Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2FPA8

Protein Details
Accession I2FPA8    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-55VAEKRRAKETASPTKRKRDDEPBasic
75-97EEVLSHKEQRRRKKAAKLSSSSEHydrophilic
308-340HSATKRNPPKASKKERKQKSKKPTKKSSCSSSSHydrophilic
514-536DPNAPLPKKHKETKEERMARRAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-50EKRRAKETASPTKRK
84-90RRRKKAA
312-333KRNPPKASKKERKQKSKKPTKK
520-550PKKHKETKEERMARRAAGGARGREKVTRARP
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDTEATRTSTTTLPTGEAVDRPLTNKEKRQLAVAEKRRAKETASPTKRKRDDEPSSSAPTNPSNPSDPSGEGQEEVLSHKEQRRRKKAAKLSSSSEPSCTSDPSNPTANDLLHPSRSAGGPASQPRSGCSIWIGNLSFFTAPAKLVDWFNSRGVDGISRVNMPKGQRRAEMNRGFCYLDLPSKDILTAALNLSEQPLDGRKLLIKDASDFTGRPDINSSALGIARTLPNATQSMHSNKQDPDEGGGEEGEDEGDQGKEKSQVKGKTGLTKTAQKILRAQKNPPSMTLFLGNLSFNTTEQGVRELFDHSATKRNPPKASKKERKQKSKKPTKKSSCSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDSDSDSDSDSDSDLDLDEEEKKQPAQGEVVPSSAGIRKVRLGTFEDAPTKCKGFGFLDFHTVEQATASLLDPRNTLLDGRKIILQYASADATRRGASKIQKTLIANRRPNELRVGFQRKNQMPRRAEGETSNRCTRRGSKGEGEEEEEKEAPVPGTFDPNAPLPKKHKETKEERMARRAAGGARGREKVTRARPGAALANAQRASVAVVQSTGTKVTFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.22
5 0.21
6 0.22
7 0.22
8 0.22
9 0.23
10 0.3
11 0.35
12 0.4
13 0.47
14 0.52
15 0.56
16 0.56
17 0.6
18 0.6
19 0.62
20 0.65
21 0.66
22 0.69
23 0.68
24 0.7
25 0.68
26 0.62
27 0.56
28 0.54
29 0.54
30 0.55
31 0.59
32 0.67
33 0.71
34 0.81
35 0.84
36 0.8
37 0.78
38 0.78
39 0.77
40 0.74
41 0.74
42 0.7
43 0.69
44 0.65
45 0.58
46 0.5
47 0.45
48 0.42
49 0.38
50 0.36
51 0.33
52 0.34
53 0.35
54 0.35
55 0.33
56 0.3
57 0.3
58 0.27
59 0.24
60 0.21
61 0.19
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.14
66 0.19
67 0.25
68 0.32
69 0.4
70 0.5
71 0.59
72 0.66
73 0.74
74 0.79
75 0.83
76 0.86
77 0.88
78 0.83
79 0.79
80 0.77
81 0.75
82 0.65
83 0.57
84 0.49
85 0.42
86 0.38
87 0.34
88 0.29
89 0.28
90 0.31
91 0.32
92 0.36
93 0.32
94 0.34
95 0.34
96 0.32
97 0.27
98 0.29
99 0.29
100 0.24
101 0.24
102 0.22
103 0.21
104 0.2
105 0.2
106 0.16
107 0.15
108 0.2
109 0.26
110 0.3
111 0.3
112 0.3
113 0.3
114 0.33
115 0.31
116 0.25
117 0.22
118 0.2
119 0.19
120 0.24
121 0.23
122 0.18
123 0.18
124 0.19
125 0.16
126 0.13
127 0.13
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.15
135 0.18
136 0.2
137 0.22
138 0.22
139 0.2
140 0.19
141 0.19
142 0.16
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.19
150 0.21
151 0.28
152 0.33
153 0.36
154 0.38
155 0.44
156 0.5
157 0.57
158 0.61
159 0.57
160 0.52
161 0.51
162 0.47
163 0.39
164 0.34
165 0.25
166 0.22
167 0.19
168 0.19
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.11
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.17
192 0.15
193 0.16
194 0.18
195 0.19
196 0.18
197 0.16
198 0.17
199 0.23
200 0.22
201 0.19
202 0.2
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.14
221 0.2
222 0.26
223 0.27
224 0.29
225 0.29
226 0.3
227 0.31
228 0.27
229 0.24
230 0.19
231 0.18
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.08
236 0.08
237 0.05
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.12
246 0.14
247 0.17
248 0.24
249 0.28
250 0.3
251 0.37
252 0.38
253 0.41
254 0.41
255 0.42
256 0.39
257 0.42
258 0.41
259 0.41
260 0.41
261 0.33
262 0.4
263 0.44
264 0.49
265 0.45
266 0.47
267 0.47
268 0.53
269 0.52
270 0.46
271 0.41
272 0.33
273 0.31
274 0.29
275 0.22
276 0.14
277 0.15
278 0.13
279 0.09
280 0.1
281 0.09
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.12
295 0.11
296 0.18
297 0.19
298 0.26
299 0.32
300 0.38
301 0.42
302 0.48
303 0.58
304 0.61
305 0.72
306 0.74
307 0.78
308 0.82
309 0.86
310 0.9
311 0.9
312 0.9
313 0.9
314 0.91
315 0.9
316 0.91
317 0.92
318 0.91
319 0.9
320 0.86
321 0.83
322 0.78
323 0.73
324 0.66
325 0.59
326 0.52
327 0.44
328 0.39
329 0.32
330 0.26
331 0.22
332 0.19
333 0.16
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.16
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.19
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.18
378 0.14
379 0.14
380 0.17
381 0.2
382 0.21
383 0.22
384 0.24
385 0.24
386 0.26
387 0.28
388 0.32
389 0.29
390 0.31
391 0.3
392 0.27
393 0.25
394 0.22
395 0.22
396 0.18
397 0.24
398 0.27
399 0.26
400 0.31
401 0.3
402 0.3
403 0.28
404 0.26
405 0.19
406 0.13
407 0.12
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.11
412 0.12
413 0.14
414 0.14
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.17
419 0.15
420 0.19
421 0.2
422 0.21
423 0.23
424 0.22
425 0.23
426 0.22
427 0.19
428 0.14
429 0.15
430 0.15
431 0.13
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.15
438 0.2
439 0.27
440 0.34
441 0.41
442 0.41
443 0.45
444 0.46
445 0.55
446 0.59
447 0.61
448 0.59
449 0.54
450 0.61
451 0.57
452 0.57
453 0.55
454 0.48
455 0.43
456 0.47
457 0.55
458 0.49
459 0.51
460 0.6
461 0.58
462 0.66
463 0.7
464 0.69
465 0.63
466 0.65
467 0.66
468 0.6
469 0.55
470 0.52
471 0.53
472 0.52
473 0.55
474 0.6
475 0.55
476 0.52
477 0.55
478 0.54
479 0.55
480 0.53
481 0.53
482 0.53
483 0.6
484 0.65
485 0.62
486 0.62
487 0.55
488 0.5
489 0.46
490 0.37
491 0.29
492 0.23
493 0.22
494 0.17
495 0.13
496 0.14
497 0.11
498 0.17
499 0.18
500 0.18
501 0.19
502 0.23
503 0.31
504 0.31
505 0.37
506 0.38
507 0.47
508 0.55
509 0.61
510 0.65
511 0.68
512 0.75
513 0.79
514 0.83
515 0.84
516 0.82
517 0.81
518 0.75
519 0.66
520 0.6
521 0.54
522 0.45
523 0.44
524 0.44
525 0.43
526 0.45
527 0.48
528 0.47
529 0.46
530 0.47
531 0.48
532 0.51
533 0.53
534 0.51
535 0.52
536 0.51
537 0.52
538 0.53
539 0.46
540 0.44
541 0.37
542 0.42
543 0.38
544 0.36
545 0.32
546 0.26
547 0.26
548 0.22
549 0.2
550 0.12
551 0.13
552 0.14
553 0.15
554 0.17
555 0.15
556 0.12