Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2G627

Protein Details
Accession I2G627    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
326-347GDAPSPQPKKRGRPKKEAAAAVHydrophilic
379-399AGAPPAKKRGRPKKEVDPVAAHydrophilic
428-452TSPSAPPSSGKKRGRPPKEKTEGEEHydrophilic
492-511AASVSPAKKPTGRPKKNPQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-177KRKPGRPPK
251-257KRGRPPK
284-292PAKKRGRPS
333-342PKKRGRPKKE
382-392PPAKKRGRPKK
436-464SGKKRGRPPKEKTEGEEAAKRPRGRPKKA
499-507KKPTGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS50064  ZF_PARP_2  
Amino Acid Sequences MPFRIEYSPSARAGCKGPKPCAGTKIAKGELRLGSLVEIQGNQSFQWRHWGCTTPKIIRNIQEKEGITDPADLDGYDELLDEDKARVARAFIDGHVASDDIPESARIDPKEADNADQAAAAATVLPRPSKASLQASAAGAPPATPPSVPASSVPNGLAAPDAAAGSTPKRKPGRPPKDAAAAAAPAAVPTPSPLPPALTPPVPQPAVADVSPTKKRGRPANSQAATPPPPPQPAAQAPLVPVDTPQPVQKKRGRPPKSAVPAAPALAPVALPASVAPQEHSPPPAKKRGRPSKASLVAAAAEAATAFPAPSQMPVAGQGLPFAIFGDAPSPQPKKRGRPKKEAAAAVQPSPSAQHPIPGSQPAYISPVAPVDPSPAAAAGAPPAKKRGRPKKEVDPVAANAASAASLNRVTTPPLPRATIPPQPAVQTSPSAPPSSGKKRGRPPKEKTEGEEAAKRPRGRPKKADAAAAAAPAPVPQPVAPLAPVPQAAAPAASVSPAKKPTGRPKKNPQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.48
4 0.51
5 0.56
6 0.61
7 0.64
8 0.64
9 0.63
10 0.61
11 0.6
12 0.63
13 0.62
14 0.58
15 0.54
16 0.54
17 0.49
18 0.44
19 0.38
20 0.29
21 0.24
22 0.23
23 0.23
24 0.17
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.14
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.29
34 0.29
35 0.3
36 0.34
37 0.42
38 0.39
39 0.47
40 0.55
41 0.53
42 0.57
43 0.6
44 0.61
45 0.62
46 0.67
47 0.63
48 0.59
49 0.58
50 0.52
51 0.5
52 0.47
53 0.4
54 0.32
55 0.29
56 0.25
57 0.19
58 0.18
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.1
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.16
77 0.17
78 0.14
79 0.2
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.1
92 0.15
93 0.15
94 0.18
95 0.19
96 0.2
97 0.27
98 0.27
99 0.27
100 0.24
101 0.25
102 0.22
103 0.2
104 0.18
105 0.11
106 0.1
107 0.08
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.11
115 0.14
116 0.16
117 0.22
118 0.25
119 0.26
120 0.28
121 0.3
122 0.28
123 0.27
124 0.25
125 0.19
126 0.14
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.19
138 0.2
139 0.21
140 0.2
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.13
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.08
153 0.16
154 0.16
155 0.24
156 0.29
157 0.33
158 0.44
159 0.54
160 0.62
161 0.62
162 0.67
163 0.64
164 0.67
165 0.64
166 0.55
167 0.45
168 0.35
169 0.27
170 0.22
171 0.16
172 0.08
173 0.08
174 0.06
175 0.04
176 0.05
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.16
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.18
188 0.23
189 0.21
190 0.2
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.13
197 0.18
198 0.21
199 0.23
200 0.25
201 0.25
202 0.31
203 0.38
204 0.43
205 0.48
206 0.54
207 0.62
208 0.59
209 0.57
210 0.53
211 0.49
212 0.45
213 0.36
214 0.31
215 0.23
216 0.24
217 0.24
218 0.23
219 0.24
220 0.23
221 0.25
222 0.22
223 0.2
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.13
233 0.19
234 0.21
235 0.29
236 0.35
237 0.43
238 0.51
239 0.61
240 0.63
241 0.62
242 0.66
243 0.69
244 0.69
245 0.63
246 0.55
247 0.47
248 0.42
249 0.36
250 0.3
251 0.2
252 0.13
253 0.09
254 0.08
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.13
268 0.17
269 0.21
270 0.25
271 0.34
272 0.38
273 0.42
274 0.53
275 0.61
276 0.64
277 0.65
278 0.67
279 0.68
280 0.69
281 0.64
282 0.53
283 0.43
284 0.36
285 0.3
286 0.23
287 0.12
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.02
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.13
317 0.16
318 0.18
319 0.27
320 0.33
321 0.43
322 0.53
323 0.63
324 0.66
325 0.73
326 0.8
327 0.82
328 0.83
329 0.77
330 0.69
331 0.67
332 0.61
333 0.51
334 0.43
335 0.33
336 0.25
337 0.22
338 0.2
339 0.15
340 0.13
341 0.16
342 0.16
343 0.19
344 0.21
345 0.23
346 0.23
347 0.2
348 0.2
349 0.17
350 0.2
351 0.18
352 0.16
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.21
371 0.25
372 0.31
373 0.42
374 0.5
375 0.56
376 0.64
377 0.71
378 0.75
379 0.82
380 0.82
381 0.77
382 0.71
383 0.62
384 0.58
385 0.5
386 0.38
387 0.28
388 0.22
389 0.16
390 0.11
391 0.09
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.09
396 0.09
397 0.13
398 0.18
399 0.23
400 0.27
401 0.29
402 0.32
403 0.31
404 0.38
405 0.41
406 0.43
407 0.42
408 0.4
409 0.39
410 0.39
411 0.39
412 0.35
413 0.31
414 0.27
415 0.25
416 0.27
417 0.27
418 0.26
419 0.25
420 0.26
421 0.33
422 0.4
423 0.48
424 0.5
425 0.56
426 0.66
427 0.76
428 0.83
429 0.85
430 0.84
431 0.85
432 0.87
433 0.84
434 0.78
435 0.77
436 0.72
437 0.67
438 0.66
439 0.58
440 0.58
441 0.6
442 0.57
443 0.54
444 0.59
445 0.64
446 0.66
447 0.73
448 0.72
449 0.76
450 0.77
451 0.78
452 0.68
453 0.63
454 0.55
455 0.47
456 0.38
457 0.27
458 0.22
459 0.16
460 0.15
461 0.1
462 0.1
463 0.08
464 0.11
465 0.12
466 0.14
467 0.14
468 0.15
469 0.17
470 0.18
471 0.19
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.14
477 0.12
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.12
482 0.12
483 0.19
484 0.22
485 0.27
486 0.31
487 0.4
488 0.5
489 0.59
490 0.69
491 0.72