Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2K0WPR6

Protein Details
Accession A0A2K0WPR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-263VDRDERRSQSRSRSRSRNRSQSDSRSRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRRG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSRNKDTVHADARRFLDERGSNVSVAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVNFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLMEYLKYGGEAFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYQMLEPFLEDRRKLRRRGRAGVVLTFMDEFVDELLTKERVCGTSLWKMPKREVLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEEDEAEKENGTREESGEISDRDDMEVDRDERRSQSRSRSRSRNRSQSDSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.4
3 0.39
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.31
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.27
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.16
73 0.17
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.14
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.27
121 0.2
122 0.2
123 0.19
124 0.16
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.16
132 0.26
133 0.31
134 0.4
135 0.47
136 0.53
137 0.59
138 0.66
139 0.69
140 0.66
141 0.63
142 0.56
143 0.5
144 0.4
145 0.32
146 0.25
147 0.18
148 0.1
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.22
165 0.27
166 0.35
167 0.39
168 0.41
169 0.42
170 0.48
171 0.47
172 0.42
173 0.41
174 0.37
175 0.35
176 0.33
177 0.33
178 0.27
179 0.23
180 0.21
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.19
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.29
227 0.34
228 0.36
229 0.38
230 0.47
231 0.54
232 0.61
233 0.69
234 0.75
235 0.81
236 0.86
237 0.91
238 0.91
239 0.88
240 0.88
241 0.88
242 0.88
243 0.88