FuNGI

J7S945

Protein Details

Accession

J7S945

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
206-229	MDRGYPRPPPRQRRLEKRPPPGGD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-93	RGGGRRGSFGARSRGGRGRRAAFGGPGPRFREEGWRGGRGGGRGPPRGGFRSSR
212-226	RPPPRQRRLEKRPPP

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd21605 RRM1_HRB1_GBP2 cd21606 RRM2_HRB1_GBP2 cd21607 RRM3_HRB1_GBP2

Amino Acid Sequences

MEDESYRNLDYGDEGASRSPRRDIDFDNYDRGYDRFPDSRGGGRRGSFGARSRGGRGRRAAFGGPGPRFREEGWRGGRGGGRGPPRGGFRSSRRLVVDAVNTQFTRNFDNSVFVGNLSFDCSVDDLREFFQPIGEIVSTDIITSGGRHKGMGTVEFTNTADVDEAIRQMDGVMFMGREIFVKQDHPPPSQSARPLDVGMGYEGEEMDRGYPRPPPRQRRLEKRPPPGGDRPMEGYEAFIVNLPYAITWQNLKDMFREAGDVSRADVELDYRGLSRGFGSVYFPIKEDMYRAIDMFNGYNLDGRILEVREGRFNYLLDEQLQDQEQIQHPPLDYPQDEEPPMMMGDYEDGQMSQGIGRMHYDEDHTVPPVPPQATEEETVPELEKTEPAPQSEFIQGVVSSGERSTLIYCSNLPVSTSINDLYELFESLGKVNKAELIFDPAGLPTGNAVIDYMDLQYADLCISKLNNYNYGGNDLSVSYAERKALE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.17
3	0.23
4	0.25
5	0.26
6	0.29
7	0.31
8	0.36
9	0.41
10	0.43
11	0.45
12	0.52
13	0.53
14	0.55
15	0.51
16	0.46
17	0.42
18	0.38
19	0.32
20	0.27
21	0.29
22	0.26
23	0.27
24	0.32
25	0.33
26	0.4
27	0.44
28	0.45
29	0.44
30	0.42
31	0.43
32	0.41
33	0.42
34	0.4
35	0.39
36	0.42
37	0.42
38	0.44
39	0.47
40	0.52
41	0.53
42	0.55
43	0.56
44	0.53
45	0.51
46	0.53
47	0.48
48	0.43
49	0.44
50	0.46
51	0.42
52	0.44
53	0.43
54	0.41
55	0.41
56	0.39
57	0.43
58	0.38
59	0.43
60	0.42
61	0.42
62	0.41
63	0.43
64	0.44
65	0.35
66	0.36
67	0.33
68	0.34
69	0.34
70	0.35
71	0.36
72	0.38
73	0.4
74	0.4
75	0.41
76	0.42
77	0.48
78	0.49
79	0.51
80	0.48
81	0.46
82	0.44
83	0.42
84	0.4
85	0.35
86	0.34
87	0.33
88	0.31
89	0.3
90	0.3
91	0.26
92	0.26
93	0.22
94	0.23
95	0.19
96	0.22
97	0.22
98	0.22
99	0.21
100	0.16
101	0.15
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.11
106	0.09
107	0.09
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.11
112	0.09
113	0.1
114	0.12
115	0.13
116	0.12
117	0.12
118	0.11
119	0.11
120	0.12
121	0.1
122	0.09
123	0.08
124	0.09
125	0.09
126	0.08
127	0.08
128	0.06
129	0.06
130	0.07
131	0.1
132	0.12
133	0.12
134	0.13
135	0.13
136	0.16
137	0.17
138	0.19
139	0.18
140	0.17
141	0.17
142	0.18
143	0.18
144	0.15
145	0.14
146	0.12
147	0.09
148	0.07
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.07
168	0.09
169	0.12
170	0.19
171	0.23
172	0.25
173	0.26
174	0.3
175	0.33
176	0.35
177	0.36
178	0.32
179	0.3
180	0.29
181	0.28
182	0.24
183	0.2
184	0.17
185	0.13
186	0.1
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.04
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.07
197	0.13
198	0.19
199	0.29
200	0.39
201	0.48
202	0.56
203	0.66
204	0.74
205	0.79
206	0.84
207	0.85
208	0.85
209	0.85
210	0.84
211	0.77
212	0.75
213	0.71
214	0.67
215	0.57
216	0.49
217	0.43
218	0.36
219	0.33
220	0.26
221	0.19
222	0.14
223	0.12
224	0.1
225	0.08
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.07
236	0.1
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.14
244	0.11
245	0.11
246	0.12
247	0.11
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.06
260	0.07
261	0.06
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.1
267	0.13
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.13
274	0.13
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.13
279	0.13
280	0.14
281	0.13
282	0.1
283	0.08
284	0.07
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.11
293	0.12
294	0.13
295	0.17
296	0.18
297	0.19
298	0.18
299	0.18
300	0.19
301	0.17
302	0.17
303	0.14
304	0.15
305	0.13
306	0.14
307	0.14
308	0.12
309	0.11
310	0.14
311	0.15
312	0.16
313	0.17
314	0.17
315	0.17
316	0.18
317	0.18
318	0.19
319	0.17
320	0.18
321	0.2
322	0.21
323	0.22
324	0.2
325	0.19
326	0.16
327	0.15
328	0.12
329	0.09
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.06
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.14
348	0.13
349	0.15
350	0.16
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.17
355	0.2
356	0.19
357	0.17
358	0.18
359	0.2
360	0.21
361	0.22
362	0.21
363	0.18
364	0.18
365	0.19
366	0.17
367	0.13
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.18
373	0.19
374	0.21
375	0.23
376	0.22
377	0.25
378	0.26
379	0.24
380	0.18
381	0.17
382	0.15
383	0.13
384	0.13
385	0.1
386	0.09
387	0.08
388	0.09
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.1
393	0.11
394	0.12
395	0.13
396	0.15
397	0.17
398	0.16
399	0.16
400	0.16
401	0.17
402	0.16
403	0.18
404	0.16
405	0.14
406	0.15
407	0.15
408	0.15
409	0.13
410	0.13
411	0.12
412	0.12
413	0.12
414	0.13
415	0.18
416	0.17
417	0.16
418	0.16
419	0.2
420	0.19
421	0.2
422	0.2
423	0.22
424	0.22
425	0.22
426	0.22
427	0.18
428	0.19
429	0.16
430	0.15
431	0.07
432	0.09
433	0.08
434	0.07
435	0.08
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.07
448	0.09
449	0.1
450	0.15
451	0.22
452	0.25
453	0.3
454	0.33
455	0.37
456	0.37
457	0.4
458	0.36
459	0.29
460	0.27
461	0.21
462	0.19
463	0.16
464	0.16
465	0.15
466	0.16

J7S945

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer