Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2K0WV38

Protein Details
Accession A0A2K0WV38    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31IDPAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTHydrophilic
47-74AEASSDFKAEKKKKKSKKDKHAEDVVAQHydrophilic
78-104EVPAVEDKPEKKHKKKKHHDAEVAATEBasic
108-134TPVAVDSEKKKKSKKKHRETEAIEIAEHydrophilic
409-433AETAKMRKGKKGSQRVQRRRIPEFAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-41AKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTERKHKKSKSI
53-66FKAEKKKKKSKKDK
85-95KPEKKHKKKKH
116-141KKKKSKKKHRETEAIEIAERPKKSKK
413-428KMRKGKKGSQRVQRRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.666, mito_nucl 10.166, cyto 8, cyto_mito 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDPAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTERKHKKSKSIAAAEVAEASSDFKAEKKKKKSKKDKHAEDVVAQPETEVPAVEDKPEKKHKKKKHHDAEVAATEEADTPVAVDSEKKKKSKKKHRETEAIEIAERPKKSKKDVTAVEPEEDASPTDPDAMDVDMPPPAKPSKSSSNIYQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLFPIGWAQPVTNCQQQHLSHLRNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGENPGRKGAATDDESPATVMAKGESAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGNGEKVKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKAGEKAVVAEEAETAKMRKGKKGSQRVQRRRIPEFAMTRFAVEGEEQTEDNEAEKREVLALPEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.63
3 0.71
4 0.81
5 0.85
6 0.86
7 0.92
8 0.93
9 0.9
10 0.89
11 0.83
12 0.81
13 0.75
14 0.66
15 0.56
16 0.5
17 0.43
18 0.43
19 0.46
20 0.41
21 0.44
22 0.47
23 0.55
24 0.62
25 0.71
26 0.72
27 0.72
28 0.72
29 0.69
30 0.65
31 0.55
32 0.46
33 0.35
34 0.25
35 0.17
36 0.14
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.11
41 0.21
42 0.31
43 0.41
44 0.51
45 0.62
46 0.72
47 0.83
48 0.91
49 0.92
50 0.94
51 0.95
52 0.94
53 0.93
54 0.92
55 0.85
56 0.77
57 0.73
58 0.65
59 0.54
60 0.43
61 0.33
62 0.24
63 0.22
64 0.18
65 0.11
66 0.08
67 0.12
68 0.12
69 0.15
70 0.2
71 0.22
72 0.3
73 0.41
74 0.51
75 0.57
76 0.68
77 0.76
78 0.81
79 0.9
80 0.93
81 0.93
82 0.94
83 0.91
84 0.87
85 0.84
86 0.77
87 0.68
88 0.57
89 0.45
90 0.35
91 0.27
92 0.21
93 0.13
94 0.07
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.09
100 0.15
101 0.25
102 0.32
103 0.38
104 0.47
105 0.56
106 0.67
107 0.75
108 0.8
109 0.82
110 0.86
111 0.9
112 0.91
113 0.88
114 0.87
115 0.83
116 0.73
117 0.62
118 0.53
119 0.47
120 0.41
121 0.36
122 0.29
123 0.3
124 0.33
125 0.39
126 0.46
127 0.49
128 0.54
129 0.58
130 0.61
131 0.63
132 0.61
133 0.54
134 0.46
135 0.4
136 0.31
137 0.26
138 0.2
139 0.11
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.14
157 0.19
158 0.26
159 0.31
160 0.35
161 0.37
162 0.45
163 0.51
164 0.52
165 0.49
166 0.41
167 0.38
168 0.38
169 0.34
170 0.27
171 0.24
172 0.26
173 0.24
174 0.24
175 0.22
176 0.19
177 0.22
178 0.19
179 0.17
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.12
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.11
198 0.14
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.21
203 0.21
204 0.28
205 0.32
206 0.34
207 0.34
208 0.37
209 0.39
210 0.36
211 0.37
212 0.37
213 0.35
214 0.31
215 0.29
216 0.29
217 0.27
218 0.25
219 0.25
220 0.23
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.07
229 0.08
230 0.17
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.19
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.12
247 0.09
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.07
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.13
298 0.14
299 0.16
300 0.19
301 0.23
302 0.23
303 0.26
304 0.26
305 0.23
306 0.23
307 0.32
308 0.33
309 0.35
310 0.38
311 0.41
312 0.42
313 0.44
314 0.47
315 0.39
316 0.38
317 0.33
318 0.31
319 0.26
320 0.23
321 0.19
322 0.14
323 0.13
324 0.09
325 0.08
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.1
347 0.11
348 0.13
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.17
354 0.24
355 0.3
356 0.32
357 0.38
358 0.47
359 0.56
360 0.61
361 0.7
362 0.67
363 0.69
364 0.67
365 0.6
366 0.52
367 0.43
368 0.4
369 0.31
370 0.27
371 0.18
372 0.16
373 0.14
374 0.12
375 0.11
376 0.09
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.15
400 0.2
401 0.22
402 0.29
403 0.36
404 0.44
405 0.54
406 0.64
407 0.69
408 0.75
409 0.84
410 0.87
411 0.9
412 0.89
413 0.86
414 0.81
415 0.79
416 0.74
417 0.71
418 0.69
419 0.63
420 0.61
421 0.53
422 0.48
423 0.41
424 0.36
425 0.28
426 0.2
427 0.17
428 0.13
429 0.15
430 0.13
431 0.14
432 0.16
433 0.14
434 0.15
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.18
440 0.19
441 0.2
442 0.21