Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TM89

Protein Details
Accession A7TM89    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-87PSISARLHHSKKKSSGKNSDSETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
GO:0065008  P:regulation of biological quality  
KEGG vpo:Kpol_520p3  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MEKKQQIQAQGNTLSNIPEVIDPGVTIPIYEEDIKSSGNQNDQQKLGSYRARTGKISNTLSNLLPSISARLHHSKKKSSGKNSDSETQSNGSSDVLVDLRDMQATLPRGKTTITSMSAPGVPLASSSSIISSQELDSLVNFPDATSFFLDQSRNSTDSYALDGFIPQTVSRSRNNTMSSQITSLSSVMQQQTVPASTIWSNNPNSNIVDTNSSHFTNPVPSHYSTTTSHDTISNIDMPDNQIENNPQLMNRTNNVHIFPNSSNYYEHAANSSPNLNTLSVPNSSWANTGGTINRQRATSNASSIYIDATYDQQSQRQRQATFSSTQQPQQPHPPLVADDIDPVSINWVTMDPSVPPINRITNLLPTDTISISNVFSLQQQQAHLINTINLTSTSLATLCSKYGDVVSARTLSGLNMALVEFSSIDASMKAMDDLQGKEVSMMGAQSSVFFAKILPMHQQQVNLPSNKTFLASETANQPLLHEQLYNGSLTFQQQGNLSIPIFNQKQQQQQQQTNINSNFNHSSTHISTNEKELCPFPLPPPTFEARSEELKEMVSTFSCEYDSSRSDYIINNALNNKSSSDTNNFGPLPEHLASKEFDAPKLRELRKNIDADQLSSLEIEQLAMVMLDELPELCSDYIGNTIVQKLFEHSSDIIKDIMLRKTSKYLTSMGVHKNGTWACQKMITMAHSPRQIKLVANGVRDYCTPLFNDQFGNYVIQCVLKFGFPWNNFIFENILSNFWVIVQSRYGARAVRACLEATDIVTKEQTLILSATIVLYADYLTTNSNGTLLVTWFLDTCSLANRYTILASRLVKNIVELACHRLASLTILKMLNYRGDDESKIIILNSIFGNKETEEPTENLRLILSDSNYGHTFVYKILSMATLDPELRSHAVKMVRSILLESTSSHHHHRLMEEVGLSSIVAQSPSATTRHHPTASHSFNQDVANHMRQVSTSSILSNGSRQNGTGSAAAGTSIPTVNVTQAPIQGGSVSGAGYFNYPGMFPGGYNNGGSSSNNVFKGNEDFSSQFDMLTLNNGTILSLPKLSLTNYNSNTSTLDPTKSNTSNGYGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.28
3 0.23
4 0.17
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.14
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.17
21 0.18
22 0.18
23 0.23
24 0.24
25 0.3
26 0.36
27 0.4
28 0.45
29 0.46
30 0.45
31 0.44
32 0.43
33 0.43
34 0.43
35 0.39
36 0.41
37 0.48
38 0.5
39 0.49
40 0.5
41 0.52
42 0.54
43 0.57
44 0.52
45 0.49
46 0.48
47 0.46
48 0.43
49 0.34
50 0.25
51 0.21
52 0.18
53 0.17
54 0.15
55 0.16
56 0.21
57 0.3
58 0.38
59 0.45
60 0.53
61 0.58
62 0.67
63 0.76
64 0.8
65 0.81
66 0.83
67 0.82
68 0.82
69 0.78
70 0.77
71 0.71
72 0.64
73 0.56
74 0.48
75 0.42
76 0.35
77 0.29
78 0.21
79 0.16
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.14
91 0.18
92 0.22
93 0.23
94 0.23
95 0.24
96 0.24
97 0.26
98 0.26
99 0.28
100 0.27
101 0.26
102 0.26
103 0.28
104 0.29
105 0.27
106 0.22
107 0.16
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.09
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.19
136 0.21
137 0.19
138 0.24
139 0.26
140 0.24
141 0.24
142 0.24
143 0.21
144 0.21
145 0.26
146 0.21
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.09
154 0.12
155 0.16
156 0.19
157 0.23
158 0.29
159 0.31
160 0.36
161 0.4
162 0.39
163 0.4
164 0.41
165 0.39
166 0.34
167 0.32
168 0.26
169 0.24
170 0.22
171 0.17
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.12
182 0.14
183 0.14
184 0.18
185 0.2
186 0.24
187 0.25
188 0.27
189 0.29
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.26
194 0.21
195 0.24
196 0.22
197 0.23
198 0.24
199 0.24
200 0.22
201 0.2
202 0.2
203 0.23
204 0.23
205 0.24
206 0.26
207 0.26
208 0.31
209 0.31
210 0.34
211 0.29
212 0.34
213 0.34
214 0.3
215 0.29
216 0.26
217 0.26
218 0.24
219 0.24
220 0.22
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.17
233 0.15
234 0.17
235 0.21
236 0.23
237 0.23
238 0.26
239 0.27
240 0.29
241 0.31
242 0.31
243 0.28
244 0.29
245 0.27
246 0.29
247 0.27
248 0.26
249 0.25
250 0.23
251 0.26
252 0.22
253 0.22
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.18
258 0.19
259 0.15
260 0.15
261 0.17
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.16
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.14
277 0.2
278 0.25
279 0.27
280 0.28
281 0.27
282 0.27
283 0.26
284 0.32
285 0.27
286 0.25
287 0.23
288 0.22
289 0.22
290 0.22
291 0.21
292 0.14
293 0.12
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.14
298 0.15
299 0.19
300 0.25
301 0.3
302 0.37
303 0.41
304 0.39
305 0.39
306 0.44
307 0.43
308 0.39
309 0.38
310 0.38
311 0.34
312 0.37
313 0.39
314 0.37
315 0.37
316 0.44
317 0.45
318 0.39
319 0.37
320 0.34
321 0.31
322 0.3
323 0.27
324 0.18
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.07
339 0.1
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.16
344 0.18
345 0.18
346 0.21
347 0.19
348 0.22
349 0.23
350 0.23
351 0.2
352 0.19
353 0.2
354 0.17
355 0.16
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.07
362 0.08
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.1
400 0.09
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.06
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.07
419 0.09
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.09
427 0.07
428 0.06
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.13
442 0.15
443 0.18
444 0.19
445 0.21
446 0.19
447 0.26
448 0.3
449 0.27
450 0.26
451 0.23
452 0.23
453 0.22
454 0.22
455 0.14
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.12
466 0.13
467 0.12
468 0.09
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.09
477 0.11
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.12
485 0.1
486 0.1
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.19
491 0.22
492 0.3
493 0.36
494 0.44
495 0.45
496 0.49
497 0.53
498 0.56
499 0.54
500 0.53
501 0.49
502 0.44
503 0.37
504 0.35
505 0.31
506 0.24
507 0.22
508 0.16
509 0.19
510 0.18
511 0.22
512 0.2
513 0.21
514 0.21
515 0.26
516 0.29
517 0.24
518 0.23
519 0.2
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.16
524 0.21
525 0.21
526 0.21
527 0.25
528 0.25
529 0.25
530 0.24
531 0.28
532 0.22
533 0.24
534 0.25
535 0.22
536 0.2
537 0.18
538 0.18
539 0.14
540 0.12
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.08
548 0.11
549 0.12
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.14
554 0.15
555 0.16
556 0.18
557 0.17
558 0.16
559 0.17
560 0.18
561 0.17
562 0.17
563 0.16
564 0.12
565 0.13
566 0.14
567 0.16
568 0.18
569 0.17
570 0.21
571 0.2
572 0.19
573 0.18
574 0.16
575 0.17
576 0.16
577 0.15
578 0.12
579 0.13
580 0.13
581 0.15
582 0.2
583 0.15
584 0.16
585 0.21
586 0.21
587 0.25
588 0.33
589 0.35
590 0.35
591 0.38
592 0.43
593 0.45
594 0.47
595 0.43
596 0.42
597 0.39
598 0.35
599 0.32
600 0.26
601 0.2
602 0.16
603 0.15
604 0.08
605 0.07
606 0.06
607 0.04
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.03
615 0.03
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.05
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.06
628 0.08
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.1
633 0.11
634 0.11
635 0.13
636 0.12
637 0.14
638 0.14
639 0.15
640 0.13
641 0.11
642 0.14
643 0.15
644 0.18
645 0.19
646 0.19
647 0.19
648 0.25
649 0.27
650 0.26
651 0.24
652 0.23
653 0.24
654 0.26
655 0.31
656 0.29
657 0.32
658 0.3
659 0.28
660 0.3
661 0.27
662 0.27
663 0.24
664 0.22
665 0.18
666 0.2
667 0.2
668 0.17
669 0.19
670 0.19
671 0.21
672 0.22
673 0.26
674 0.31
675 0.32
676 0.3
677 0.31
678 0.29
679 0.24
680 0.24
681 0.28
682 0.26
683 0.27
684 0.28
685 0.26
686 0.26
687 0.25
688 0.27
689 0.19
690 0.17
691 0.16
692 0.18
693 0.19
694 0.19
695 0.2
696 0.15
697 0.16
698 0.16
699 0.16
700 0.13
701 0.12
702 0.11
703 0.11
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.08
708 0.09
709 0.12
710 0.2
711 0.19
712 0.25
713 0.25
714 0.27
715 0.27
716 0.27
717 0.25
718 0.17
719 0.2
720 0.15
721 0.15
722 0.12
723 0.12
724 0.11
725 0.09
726 0.11
727 0.08
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.1
732 0.12
733 0.13
734 0.12
735 0.14
736 0.17
737 0.17
738 0.19
739 0.2
740 0.18
741 0.17
742 0.18
743 0.16
744 0.14
745 0.15
746 0.13
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.1
751 0.11
752 0.1
753 0.08
754 0.08
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.06
760 0.06
761 0.04
762 0.04
763 0.04
764 0.04
765 0.04
766 0.05
767 0.06
768 0.06
769 0.07
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.08
781 0.08
782 0.07
783 0.07
784 0.1
785 0.12
786 0.12
787 0.12
788 0.13
789 0.13
790 0.14
791 0.16
792 0.13
793 0.17
794 0.19
795 0.22
796 0.23
797 0.24
798 0.22
799 0.21
800 0.24
801 0.19
802 0.19
803 0.17
804 0.21
805 0.21
806 0.21
807 0.2
808 0.16
809 0.16
810 0.17
811 0.2
812 0.15
813 0.17
814 0.18
815 0.18
816 0.2
817 0.21
818 0.21
819 0.18
820 0.21
821 0.19
822 0.21
823 0.22
824 0.22
825 0.22
826 0.18
827 0.18
828 0.14
829 0.13
830 0.11
831 0.12
832 0.11
833 0.12
834 0.12
835 0.12
836 0.14
837 0.13
838 0.16
839 0.16
840 0.18
841 0.18
842 0.19
843 0.23
844 0.26
845 0.25
846 0.22
847 0.2
848 0.18
849 0.17
850 0.19
851 0.16
852 0.16
853 0.17
854 0.2
855 0.21
856 0.22
857 0.2
858 0.17
859 0.16
860 0.12
861 0.14
862 0.11
863 0.1
864 0.1
865 0.11
866 0.11
867 0.11
868 0.12
869 0.12
870 0.12
871 0.12
872 0.12
873 0.14
874 0.15
875 0.15
876 0.14
877 0.17
878 0.22
879 0.23
880 0.25
881 0.27
882 0.27
883 0.27
884 0.27
885 0.23
886 0.21
887 0.2
888 0.18
889 0.15
890 0.19
891 0.22
892 0.24
893 0.27
894 0.28
895 0.3
896 0.31
897 0.33
898 0.3
899 0.29
900 0.26
901 0.23
902 0.2
903 0.17
904 0.15
905 0.11
906 0.09
907 0.07
908 0.07
909 0.06
910 0.06
911 0.08
912 0.1
913 0.12
914 0.13
915 0.17
916 0.24
917 0.3
918 0.32
919 0.32
920 0.37
921 0.46
922 0.51
923 0.52
924 0.47
925 0.42
926 0.42
927 0.44
928 0.38
929 0.32
930 0.32
931 0.31
932 0.3
933 0.3
934 0.27
935 0.24
936 0.26
937 0.24
938 0.21
939 0.17
940 0.16
941 0.17
942 0.19
943 0.2
944 0.22
945 0.24
946 0.24
947 0.24
948 0.24
949 0.25
950 0.24
951 0.26
952 0.21
953 0.18
954 0.14
955 0.13
956 0.13
957 0.11
958 0.1
959 0.09
960 0.08
961 0.08
962 0.08
963 0.09
964 0.11
965 0.12
966 0.14
967 0.14
968 0.16
969 0.18
970 0.16
971 0.16
972 0.14
973 0.13
974 0.12
975 0.11
976 0.09
977 0.07
978 0.07
979 0.08
980 0.09
981 0.08
982 0.08
983 0.08
984 0.08
985 0.08
986 0.11
987 0.1
988 0.09
989 0.14
990 0.18
991 0.18
992 0.19
993 0.18
994 0.18
995 0.19
996 0.19
997 0.19
998 0.21
999 0.25
1000 0.27
1001 0.28
1002 0.26
1003 0.27
1004 0.33
1005 0.31
1006 0.26
1007 0.26
1008 0.25
1009 0.26
1010 0.33
1011 0.3
1012 0.24
1013 0.21
1014 0.21
1015 0.16
1016 0.2
1017 0.18
1018 0.11
1019 0.12
1020 0.12
1021 0.11
1022 0.12
1023 0.15
1024 0.13
1025 0.13
1026 0.14
1027 0.15
1028 0.16
1029 0.18
1030 0.24
1031 0.27
1032 0.35
1033 0.37
1034 0.42
1035 0.42
1036 0.41
1037 0.42
1038 0.36
1039 0.38
1040 0.31
1041 0.32
1042 0.28
1043 0.31
1044 0.39
1045 0.39
1046 0.39
1047 0.35