Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R427

Protein Details
Accession C4R427    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-187SYNLRAESKKYRKAARRINLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, cyto 4, mito 3, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR010908  Longin_dom  
IPR044565  Sec22  
IPR042855  V_SNARE_CC  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0012507  C:ER to Golgi transport vesicle membrane  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0031201  C:SNARE complex  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
GO:0048280  P:vesicle fusion with Golgi apparatus  
KEGG ppa:PAS_chr3_0274  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13774  Longin  
PF00957  Synaptobrevin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50859  LONGIN  
PS50892  V_SNARE  
CDD cd14824  Longin  
cd15866  R-SNARE_SEC22  
Amino Acid Sequences MVKSTLIFRNDGLPLSATVDDDQTQNLTEQKNQAKAIVNKVNSNSATEASIRSGNYTIHYLLRESIVFLVIVDKSFSRNLAFAYLQEIANEFINSHGNAALRSDTRPYQFVSFDSFMSKTKKLYQDSRTQSNLDHLNNELSDVKRIMTKNIEDLLYRGESLDDMSDLSYNLRAESKKYRKAARRINLEALIKQYVPVAMVGIFFVFIIWWIFLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.2
4 0.15
5 0.15
6 0.16
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.16
14 0.16
15 0.18
16 0.26
17 0.31
18 0.36
19 0.35
20 0.38
21 0.42
22 0.45
23 0.5
24 0.5
25 0.47
26 0.45
27 0.46
28 0.48
29 0.4
30 0.39
31 0.31
32 0.24
33 0.23
34 0.2
35 0.19
36 0.15
37 0.17
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.15
43 0.17
44 0.16
45 0.15
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.1
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.07
79 0.06
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.09
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.18
99 0.17
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.2
105 0.21
106 0.17
107 0.23
108 0.29
109 0.32
110 0.39
111 0.41
112 0.47
113 0.52
114 0.56
115 0.52
116 0.46
117 0.42
118 0.4
119 0.4
120 0.31
121 0.26
122 0.21
123 0.2
124 0.19
125 0.2
126 0.18
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.16
132 0.17
133 0.19
134 0.21
135 0.21
136 0.23
137 0.25
138 0.26
139 0.21
140 0.22
141 0.22
142 0.18
143 0.16
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.13
159 0.14
160 0.18
161 0.29
162 0.38
163 0.44
164 0.51
165 0.6
166 0.65
167 0.75
168 0.81
169 0.79
170 0.8
171 0.77
172 0.77
173 0.74
174 0.68
175 0.6
176 0.53
177 0.46
178 0.36
179 0.3
180 0.24
181 0.18
182 0.15
183 0.13
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06