Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J7RTS3

Protein Details
Accession J7RTS3    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-207VAPTKVKTTKSKQLKTKQFLDFHydrophilic
215-234NSQGRPRRNFDNDNRNRNNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-53RANKNRK
241-251RRGGKAPRKPK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSNPFDLLGNDIEDPSAAVVVPPKEITKKNTSSKKADVPPPSANPARANKNRKGPTGNEGALKDKTAGRQNNRSQDVPSSGAARRDNSRKQTDRHSRTGKADTGKRVRQGWGDDKKELASEQAAEADAEAEIEADSEEKKSAIKNISLEDYLKTQDASALDKHVEAKKVEPLENAKLFVKEEEVFVAPTKVKTTKSKQLKTKQFLDFDVSFKDNNSQGRPRRNFDNDNRNRNNNNRNNDSRRGGKAPRKPKTNSNGNAVEKDNSIDTMNLPTLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.08
4 0.05
5 0.05
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.14
10 0.17
11 0.23
12 0.27
13 0.34
14 0.39
15 0.47
16 0.55
17 0.63
18 0.68
19 0.69
20 0.72
21 0.74
22 0.73
23 0.73
24 0.7
25 0.66
26 0.66
27 0.63
28 0.63
29 0.56
30 0.51
31 0.5
32 0.5
33 0.54
34 0.56
35 0.6
36 0.6
37 0.68
38 0.71
39 0.69
40 0.68
41 0.61
42 0.58
43 0.59
44 0.54
45 0.48
46 0.43
47 0.41
48 0.36
49 0.33
50 0.29
51 0.23
52 0.26
53 0.3
54 0.36
55 0.39
56 0.49
57 0.56
58 0.63
59 0.65
60 0.61
61 0.54
62 0.5
63 0.47
64 0.39
65 0.33
66 0.27
67 0.24
68 0.28
69 0.29
70 0.27
71 0.29
72 0.35
73 0.41
74 0.45
75 0.53
76 0.53
77 0.54
78 0.63
79 0.68
80 0.67
81 0.69
82 0.68
83 0.63
84 0.63
85 0.65
86 0.59
87 0.55
88 0.53
89 0.52
90 0.54
91 0.53
92 0.51
93 0.48
94 0.46
95 0.42
96 0.43
97 0.44
98 0.45
99 0.44
100 0.41
101 0.39
102 0.37
103 0.34
104 0.28
105 0.2
106 0.11
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.1
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.16
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.1
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.15
150 0.16
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.21
155 0.24
156 0.25
157 0.24
158 0.25
159 0.29
160 0.3
161 0.3
162 0.26
163 0.23
164 0.23
165 0.2
166 0.19
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.14
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.19
179 0.26
180 0.33
181 0.41
182 0.51
183 0.59
184 0.66
185 0.73
186 0.8
187 0.79
188 0.8
189 0.77
190 0.69
191 0.62
192 0.59
193 0.5
194 0.42
195 0.39
196 0.32
197 0.25
198 0.23
199 0.25
200 0.22
201 0.25
202 0.29
203 0.34
204 0.4
205 0.51
206 0.56
207 0.57
208 0.62
209 0.66
210 0.69
211 0.7
212 0.74
213 0.73
214 0.78
215 0.8
216 0.79
217 0.77
218 0.77
219 0.78
220 0.76
221 0.75
222 0.73
223 0.76
224 0.76
225 0.77
226 0.74
227 0.69
228 0.67
229 0.65
230 0.66
231 0.66
232 0.68
233 0.72
234 0.75
235 0.77
236 0.75
237 0.78
238 0.78
239 0.8
240 0.75
241 0.73
242 0.73
243 0.69
244 0.68
245 0.61
246 0.54
247 0.44
248 0.4
249 0.32
250 0.24
251 0.21
252 0.18
253 0.16
254 0.18