Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7R2W0

Protein Details
Accession J7R2W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-203PDMDRDRQRSRRRANQRRHRGGSNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-199DRQRSRRRANQRRHR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR045007  LSB5  
Gene Ontology GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MGFWSSHQHSAITDTVDRIVSSQKYPLEVELDNLVNLIRESSDYEYTMNQEECAIVLRKKLKYGNKVQQSRSLDLLDLFISQGLKFGTMYNDEKLLDRLDVIANNKDTNGKGVVYNKKIISKAVKYIMDWNAYIVDMGAESSRTYEGIVRLKDTLGTGSSSSRSKRTPDIDRQRLNKGGPDMDRDRQRSRRRANQRRHRGGSNFMDDVADDSVFRAPQDPDSLYRIPQIDLKKHAPKIKMVISDALAAAVSLDNALMVLPENKNALTDKDTTSKFIQARAIRRKVLRYLQLVTEGEFLGSLIHANDELVKALTKYDERTQGEDDDESSDLSEDDSDFSDDDEPSSSGGFRSDEAGSDDPFADNHRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.22
4 0.21
5 0.18
6 0.22
7 0.21
8 0.21
9 0.25
10 0.25
11 0.27
12 0.29
13 0.29
14 0.27
15 0.25
16 0.25
17 0.24
18 0.22
19 0.19
20 0.18
21 0.16
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.07
26 0.07
27 0.1
28 0.14
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.24
35 0.21
36 0.17
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.17
41 0.18
42 0.15
43 0.21
44 0.28
45 0.29
46 0.35
47 0.43
48 0.47
49 0.54
50 0.63
51 0.67
52 0.7
53 0.77
54 0.74
55 0.75
56 0.72
57 0.66
58 0.58
59 0.49
60 0.39
61 0.31
62 0.29
63 0.2
64 0.15
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.15
76 0.18
77 0.17
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.19
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.14
88 0.16
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.19
96 0.18
97 0.14
98 0.15
99 0.23
100 0.3
101 0.31
102 0.36
103 0.35
104 0.38
105 0.38
106 0.39
107 0.38
108 0.33
109 0.36
110 0.37
111 0.37
112 0.33
113 0.39
114 0.39
115 0.34
116 0.3
117 0.25
118 0.19
119 0.18
120 0.17
121 0.1
122 0.06
123 0.04
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.08
133 0.11
134 0.16
135 0.17
136 0.17
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.16
141 0.13
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.17
150 0.18
151 0.19
152 0.25
153 0.3
154 0.36
155 0.45
156 0.54
157 0.6
158 0.65
159 0.66
160 0.64
161 0.62
162 0.54
163 0.46
164 0.37
165 0.32
166 0.27
167 0.29
168 0.28
169 0.3
170 0.35
171 0.37
172 0.41
173 0.46
174 0.53
175 0.58
176 0.61
177 0.66
178 0.72
179 0.78
180 0.83
181 0.85
182 0.87
183 0.87
184 0.84
185 0.8
186 0.71
187 0.68
188 0.62
189 0.56
190 0.44
191 0.35
192 0.3
193 0.24
194 0.23
195 0.16
196 0.1
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.2
209 0.21
210 0.19
211 0.22
212 0.21
213 0.19
214 0.23
215 0.25
216 0.24
217 0.29
218 0.36
219 0.4
220 0.44
221 0.49
222 0.46
223 0.45
224 0.47
225 0.47
226 0.44
227 0.38
228 0.35
229 0.3
230 0.29
231 0.25
232 0.19
233 0.13
234 0.09
235 0.08
236 0.05
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.02
244 0.03
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.14
254 0.17
255 0.19
256 0.25
257 0.25
258 0.28
259 0.29
260 0.34
261 0.31
262 0.32
263 0.36
264 0.36
265 0.45
266 0.52
267 0.56
268 0.55
269 0.58
270 0.6
271 0.6
272 0.62
273 0.59
274 0.54
275 0.51
276 0.47
277 0.5
278 0.45
279 0.38
280 0.32
281 0.25
282 0.2
283 0.16
284 0.14
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.13
300 0.14
301 0.18
302 0.23
303 0.32
304 0.34
305 0.38
306 0.4
307 0.39
308 0.39
309 0.36
310 0.3
311 0.24
312 0.21
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.07
320 0.08
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.11
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.19
341 0.21
342 0.2
343 0.21
344 0.22
345 0.19
346 0.18