Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3ALE6

Protein Details
Accession G3ALE6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-435LSQNNCIIPRRKSRRRSSRVSFKNDKELTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-425RRKSRRRSSR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG spaa:SPAPADRAFT_71074  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MVSFNQSLDTSLQLLYDYSSNFQISVELVQKLAQHLKLETFIDTSFQFGNVEGNNQQRLTIAASSILLDIDFENDRKVSNISLSIGNESTHTTENSKEYIESVQNNHGITVIKLNPNKNPLTFLKKSSDEKSIAEKILLANLSQPKLNKFPENLQYLAIIDKYANSNQDLFTYIERTALLLHTISQLEIERNPNNWQIEQGLNNAIGNVKIHDITQGKIGLFLEFWKDFRYINHESNTAIGNTYNVQFNIVSSSYNHEYLLENNKKEWEIANQGNKERVKFEFEDAVIPTVNNDGTNTTMLPWMFDLVLNHPIYVPKYILEYLGLDYTVEENTTDPLFKIFDKINNSQEVVDSINILGRNVSCLINHDLISNFIPLKSVKINHLYDLSSLIPILRNFIVLSNLYRTLSQNNCIIPRRKSRRRSSRVSFKNDKELTEEIRKKLKDSLKLPDDVTDEELLGLNAISETATYSTIQPINDMFDLESFIKNDQTTTSKENYFQVSLDDIDVTSNDLYLTVEAYSDIKEIYIRFKISNGQIQLLQDDIDENNAKFIKTLDLTEDFVVSITSVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.15
10 0.15
11 0.13
12 0.17
13 0.18
14 0.16
15 0.16
16 0.18
17 0.2
18 0.23
19 0.28
20 0.26
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.29
25 0.29
26 0.26
27 0.22
28 0.2
29 0.2
30 0.18
31 0.18
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.15
37 0.14
38 0.17
39 0.19
40 0.24
41 0.27
42 0.26
43 0.26
44 0.22
45 0.23
46 0.23
47 0.2
48 0.15
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.12
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.09
58 0.11
59 0.1
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.16
68 0.17
69 0.2
70 0.21
71 0.22
72 0.22
73 0.2
74 0.19
75 0.18
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.18
81 0.21
82 0.22
83 0.21
84 0.18
85 0.18
86 0.21
87 0.24
88 0.24
89 0.25
90 0.29
91 0.31
92 0.31
93 0.29
94 0.27
95 0.23
96 0.2
97 0.23
98 0.22
99 0.26
100 0.3
101 0.33
102 0.36
103 0.41
104 0.44
105 0.38
106 0.39
107 0.37
108 0.42
109 0.42
110 0.42
111 0.43
112 0.46
113 0.5
114 0.48
115 0.49
116 0.43
117 0.42
118 0.45
119 0.43
120 0.38
121 0.33
122 0.3
123 0.24
124 0.25
125 0.23
126 0.16
127 0.16
128 0.2
129 0.21
130 0.22
131 0.23
132 0.23
133 0.29
134 0.32
135 0.32
136 0.3
137 0.37
138 0.42
139 0.45
140 0.42
141 0.36
142 0.33
143 0.29
144 0.27
145 0.2
146 0.12
147 0.08
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.12
176 0.16
177 0.16
178 0.18
179 0.21
180 0.25
181 0.26
182 0.25
183 0.23
184 0.21
185 0.22
186 0.21
187 0.2
188 0.17
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.16
203 0.17
204 0.16
205 0.17
206 0.17
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.2
218 0.21
219 0.25
220 0.27
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.26
225 0.19
226 0.14
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.13
245 0.13
246 0.16
247 0.26
248 0.26
249 0.24
250 0.25
251 0.26
252 0.25
253 0.25
254 0.23
255 0.16
256 0.18
257 0.23
258 0.29
259 0.3
260 0.31
261 0.36
262 0.36
263 0.33
264 0.29
265 0.25
266 0.23
267 0.22
268 0.22
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.13
275 0.12
276 0.1
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.15
329 0.21
330 0.25
331 0.27
332 0.28
333 0.29
334 0.27
335 0.25
336 0.22
337 0.17
338 0.13
339 0.1
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.1
349 0.08
350 0.11
351 0.15
352 0.17
353 0.17
354 0.16
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.15
359 0.12
360 0.1
361 0.11
362 0.1
363 0.13
364 0.15
365 0.16
366 0.18
367 0.25
368 0.26
369 0.27
370 0.29
371 0.26
372 0.23
373 0.24
374 0.2
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.13
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.13
386 0.11
387 0.13
388 0.13
389 0.15
390 0.15
391 0.16
392 0.16
393 0.21
394 0.22
395 0.23
396 0.24
397 0.26
398 0.31
399 0.36
400 0.41
401 0.41
402 0.5
403 0.58
404 0.64
405 0.71
406 0.77
407 0.82
408 0.85
409 0.88
410 0.88
411 0.88
412 0.87
413 0.87
414 0.85
415 0.78
416 0.8
417 0.72
418 0.63
419 0.56
420 0.5
421 0.47
422 0.48
423 0.49
424 0.43
425 0.49
426 0.48
427 0.46
428 0.51
429 0.51
430 0.5
431 0.49
432 0.55
433 0.52
434 0.55
435 0.54
436 0.49
437 0.45
438 0.37
439 0.35
440 0.25
441 0.2
442 0.17
443 0.16
444 0.12
445 0.1
446 0.08
447 0.05
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.05
453 0.05
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.13
458 0.16
459 0.16
460 0.16
461 0.16
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.14
466 0.12
467 0.15
468 0.15
469 0.16
470 0.14
471 0.14
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.17
476 0.19
477 0.21
478 0.26
479 0.3
480 0.3
481 0.32
482 0.35
483 0.36
484 0.34
485 0.3
486 0.27
487 0.24
488 0.22
489 0.2
490 0.17
491 0.12
492 0.12
493 0.11
494 0.12
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.08
500 0.07
501 0.08
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.1
511 0.11
512 0.17
513 0.21
514 0.22
515 0.23
516 0.25
517 0.32
518 0.36
519 0.43
520 0.39
521 0.37
522 0.37
523 0.38
524 0.37
525 0.3
526 0.24
527 0.16
528 0.15
529 0.12
530 0.15
531 0.17
532 0.16
533 0.21
534 0.22
535 0.22
536 0.2
537 0.21
538 0.23
539 0.22
540 0.23
541 0.24
542 0.26
543 0.28
544 0.29
545 0.28
546 0.21
547 0.19
548 0.17