FuNGI

I2G465

Protein Details

Accession

I2G465

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-102	AGAGAKQPKKQVKKEVAVKKAA	Hydrophilic
377-403	AVEAKLGKKEKSKKKSRKGKGGAEGIV	Basic
452-482	NEAKAKAKSPPSQQQQQRKKGGSKDKPSSAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
86-96	KQPKKQVKKEV
330-343	KRESVARLKKANKA
381-400	KLGKKEKSKKKSRKGKGGAE
435-445	APKAPKKMAKQ
454-462	AKAKAKSPP
469-474	RKKGGS

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.833, nucl 10.5, mito_nucl 9.166, cyto 9, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSRPEPGCPMVAAAGDPQTLKVKAKEPVRAAATQDKATGNKAKAQQNRERGAQNRTQKNVRFIQDKSRPSSSKASSSTSAAGAGAKQPKKQVKKEVAVKKAAGQAQGKAQAQTQFKSKVVVRRLPPNLPEQVFWKAVSPWVRDAADCQAITSSSDGAEASSSTLPAPTPATPTVDFKSFIRGKLKSDSNKQNKLARAYIRFLDPTSLVTFHKNFDGHIFRDAKGKGSVSIVEFAPYQKVVLSPSTTGAGVGRGRRMKPDPKQGSIEKDADYLAFVEKLENVEDQGVKRSEGDLLASLWDPKEKVREREEQVEKGKMTPLLEHLRAVKMAKRESVARLKKANKAANKAVGKTTTTQAVPSASANMAASKGKAAETGIAVEAKLGKKEKSKKKSRKGKGGAEGIVVAEGGAGKKPSIAPKQADGQGVVQGSAAAKQAPKAPKKMAKQSQAAAVNEAKAKAKSPPSQQQQQRKKGGSKDKPSSAATTSATPAPTPTALGKMQILKRDT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.14
4	0.15
5	0.19
6	0.21
7	0.23
8	0.26
9	0.3
10	0.36
11	0.42
12	0.49
13	0.48
14	0.53
15	0.54
16	0.52
17	0.52
18	0.54
19	0.51
20	0.44
21	0.44
22	0.39
23	0.36
24	0.39
25	0.42
26	0.35
27	0.38
28	0.44
29	0.49
30	0.54
31	0.62
32	0.66
33	0.68
34	0.71
35	0.7
36	0.7
37	0.66
38	0.66
39	0.66
40	0.66
41	0.65
42	0.67
43	0.7
44	0.68
45	0.7
46	0.7
47	0.68
48	0.64
49	0.58
50	0.62
51	0.62
52	0.63
53	0.62
54	0.63
55	0.58
56	0.57
57	0.64
58	0.57
59	0.57
60	0.54
61	0.53
62	0.46
63	0.47
64	0.43
65	0.34
66	0.3
67	0.22
68	0.19
69	0.14
70	0.18
71	0.25
72	0.26
73	0.28
74	0.36
75	0.45
76	0.54
77	0.61
78	0.65
79	0.66
80	0.73
81	0.81
82	0.82
83	0.8
84	0.77
85	0.69
86	0.64
87	0.6
88	0.53
89	0.49
90	0.41
91	0.36
92	0.36
93	0.42
94	0.38
95	0.32
96	0.32
97	0.33
98	0.34
99	0.34
100	0.35
101	0.32
102	0.31
103	0.35
104	0.36
105	0.38
106	0.43
107	0.48
108	0.46
109	0.52
110	0.57
111	0.57
112	0.56
113	0.53
114	0.52
115	0.46
116	0.43
117	0.37
118	0.36
119	0.33
120	0.3
121	0.26
122	0.2
123	0.23
124	0.27
125	0.26
126	0.24
127	0.27
128	0.27
129	0.25
130	0.27
131	0.27
132	0.26
133	0.23
134	0.21
135	0.17
136	0.17
137	0.18
138	0.16
139	0.11
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.08
153	0.1
154	0.09
155	0.12
156	0.13
157	0.17
158	0.18
159	0.21
160	0.22
161	0.22
162	0.22
163	0.19
164	0.27
165	0.26
166	0.29
167	0.32
168	0.31
169	0.32
170	0.39
171	0.46
172	0.43
173	0.5
174	0.57
175	0.6
176	0.67
177	0.68
178	0.67
179	0.64
180	0.62
181	0.58
182	0.53
183	0.48
184	0.43
185	0.4
186	0.36
187	0.32
188	0.28
189	0.24
190	0.18
191	0.15
192	0.14
193	0.14
194	0.13
195	0.15
196	0.16
197	0.15
198	0.18
199	0.16
200	0.15
201	0.19
202	0.22
203	0.2
204	0.25
205	0.26
206	0.24
207	0.3
208	0.29
209	0.26
210	0.24
211	0.24
212	0.18
213	0.17
214	0.18
215	0.13
216	0.15
217	0.12
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.15
239	0.17
240	0.18
241	0.22
242	0.27
243	0.33
244	0.38
245	0.48
246	0.48
247	0.49
248	0.54
249	0.52
250	0.52
251	0.49
252	0.44
253	0.33
254	0.29
255	0.25
256	0.2
257	0.17
258	0.12
259	0.08
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.12
277	0.11
278	0.12
279	0.08
280	0.07
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.17
289	0.21
290	0.27
291	0.32
292	0.4
293	0.43
294	0.53
295	0.57
296	0.54
297	0.54
298	0.52
299	0.47
300	0.4
301	0.38
302	0.3
303	0.25
304	0.2
305	0.22
306	0.23
307	0.23
308	0.23
309	0.23
310	0.22
311	0.23
312	0.23
313	0.21
314	0.21
315	0.22
316	0.23
317	0.23
318	0.25
319	0.3
320	0.39
321	0.42
322	0.42
323	0.48
324	0.51
325	0.56
326	0.62
327	0.62
328	0.58
329	0.59
330	0.59
331	0.6
332	0.58
333	0.53
334	0.48
335	0.43
336	0.38
337	0.33
338	0.3
339	0.25
340	0.21
341	0.2
342	0.18
343	0.17
344	0.16
345	0.14
346	0.15
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.1
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.13
367	0.13
368	0.16
369	0.17
370	0.2
371	0.29
372	0.39
373	0.5
374	0.57
375	0.67
376	0.74
377	0.82
378	0.9
379	0.92
380	0.93
381	0.91
382	0.9
383	0.88
384	0.85
385	0.76
386	0.66
387	0.56
388	0.44
389	0.34
390	0.24
391	0.15
392	0.07
393	0.06
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.08
399	0.11
400	0.2
401	0.26
402	0.32
403	0.34
404	0.38
405	0.45
406	0.48
407	0.47
408	0.41
409	0.35
410	0.32
411	0.29
412	0.25
413	0.17
414	0.14
415	0.12
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.1
420	0.12
421	0.19
422	0.28
423	0.34
424	0.39
425	0.47
426	0.54
427	0.63
428	0.72
429	0.74
430	0.74
431	0.74
432	0.71
433	0.7
434	0.68
435	0.6
436	0.53
437	0.46
438	0.41
439	0.36
440	0.35
441	0.3
442	0.24
443	0.24
444	0.27
445	0.34
446	0.38
447	0.45
448	0.54
449	0.59
450	0.69
451	0.77
452	0.81
453	0.83
454	0.86
455	0.86
456	0.84
457	0.83
458	0.83
459	0.84
460	0.84
461	0.84
462	0.83
463	0.81
464	0.78
465	0.73
466	0.68
467	0.59
468	0.53
469	0.45
470	0.38
471	0.34
472	0.31
473	0.29
474	0.25
475	0.23
476	0.22
477	0.2
478	0.2
479	0.19
480	0.21
481	0.21
482	0.23
483	0.26
484	0.31
485	0.35

I2G465

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer