Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2K0VTC9

Protein Details
Accession A0A2K0VTC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-382GIGPRKRKATDVFMKPKKRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-382GPRKRKATDVFMKPKKRA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPPKSLLELATAACIKNIRELDSVGDYLPYKAVRLLLLKIDNAKQLRTIELNSPQIQGETGEVWLKLIKHEFPMEVKQKAYKPPNPTKWYRVYEKYRSDHQKALLESEAKLKNALMGLKEDKEKNTSKIVDDRRLLPRGGRVGPKKAWGFGARDPNGSTLAFNRGSRTKTHNGASVMRKVRRETKEIASIHGALSRPTQASNAITKLRKAPAAMVGDYQRAAKPTIRPPLPPPPKSTVSDVVETHEARAQYISDSDSEDGDDLFDDEPPAPRRKASSHVSLSPLKKPAAGHSESTSKVRRTGLLSNSYKGPKPQTTTSSRPRVAPSAGKSLSPAPQQKHISLSPEPTEQSSPTRLTNTRPNPGIGPRKRKATDVFMKPKKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.24
4 0.25
5 0.24
6 0.25
7 0.26
8 0.28
9 0.3
10 0.3
11 0.23
12 0.23
13 0.2
14 0.18
15 0.21
16 0.17
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.19
22 0.21
23 0.24
24 0.27
25 0.28
26 0.31
27 0.33
28 0.36
29 0.35
30 0.34
31 0.31
32 0.3
33 0.32
34 0.3
35 0.3
36 0.29
37 0.35
38 0.4
39 0.38
40 0.38
41 0.34
42 0.31
43 0.29
44 0.23
45 0.17
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.22
58 0.23
59 0.25
60 0.34
61 0.37
62 0.36
63 0.36
64 0.39
65 0.41
66 0.49
67 0.54
68 0.52
69 0.56
70 0.64
71 0.72
72 0.74
73 0.75
74 0.73
75 0.74
76 0.73
77 0.71
78 0.7
79 0.68
80 0.7
81 0.73
82 0.7
83 0.7
84 0.73
85 0.7
86 0.66
87 0.61
88 0.58
89 0.5
90 0.49
91 0.43
92 0.35
93 0.31
94 0.34
95 0.31
96 0.25
97 0.25
98 0.21
99 0.19
100 0.2
101 0.21
102 0.14
103 0.16
104 0.18
105 0.21
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.29
110 0.31
111 0.29
112 0.33
113 0.32
114 0.31
115 0.38
116 0.43
117 0.45
118 0.44
119 0.47
120 0.46
121 0.47
122 0.44
123 0.37
124 0.35
125 0.33
126 0.35
127 0.37
128 0.35
129 0.39
130 0.4
131 0.45
132 0.42
133 0.37
134 0.37
135 0.32
136 0.32
137 0.31
138 0.39
139 0.34
140 0.34
141 0.34
142 0.31
143 0.3
144 0.25
145 0.2
146 0.12
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.17
151 0.19
152 0.21
153 0.23
154 0.29
155 0.29
156 0.32
157 0.34
158 0.35
159 0.35
160 0.39
161 0.4
162 0.41
163 0.42
164 0.41
165 0.42
166 0.4
167 0.46
168 0.44
169 0.45
170 0.41
171 0.39
172 0.44
173 0.42
174 0.42
175 0.34
176 0.31
177 0.27
178 0.24
179 0.2
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.12
188 0.13
189 0.15
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.21
197 0.2
198 0.21
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.2
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.13
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.18
211 0.24
212 0.33
213 0.33
214 0.35
215 0.39
216 0.49
217 0.55
218 0.52
219 0.51
220 0.48
221 0.51
222 0.51
223 0.5
224 0.46
225 0.4
226 0.4
227 0.35
228 0.31
229 0.31
230 0.28
231 0.25
232 0.2
233 0.17
234 0.14
235 0.14
236 0.12
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.12
255 0.16
256 0.2
257 0.2
258 0.21
259 0.25
260 0.27
261 0.34
262 0.34
263 0.4
264 0.41
265 0.44
266 0.48
267 0.51
268 0.51
269 0.49
270 0.48
271 0.39
272 0.36
273 0.33
274 0.34
275 0.35
276 0.34
277 0.32
278 0.31
279 0.36
280 0.35
281 0.39
282 0.38
283 0.33
284 0.34
285 0.33
286 0.33
287 0.33
288 0.39
289 0.4
290 0.45
291 0.46
292 0.45
293 0.49
294 0.49
295 0.46
296 0.43
297 0.43
298 0.39
299 0.42
300 0.46
301 0.48
302 0.53
303 0.6
304 0.65
305 0.68
306 0.64
307 0.62
308 0.6
309 0.57
310 0.54
311 0.53
312 0.48
313 0.48
314 0.46
315 0.43
316 0.4
317 0.39
318 0.4
319 0.4
320 0.43
321 0.36
322 0.45
323 0.49
324 0.49
325 0.51
326 0.48
327 0.45
328 0.42
329 0.44
330 0.39
331 0.39
332 0.38
333 0.35
334 0.35
335 0.32
336 0.33
337 0.32
338 0.31
339 0.3
340 0.36
341 0.35
342 0.38
343 0.47
344 0.5
345 0.54
346 0.54
347 0.53
348 0.51
349 0.59
350 0.64
351 0.63
352 0.65
353 0.63
354 0.7
355 0.7
356 0.71
357 0.68
358 0.68
359 0.68
360 0.69
361 0.74
362 0.74