0.55
81	0.62
82	0.68
83	0.66
84	0.65
85	0.59
86	0.55
87	0.49
88	0.4
89	0.38
90	0.33
91	0.31
92	0.26
93	0.24
94	0.19
95	0.18
96	0.17
97	0.1
98	0.08
99	0.08
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.05
104	0.06
105	0.07
106	0.08
107	0.09
108	0.13
109	0.14
110	0.23
111	0.24
112	0.28
113	0.33
114	0.42
115	0.49
116	0.54
117	0.6
118	0.57
119	0.57
120	0.53
121	0.47
122	0.4
123	0.32
124	0.25
125	0.19
126	0.15
127	0.17
128	0.17
129	0.18
130	0.17
131	0.17
132	0.15
133	0.16
134	0.15
135	0.12
136	0.14
137	0.12
138	0.12
139	0.13
140	0.14
141	0.14
142	0.15
143	0.16
144	0.14
145	0.14
146	0.14
147	0.13
148	0.14
149	0.17
150	0.16
151	0.16
152	0.21
153	0.2
154	0.2
155	0.26
156	0.33
157	0.4
158	0.44
159	0.44
160	0.41
161	0.47
162	0.49
163	0.5
164	0.47
165	0.4
166	0.35
167	0.37
168	0.38
169	0.32
170	0.31
171	0.26
172	0.19
173	0.17
174	0.16
175	0.15
176	0.11
177	0.12
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.14
183	0.13
184	0.14
185	0.13
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.11
191	0.13
192	0.13
193	0.13
194	0.14
195	0.14
196	0.14
197	0.15
198	0.15
199	0.14
200	0.17
201	0.22
202	0.23
203	0.26
204	0.3
205	0.37
206	0.41
207	0.48
208	0.56
209	0.6
210	0.58
211	0.6
212	0.56
213	0.5
214	0.49
215	0.44
216	0.41
217	0.39
218	0.4
219	0.35
220	0.35
221	0.35
222	0.3
223	0.27
224	0.21
225	0.13
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.14
241	0.14
242	0.14
243	0.16
244	0.16
245	0.14
246	0.14
247	0.13
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.1
255	0.14
256	0.15
257	0.15
258	0.16
259	0.18
260	0.17
261	0.22
262	0.3
263	0.3
264	0.31
265	0.33
266	0.33
267	0.37
268	0.36
269	0.33
270	0.24
271	0.2
272	0.22
273	0.23
274	0.23
275	0.18
276	0.19
277	0.18
278	0.18
279	0.18
280	0.18
281	0.19
282	0.18
283	0.18
284	0.2
285	0.2
286	0.22
287	0.24
288	0.29
289	0.3
290	0.34
291	0.41
292	0.46
293	0.52
294	0.57
295	0.63
296	0.64
297	0.64
298	0.63
299	0.63
300	0.59
301	0.53
302	0.48
303	0.43
304	0.41
305	0.38
306	0.35
307	0.27
308	0.24
309	0.28
310	0.27
311	0.25
312	0.19
313	0.17
314	0.17
315	0.17
316	0.16
317	0.12
318	0.11
319	0.09
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.08
324	0.09
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.15
329	0.2
330	0.24
331	0.26
332	0.28
333	0.32
334	0.38
335	0.42
336	0.47
337	0.5
338	0.51
339	0.5
340	0.51
341	0.45
342	0.4
343	0.39
344	0.37
345	0.32
346	0.27
347	0.28
348	0.31
349	0.34
350	0.37
351	0.35
352	0.31
353	0.32
354	0.32
355	0.34
356	0.31
357	0.32
358	0.36
359	0.38
360	0.38
361	0.37
362	0.34
363	0.36
364	0.38
365	0.36
366	0.33
367	0.29
368	0.34
369	0.36
370	0.37
371	0.35
372	0.31
373	0.29
374	0.23
375	0.26
376	0.19
377	0.18
378	0.22
379	0.2
380	0.19
381	0.2
382	0.19
383	0.18
384	0.22
385	0.22
386	0.21
387	0.22
388	0.23
389	0.28
390	0.31
391	0.32
392	0.34
393	0.37
394	0.39
395	0.45
396	0.45
397	0.46
398	0.49
399	0.55
400	0.55
401	0.52
402	0.51
403	0.48
404	0.5
405	0.5
406	0.47
407	0.46
408	0.41
409	0.42
410	0.41
411	0.35
412	0.33
413	0.31
414	0.27
415	0.2
416	0.21
417	0.19
418	0.19
419	0.24
420	0.24
421	0.28
422	0.28
423	0.28
424	0.26
425	0.25
426	0.3
427	0.26
428	0.29
429	0.24
430	0.25
431	0.26
432	0.26
433	0.25
434	0.21
435	0.21
436	0.19
437	0.18
438	0.19
439	0.19
440	0.18
441	0.19
442	0.16
443	0.19
444	0.19
445	0.21
446	0.21
447	0.23
448	0.24
449	0.31
450	0.33
451	0.32
452	0.39
453	0.45
454	0.49
455	0.53
456	0.55
457	0.48
458	0.49
459	0.5
460	0.43
461	0.34
462	0.28
463	0.23
464	0.21
465	0.2
466	0.16
467	0.12
468	0.09
469	0.09
470	0.09
471	0.08
472	0.06
473	0.05
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06

A7TMM7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer