FuNGI

A0A2J6RS16

Protein Details

Accession

A0A2J6RS16

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
438-458	AKAKRDRKARTTASKKKDVKP	Basic
589-608	GADGKPKKEEEKRKRDEVVH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-23	KGARGAGRGRGRGRGKASAP
114-188	ASRGARVKATESRFKPKNIRRDARELEDLRKKEQARLAAIAAEEAGRAAWKARAGMGRGWGMRGRGDAMGRGAGR
298-320	RKVPKPKGKSSNKGGLKPVRLHR
439-454	KAKRDRKARTTASKKK
535-552	PKPKAKAEIRAEKEKEKA
593-602	KPKKEEEKRK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKGARGAGRGRGRGRGKASAPPPGEQPPPSQPSTHDSMDIDSQSTVAPSSPLEAPVPKITTPQSDFLNDADPSPNSSPATVWTETPAPTPIRPSALRPEPPPILPPTRGGVASRGARVKATESRFKPKNIRRDARELEDLRKKEQARLAAIAAEEAGRAAWKARAGMGRGWGMRGRGDAMGRGAGRGRSGTASGVFGVMPEAIQKNPEFLAPKASGAGGGSRSGGSGSTGPKTVKGGITVSHGDYTSSSSTKGQNKDFLPDPQYPDEDLDAPRVDIELINLVSDESDDDPIFIGSRKVPKPKGKSSNKGGLKPVRLHREEHKERVTLVNTEPAIKVQSDSDEELPTIDEQRSSRAETREKKFKGTFEDIETVKAQIKTEPGLELTYNGIRPPVAASPESDRQIKERTSSPESKRKSKDHLANSEIGIDGPQDDVAAKAKRDRKARTTASKKKDVKPVIQTEEDRAEYERHLEDVAILANELGGLQGNLGAQSQDDDGDVAMDGPNQSPDKKEGRLYLFQFPPVLPELYNPKDPKPKAKAEIRAEKEKEKAEAEAQMSGISAKAKGKMKESGDRTGETVIKVEEEVLGADGKPKKEEEKRKRDEVVHEEGWIGKLVVRESGKVELCWGGTNLLVGRGVDAGFLTTGVMIDMVERGPIGGGSPEGKALSMGQVMGKFVVTPDWEKMV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.64
3	0.61
4	0.61
5	0.56
6	0.58
7	0.59
8	0.59
9	0.57
10	0.51
11	0.5
12	0.48
13	0.5
14	0.43
15	0.44
16	0.44
17	0.47
18	0.47
19	0.43
20	0.4
21	0.4
22	0.44
23	0.4
24	0.34
25	0.29
26	0.3
27	0.33
28	0.31
29	0.27
30	0.2
31	0.19
32	0.16
33	0.16
34	0.13
35	0.09
36	0.09
37	0.07
38	0.11
39	0.12
40	0.13
41	0.15
42	0.17
43	0.2
44	0.25
45	0.28
46	0.25
47	0.28
48	0.29
49	0.34
50	0.36
51	0.36
52	0.34
53	0.33
54	0.34
55	0.31
56	0.33
57	0.26
58	0.24
59	0.23
60	0.2
61	0.24
62	0.24
63	0.27
64	0.22
65	0.22
66	0.21
67	0.22
68	0.28
69	0.23
70	0.22
71	0.22
72	0.24
73	0.24
74	0.25
75	0.25
76	0.22
77	0.22
78	0.27
79	0.26
80	0.29
81	0.3
82	0.33
83	0.38
84	0.44
85	0.48
86	0.46
87	0.5
88	0.48
89	0.48
90	0.47
91	0.44
92	0.41
93	0.37
94	0.37
95	0.33
96	0.32
97	0.32
98	0.29
99	0.25
100	0.26
101	0.28
102	0.3
103	0.31
104	0.29
105	0.28
106	0.29
107	0.31
108	0.32
109	0.35
110	0.4
111	0.42
112	0.51
113	0.55
114	0.61
115	0.66
116	0.66
117	0.71
118	0.72
119	0.76
120	0.73
121	0.78
122	0.78
123	0.73
124	0.75
125	0.67
126	0.65
127	0.64
128	0.6
129	0.53
130	0.54
131	0.49
132	0.45
133	0.47
134	0.44
135	0.39
136	0.4
137	0.38
138	0.32
139	0.31
140	0.25
141	0.2
142	0.14
143	0.09
144	0.07
145	0.06
146	0.04
147	0.04
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.13
153	0.17
154	0.19
155	0.21
156	0.24
157	0.27
158	0.26
159	0.28
160	0.26
161	0.23
162	0.22
163	0.2
164	0.18
165	0.16
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.17
170	0.16
171	0.16
172	0.16
173	0.14
174	0.15
175	0.14
176	0.14
177	0.11
178	0.12
179	0.12
180	0.11
181	0.12
182	0.11
183	0.11
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.06
188	0.05
189	0.07
190	0.08
191	0.07
192	0.1
193	0.1
194	0.11
195	0.11
196	0.14
197	0.15
198	0.14
199	0.2
200	0.19
201	0.19
202	0.18
203	0.18
204	0.15
205	0.13
206	0.14
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.09
216	0.1
217	0.11
218	0.14
219	0.14
220	0.15
221	0.17
222	0.18
223	0.16
224	0.16
225	0.15
226	0.14
227	0.18
228	0.18
229	0.18
230	0.16
231	0.15
232	0.14
233	0.13
234	0.15
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.14
239	0.2
240	0.27
241	0.31
242	0.31
243	0.35
244	0.35
245	0.39
246	0.39
247	0.37
248	0.35
249	0.33
250	0.35
251	0.31
252	0.31
253	0.27
254	0.26
255	0.23
256	0.2
257	0.18
258	0.16
259	0.14
260	0.12
261	0.11
262	0.1
263	0.09
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.05
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.16
285	0.2
286	0.26
287	0.34
288	0.42
289	0.49
290	0.58
291	0.67
292	0.68
293	0.73
294	0.73
295	0.75
296	0.72
297	0.68
298	0.65
299	0.6
300	0.55
301	0.53
302	0.53
303	0.52
304	0.48
305	0.47
306	0.48
307	0.53
308	0.54
309	0.54
310	0.51
311	0.43
312	0.43
313	0.44
314	0.38
315	0.29
316	0.24
317	0.23
318	0.19
319	0.2
320	0.19
321	0.15
322	0.14
323	0.12
324	0.12
325	0.07
326	0.09
327	0.09
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.11
340	0.13
341	0.15
342	0.19
343	0.22
344	0.3
345	0.37
346	0.43
347	0.5
348	0.49
349	0.53
350	0.51
351	0.49
352	0.49
353	0.46
354	0.42
355	0.36
356	0.39
357	0.34
358	0.33
359	0.3
360	0.24
361	0.21
362	0.2
363	0.16
364	0.13
365	0.14
366	0.13
367	0.13
368	0.13
369	0.11
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.16
386	0.2
387	0.23
388	0.23
389	0.21
390	0.22
391	0.26
392	0.26
393	0.24
394	0.25
395	0.29
396	0.34
397	0.43
398	0.47
399	0.51
400	0.55
401	0.62
402	0.64
403	0.63
404	0.63
405	0.64
406	0.66
407	0.66
408	0.68
409	0.62
410	0.57
411	0.52
412	0.45
413	0.36
414	0.27
415	0.18
416	0.11
417	0.07
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.09
424	0.11
425	0.11
426	0.18
427	0.25
428	0.31
429	0.39
430	0.44
431	0.47
432	0.55
433	0.63
434	0.67
435	0.72
436	0.76
437	0.76
438	0.8
439	0.81
440	0.78
441	0.79
442	0.73
443	0.7
444	0.69
445	0.69
446	0.64
447	0.61
448	0.55
449	0.49
450	0.48
451	0.41
452	0.33
453	0.26
454	0.22
455	0.18
456	0.2
457	0.17
458	0.14
459	0.13
460	0.12
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.07
465	0.06
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.04
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.1
494	0.11
495	0.12
496	0.13
497	0.19
498	0.23
499	0.25
500	0.29
501	0.32
502	0.37
503	0.44
504	0.46
505	0.49
506	0.45
507	0.43
508	0.41
509	0.34
510	0.31
511	0.26
512	0.23
513	0.15
514	0.16
515	0.23
516	0.25
517	0.33
518	0.32
519	0.36
520	0.44
521	0.47
522	0.54
523	0.54
524	0.59
525	0.6
526	0.67
527	0.7
528	0.71
529	0.79
530	0.75
531	0.77
532	0.72
533	0.68
534	0.65
535	0.58
536	0.52
537	0.43
538	0.39
539	0.31
540	0.33
541	0.3
542	0.26
543	0.23
544	0.2
545	0.18
546	0.16
547	0.14
548	0.09
549	0.1
550	0.11
551	0.17
552	0.23
553	0.26
554	0.31
555	0.37
556	0.42
557	0.49
558	0.52
559	0.54
560	0.51
561	0.5
562	0.47
563	0.43
564	0.4
565	0.31
566	0.28
567	0.2
568	0.17
569	0.16
570	0.14
571	0.11
572	0.09
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.07
577	0.14
578	0.18
579	0.19
580	0.2
581	0.22
582	0.3
583	0.4
584	0.52
585	0.56
586	0.64
587	0.7
588	0.76
589	0.81
590	0.79
591	0.78
592	0.73
593	0.71
594	0.61
595	0.54
596	0.46
597	0.4
598	0.35
599	0.26
600	0.19
601	0.13
602	0.14
603	0.13
604	0.19
605	0.19
606	0.2
607	0.22
608	0.28
609	0.28
610	0.26
611	0.27
612	0.23
613	0.23
614	0.23
615	0.21
616	0.15
617	0.14
618	0.15
619	0.14
620	0.13
621	0.13
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.11
626	0.09
627	0.09
628	0.08
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.05
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.08
648	0.1
649	0.1
650	0.12
651	0.12
652	0.12
653	0.12
654	0.12
655	0.13
656	0.13
657	0.13
658	0.14
659	0.15
660	0.16
661	0.16
662	0.15
663	0.12
664	0.11
665	0.14
666	0.15
667	0.17

A0A2J6RS16

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer