FuNGI

I2FR00

Protein Details

Accession

I2FR00

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-107	SGVRMQFRPVRPQRRKASESP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
134-148	GGRGRGRGRGGARPP
255-268	KKDKQKVANARQKK

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 14.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDPSQQPSGSSSGKANDGAPSTRSTNHTAPVAARPFRGMASLQGVGSLRGGPGRGAPVSSSASMVPSRSSYASPAPGVPGSAGPGSGVRMQFRPVRPQRRKASESPAPQSSTAAESPSVSPLSTPHGASSAPGGRGRGRGRGGARPPRQAVQMTASGPFALGPSLRPTGKKVAPVGPGGSSFTPIGSADSSRGNTPAKTDPDRASYRNPDKLKDAEQYSDPEDGGVEIVDMDEVHGLDELAPRALPRVVEKESKKDKQKVANARQKKMEGRILKDERDANPTAGVRVKSEDDALGELDPSVTTGLNGSGTSTIISSESVTPQPEEDSKVNTADALDLSESEGEELMDDLVDDFVFHDDDDVNPENRLYLFQFPQLFPKFKASKTSSTSTTTAADAPSTATDAESTSAASKRRSVSFAEGTTGGAGQARPSIAVKDEAPSSSEVEDESDADSEEDDKKRDTKSAGSSKADGLVGKLDVYRDGRVFLRFGELVMEVTGGSQSTFLQQVMLLDPNNRTATALGELHRKFIVSPELDCMLNDISLYGEEKRFEEERKRQEEEAKAEAERVKYGASAAGFGFISGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.27
4	0.26
5	0.28
6	0.28
7	0.26
8	0.27
9	0.27
10	0.31
11	0.33
12	0.36
13	0.35
14	0.37
15	0.38
16	0.36
17	0.35
18	0.39
19	0.43
20	0.39
21	0.37
22	0.35
23	0.33
24	0.32
25	0.31
26	0.23
27	0.19
28	0.22
29	0.23
30	0.2
31	0.22
32	0.22
33	0.2
34	0.2
35	0.16
36	0.11
37	0.11
38	0.12
39	0.1
40	0.12
41	0.15
42	0.15
43	0.15
44	0.15
45	0.18
46	0.2
47	0.2
48	0.19
49	0.15
50	0.18
51	0.18
52	0.18
53	0.16
54	0.14
55	0.17
56	0.17
57	0.18
58	0.19
59	0.23
60	0.26
61	0.25
62	0.25
63	0.25
64	0.23
65	0.23
66	0.2
67	0.16
68	0.14
69	0.13
70	0.12
71	0.09
72	0.1
73	0.12
74	0.15
75	0.16
76	0.16
77	0.17
78	0.21
79	0.28
80	0.31
81	0.4
82	0.46
83	0.56
84	0.63
85	0.72
86	0.79
87	0.81
88	0.84
89	0.8
90	0.79
91	0.77
92	0.76
93	0.72
94	0.67
95	0.6
96	0.54
97	0.48
98	0.39
99	0.35
100	0.27
101	0.22
102	0.17
103	0.16
104	0.16
105	0.18
106	0.17
107	0.13
108	0.12
109	0.12
110	0.17
111	0.18
112	0.18
113	0.15
114	0.16
115	0.16
116	0.16
117	0.2
118	0.19
119	0.19
120	0.2
121	0.22
122	0.23
123	0.3
124	0.32
125	0.33
126	0.31
127	0.34
128	0.36
129	0.43
130	0.5
131	0.54
132	0.57
133	0.58
134	0.59
135	0.55
136	0.55
137	0.48
138	0.41
139	0.35
140	0.34
141	0.27
142	0.25
143	0.23
144	0.19
145	0.17
146	0.15
147	0.11
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.1
152	0.14
153	0.15
154	0.16
155	0.2
156	0.27
157	0.3
158	0.33
159	0.33
160	0.36
161	0.38
162	0.38
163	0.36
164	0.29
165	0.27
166	0.25
167	0.21
168	0.16
169	0.13
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.18
184	0.23
185	0.26
186	0.3
187	0.34
188	0.33
189	0.39
190	0.43
191	0.42
192	0.42
193	0.46
194	0.48
195	0.52
196	0.51
197	0.47
198	0.47
199	0.48
200	0.45
201	0.41
202	0.37
203	0.31
204	0.31
205	0.31
206	0.29
207	0.27
208	0.22
209	0.16
210	0.14
211	0.11
212	0.1
213	0.07
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.13
236	0.16
237	0.24
238	0.26
239	0.34
240	0.42
241	0.49
242	0.55
243	0.57
244	0.6
245	0.62
246	0.69
247	0.7
248	0.72
249	0.75
250	0.75
251	0.71
252	0.69
253	0.65
254	0.6
255	0.54
256	0.51
257	0.45
258	0.42
259	0.48
260	0.47
261	0.44
262	0.44
263	0.42
264	0.36
265	0.37
266	0.33
267	0.24
268	0.23
269	0.21
270	0.2
271	0.19
272	0.18
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.12
277	0.13
278	0.12
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.03
290	0.03
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.06
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.11
311	0.11
312	0.14
313	0.13
314	0.15
315	0.16
316	0.16
317	0.16
318	0.14
319	0.13
320	0.1
321	0.09
322	0.07
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.1
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.13
355	0.11
356	0.13
357	0.13
358	0.17
359	0.21
360	0.2
361	0.28
362	0.31
363	0.31
364	0.28
365	0.36
366	0.36
367	0.34
368	0.43
369	0.4
370	0.43
371	0.46
372	0.48
373	0.43
374	0.44
375	0.44
376	0.37
377	0.33
378	0.27
379	0.22
380	0.19
381	0.15
382	0.11
383	0.1
384	0.09
385	0.08
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.09
394	0.12
395	0.14
396	0.15
397	0.19
398	0.22
399	0.25
400	0.26
401	0.27
402	0.31
403	0.34
404	0.33
405	0.31
406	0.28
407	0.25
408	0.23
409	0.2
410	0.13
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.1
419	0.1
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.15
424	0.14
425	0.15
426	0.15
427	0.16
428	0.13
429	0.13
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.14
441	0.15
442	0.16
443	0.18
444	0.21
445	0.23
446	0.27
447	0.27
448	0.29
449	0.37
450	0.45
451	0.5
452	0.5
453	0.5
454	0.47
455	0.47
456	0.42
457	0.32
458	0.23
459	0.18
460	0.15
461	0.14
462	0.14
463	0.11
464	0.14
465	0.16
466	0.18
467	0.16
468	0.18
469	0.2
470	0.21
471	0.21
472	0.18
473	0.21
474	0.18
475	0.17
476	0.17
477	0.15
478	0.14
479	0.14
480	0.13
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.06
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.07
489	0.09
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.11
494	0.13
495	0.15
496	0.14
497	0.16
498	0.17
499	0.22
500	0.23
501	0.21
502	0.2
503	0.17
504	0.19
505	0.2
506	0.22
507	0.19
508	0.27
509	0.28
510	0.29
511	0.29
512	0.27
513	0.23
514	0.24
515	0.3
516	0.24
517	0.25
518	0.27
519	0.29
520	0.29
521	0.28
522	0.26
523	0.19
524	0.16
525	0.15
526	0.1
527	0.09
528	0.1
529	0.12
530	0.13
531	0.14
532	0.16
533	0.17
534	0.22
535	0.25
536	0.3
537	0.38
538	0.45
539	0.53
540	0.6
541	0.64
542	0.63
543	0.68
544	0.7
545	0.66
546	0.62
547	0.55
548	0.48
549	0.47
550	0.46
551	0.4
552	0.33
553	0.28
554	0.23
555	0.19
556	0.2
557	0.19
558	0.15
559	0.15
560	0.14
561	0.15
562	0.14

I2FR00

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer