FuNGI

A0A2K0W828

Protein Details

Accession

A0A2K0W828

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
183-204	EQEFKDPKRAKHPSKRNLKVVD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
190-197	KRAKHPSK

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSSAPRTGERMVHQDFIARIRFSNALPPPPHPPKLLDIPNTGLASGQYTTPGFASRLAREQPLNIEADAELGMPLDLVGMPGVFDGDERSIQAPPHPPALHPHDRPLLRPIAALGKHKVAEANVSFLRRTEYISSTVTKRQDGAAPRALLTKANKNRRIPEPAADAPHVIKRKIDKGFDIAEQEFKDPKRAKHPSKRNLKVVDVSPFIPDLEAFPDSGAYVTIKFHQNPVVSTKDYDRRLLSGLFRPIDRTAEEEEAYEAAVAAHEQDPENNPKPQNWMNFDYYLAATPDVGDRFRRKFDVEDADHNEDELYTHDSVNGGCFQYNRLRAYETAQETNYDHETKFDAEVLLAYNEDTFYPNQKAVYYYPVMQKSVIRPQRTKNIARNIGITDEEQVVDQLDVTVEDPREDIRDMIKTHRDHPLGTGQADEEEGNEEEHHDGQDAEGEEEGEHHSPAARRSRSASEEHDAEGEDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.39
3	0.37
4	0.37
5	0.38
6	0.3
7	0.27
8	0.28
9	0.3
10	0.26
11	0.34
12	0.34
13	0.36
14	0.38
15	0.41
16	0.47
17	0.53
18	0.56
19	0.49
20	0.48
21	0.45
22	0.52
23	0.57
24	0.52
25	0.48
26	0.48
27	0.51
28	0.48
29	0.41
30	0.32
31	0.24
32	0.21
33	0.18
34	0.14
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.12
39	0.14
40	0.12
41	0.17
42	0.21
43	0.22
44	0.28
45	0.3
46	0.33
47	0.33
48	0.34
49	0.34
50	0.32
51	0.31
52	0.24
53	0.22
54	0.18
55	0.18
56	0.16
57	0.11
58	0.08
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.06
74	0.07
75	0.08
76	0.09
77	0.11
78	0.13
79	0.13
80	0.18
81	0.23
82	0.23
83	0.31
84	0.3
85	0.29
86	0.35
87	0.43
88	0.48
89	0.43
90	0.47
91	0.47
92	0.48
93	0.49
94	0.47
95	0.43
96	0.34
97	0.33
98	0.28
99	0.28
100	0.3
101	0.32
102	0.3
103	0.29
104	0.29
105	0.29
106	0.29
107	0.21
108	0.24
109	0.21
110	0.23
111	0.22
112	0.23
113	0.22
114	0.21
115	0.24
116	0.18
117	0.21
118	0.19
119	0.19
120	0.21
121	0.23
122	0.26
123	0.26
124	0.31
125	0.31
126	0.28
127	0.26
128	0.25
129	0.28
130	0.3
131	0.33
132	0.34
133	0.32
134	0.32
135	0.34
136	0.32
137	0.31
138	0.29
139	0.33
140	0.36
141	0.45
142	0.52
143	0.54
144	0.6
145	0.62
146	0.67
147	0.6
148	0.56
149	0.53
150	0.49
151	0.47
152	0.42
153	0.36
154	0.29
155	0.32
156	0.3
157	0.22
158	0.22
159	0.23
160	0.3
161	0.34
162	0.35
163	0.31
164	0.32
165	0.35
166	0.34
167	0.34
168	0.27
169	0.25
170	0.23
171	0.23
172	0.23
173	0.2
174	0.27
175	0.27
176	0.3
177	0.37
178	0.46
179	0.55
180	0.62
181	0.72
182	0.73
183	0.8
184	0.85
185	0.82
186	0.76
187	0.69
188	0.63
189	0.55
190	0.5
191	0.4
192	0.34
193	0.26
194	0.22
195	0.19
196	0.15
197	0.11
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.08
211	0.11
212	0.12
213	0.13
214	0.17
215	0.17
216	0.18
217	0.21
218	0.22
219	0.19
220	0.2
221	0.23
222	0.26
223	0.27
224	0.28
225	0.25
226	0.22
227	0.23
228	0.24
229	0.22
230	0.2
231	0.23
232	0.22
233	0.21
234	0.22
235	0.21
236	0.21
237	0.18
238	0.16
239	0.15
240	0.16
241	0.16
242	0.14
243	0.14
244	0.12
245	0.12
246	0.09
247	0.06
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.1
257	0.17
258	0.2
259	0.23
260	0.23
261	0.23
262	0.29
263	0.33
264	0.36
265	0.35
266	0.37
267	0.36
268	0.36
269	0.35
270	0.31
271	0.26
272	0.21
273	0.16
274	0.11
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.12
281	0.17
282	0.2
283	0.23
284	0.24
285	0.24
286	0.25
287	0.31
288	0.36
289	0.35
290	0.39
291	0.42
292	0.44
293	0.42
294	0.4
295	0.34
296	0.24
297	0.21
298	0.16
299	0.13
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.11
305	0.12
306	0.13
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.13
311	0.19
312	0.24
313	0.24
314	0.23
315	0.25
316	0.25
317	0.29
318	0.33
319	0.3
320	0.29
321	0.27
322	0.28
323	0.26
324	0.29
325	0.28
326	0.23
327	0.18
328	0.16
329	0.18
330	0.17
331	0.18
332	0.15
333	0.12
334	0.1
335	0.11
336	0.11
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.12
346	0.15
347	0.16
348	0.16
349	0.17
350	0.19
351	0.19
352	0.24
353	0.22
354	0.24
355	0.3
356	0.32
357	0.32
358	0.31
359	0.33
360	0.33
361	0.41
362	0.44
363	0.44
364	0.46
365	0.52
366	0.61
367	0.65
368	0.68
369	0.66
370	0.7
371	0.7
372	0.67
373	0.64
374	0.55
375	0.49
376	0.42
377	0.34
378	0.25
379	0.19
380	0.17
381	0.14
382	0.12
383	0.11
384	0.09
385	0.09
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.07
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.11
394	0.12
395	0.14
396	0.14
397	0.15
398	0.14
399	0.2
400	0.22
401	0.28
402	0.36
403	0.36
404	0.39
405	0.47
406	0.45
407	0.4
408	0.42
409	0.44
410	0.4
411	0.38
412	0.35
413	0.26
414	0.25
415	0.26
416	0.21
417	0.13
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.13
424	0.14
425	0.14
426	0.11
427	0.11
428	0.1
429	0.15
430	0.15
431	0.14
432	0.13
433	0.13
434	0.12
435	0.14
436	0.17
437	0.13
438	0.11
439	0.11
440	0.15
441	0.17
442	0.24
443	0.33
444	0.33
445	0.35
446	0.41
447	0.48
448	0.49
449	0.52
450	0.52
451	0.49
452	0.48
453	0.47
454	0.42
455	0.36

A0A2K0W828

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer