Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J7S4J3

Protein Details
Accession J7S4J3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-313TEQQNKTQTQTNKRKRKGKMIIKKSGETRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-320KRKRKGKMIIKKSGETRLHKKKKQ
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MYHLQQVRLIRTSMDEELKANIYKTAQFVNERSQNVEEQLLKDSSGKFSFLQPDNEHYAFYQSLRVKDNKDMSESKTVDSTALNEPDPVPPFILIKDVSDLSIPSLDLEIMRRTADYLQYTKEDEREQIRTRLVKEERFQFLNPSHELNPTFEVILKQFIACSKFKPENLTEQEYLNRCFQRAVYNEYLKEFQNRSNTQLESYKIRFAAIDWINFKVIKNPALENSDQTTNGKLEFKMPLDFSKLFQKTISNTENDIYLKHFFGDGAANNAEKLSLGGVLESTVTEQQNKTQTQTNKRKRKGKMIIKKSGETRLHKKKKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.27
3 0.25
4 0.27
5 0.3
6 0.28
7 0.24
8 0.22
9 0.2
10 0.21
11 0.23
12 0.24
13 0.24
14 0.28
15 0.3
16 0.37
17 0.42
18 0.41
19 0.43
20 0.41
21 0.38
22 0.36
23 0.38
24 0.31
25 0.25
26 0.28
27 0.25
28 0.23
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.23
33 0.23
34 0.2
35 0.24
36 0.31
37 0.32
38 0.38
39 0.35
40 0.39
41 0.44
42 0.43
43 0.39
44 0.31
45 0.31
46 0.25
47 0.23
48 0.25
49 0.22
50 0.25
51 0.3
52 0.33
53 0.33
54 0.4
55 0.46
56 0.41
57 0.44
58 0.43
59 0.42
60 0.48
61 0.46
62 0.39
63 0.34
64 0.32
65 0.26
66 0.23
67 0.22
68 0.18
69 0.19
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.21
74 0.23
75 0.21
76 0.16
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.16
81 0.13
82 0.11
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.11
102 0.14
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.19
107 0.21
108 0.21
109 0.22
110 0.2
111 0.2
112 0.22
113 0.27
114 0.28
115 0.29
116 0.32
117 0.33
118 0.33
119 0.39
120 0.39
121 0.38
122 0.39
123 0.41
124 0.41
125 0.4
126 0.39
127 0.34
128 0.33
129 0.32
130 0.29
131 0.25
132 0.23
133 0.23
134 0.23
135 0.21
136 0.2
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.12
141 0.1
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.17
151 0.2
152 0.22
153 0.26
154 0.25
155 0.31
156 0.35
157 0.39
158 0.34
159 0.32
160 0.35
161 0.33
162 0.34
163 0.3
164 0.25
165 0.2
166 0.2
167 0.2
168 0.22
169 0.23
170 0.27
171 0.29
172 0.32
173 0.32
174 0.33
175 0.34
176 0.28
177 0.3
178 0.25
179 0.23
180 0.29
181 0.29
182 0.32
183 0.34
184 0.34
185 0.32
186 0.34
187 0.32
188 0.29
189 0.29
190 0.28
191 0.24
192 0.23
193 0.21
194 0.18
195 0.25
196 0.21
197 0.23
198 0.22
199 0.23
200 0.24
201 0.25
202 0.24
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.21
207 0.22
208 0.24
209 0.28
210 0.28
211 0.25
212 0.26
213 0.24
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.17
218 0.19
219 0.18
220 0.15
221 0.16
222 0.19
223 0.2
224 0.21
225 0.22
226 0.21
227 0.25
228 0.26
229 0.25
230 0.31
231 0.31
232 0.29
233 0.28
234 0.3
235 0.27
236 0.34
237 0.36
238 0.28
239 0.28
240 0.28
241 0.3
242 0.27
243 0.25
244 0.2
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.12
250 0.13
251 0.16
252 0.14
253 0.16
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.11
260 0.1
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.08
270 0.1
271 0.12
272 0.15
273 0.16
274 0.21
275 0.29
276 0.3
277 0.32
278 0.36
279 0.44
280 0.52
281 0.63
282 0.68
283 0.72
284 0.8
285 0.86
286 0.86
287 0.89
288 0.89
289 0.88
290 0.89
291 0.88
292 0.89
293 0.87
294 0.85
295 0.8
296 0.79
297 0.76
298 0.74
299 0.74
300 0.75