Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6SE48

Protein Details
Accession A0A2J6SE48    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MPPGRPAKDGPPRKPNPLRNRPPIQAPLHydrophilic
43-62AAAKAPPRPARRACPNKTCSHydrophilic
338-365FYEKSEEWQKNKKKRRRRRAYDGGDEEEBasic
592-620AKKQAENGPPKARRNRKRKPRIGEGQTSAHydrophilic
708-735SSNFLRLPKDRYERRRRTKERVSIVGTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-19AKDGPPRKPNPLR
347-356KNKKKRRRRR
474-481KRRGGKRP
590-612MWAKKQAENGPPKARRNRKRKPR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MPPGRPAKDGPPRKPNPLRNRPPIQAPLPPLFQQKQAAAAAAAAAKAPPRPARRACPNKTCSAPDVVDGICHNCGTIVDDSNIVSEVQFGESSNGAAVVQGSFVSADQGTAKSLGPAFRRAGGMEDREGTIREALGYQLGIPESTIMSGVQIFKLAANNNFIQGRRMDMVAAVCLYSAARKESPCRVMLIDFADRLQINVFKLGRTFKSLHQTITLSADGIMPVLPEDLIYRFADKLEFGELKDKVSEDAIRMVQRMSMDWMVQGRRPSGVCGACLILAARMNNFRRTITEVVYIVKVTTHTIQKRLDEFKVTPSSALTVDEFLNNEFLEAAHDPPSFYEKSEEWQKNKKKRRRRRAYDGGDEEENEENSGSNDEGDEGRSKRQKTAEVNANPDQPVQSVELRRDADGFAIPPQPIQSHDIPIDPDLVDEAIADQTSTTFDKLVAQFGDIPDTNSNPDEDDDDDDASSTTSAPKRRGGKRPVRAVHVPDEWAAMEDRLENEMSEVINDPNTIYHAAAYAKAQRRAAAHMLTAENDNPSRNISMDVHIGEDEFADDPEVIYCVLPEEEVKKKEKVWVNNNRDWLRKQQMKMWAKKQAENGPPKARRNRKRKPRIGEGQTSAASSPAEAAINVMKERAFSKKINYSAIADIFKGISNLKNGPELELGSAGTSRVTSHAGSDLGDSTEGSSRASSLAPSVAESVASVASTSSNFLRLPKDRYERRRRTKERVSIVGTPTAASPTPGPSVRVQSPAEEEGEDDDYVRPSPTPTPRARPQEPEEETEDWRTQVRNAGQIGTGVDEEELLDDEEEYEDYGGVDAGGIPDDVSDRGFDLDDDEDMGFGEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.85
4 0.86
5 0.87
6 0.87
7 0.89
8 0.84
9 0.82
10 0.79
11 0.73
12 0.69
13 0.65
14 0.6
15 0.56
16 0.54
17 0.54
18 0.48
19 0.48
20 0.45
21 0.4
22 0.4
23 0.36
24 0.34
25 0.26
26 0.23
27 0.2
28 0.16
29 0.15
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.12
34 0.18
35 0.24
36 0.3
37 0.39
38 0.46
39 0.55
40 0.65
41 0.74
42 0.78
43 0.8
44 0.8
45 0.78
46 0.77
47 0.72
48 0.64
49 0.6
50 0.51
51 0.42
52 0.4
53 0.32
54 0.28
55 0.24
56 0.24
57 0.18
58 0.17
59 0.15
60 0.12
61 0.12
62 0.14
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.13
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.15
101 0.19
102 0.2
103 0.25
104 0.26
105 0.27
106 0.28
107 0.26
108 0.29
109 0.29
110 0.29
111 0.27
112 0.27
113 0.25
114 0.25
115 0.25
116 0.22
117 0.18
118 0.14
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.14
142 0.16
143 0.17
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.26
148 0.25
149 0.24
150 0.21
151 0.23
152 0.2
153 0.2
154 0.16
155 0.15
156 0.16
157 0.14
158 0.14
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.12
166 0.14
167 0.17
168 0.22
169 0.3
170 0.34
171 0.33
172 0.34
173 0.32
174 0.3
175 0.3
176 0.3
177 0.24
178 0.2
179 0.19
180 0.2
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.19
187 0.19
188 0.17
189 0.2
190 0.24
191 0.23
192 0.26
193 0.28
194 0.27
195 0.37
196 0.38
197 0.37
198 0.36
199 0.35
200 0.31
201 0.32
202 0.27
203 0.18
204 0.16
205 0.15
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.21
231 0.2
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.12
236 0.16
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.17
249 0.17
250 0.19
251 0.2
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.22
257 0.21
258 0.19
259 0.18
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.16
269 0.19
270 0.22
271 0.23
272 0.22
273 0.23
274 0.28
275 0.29
276 0.24
277 0.25
278 0.22
279 0.23
280 0.23
281 0.21
282 0.15
283 0.13
284 0.11
285 0.09
286 0.12
287 0.18
288 0.2
289 0.25
290 0.28
291 0.31
292 0.36
293 0.39
294 0.37
295 0.34
296 0.33
297 0.34
298 0.37
299 0.33
300 0.28
301 0.24
302 0.24
303 0.19
304 0.2
305 0.13
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.16
324 0.13
325 0.13
326 0.15
327 0.12
328 0.17
329 0.27
330 0.33
331 0.34
332 0.44
333 0.53
334 0.6
335 0.7
336 0.75
337 0.76
338 0.82
339 0.88
340 0.9
341 0.9
342 0.91
343 0.91
344 0.91
345 0.89
346 0.83
347 0.74
348 0.63
349 0.53
350 0.45
351 0.34
352 0.26
353 0.16
354 0.11
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.1
365 0.1
366 0.16
367 0.21
368 0.22
369 0.25
370 0.28
371 0.34
372 0.35
373 0.43
374 0.47
375 0.46
376 0.51
377 0.49
378 0.48
379 0.41
380 0.36
381 0.28
382 0.19
383 0.17
384 0.13
385 0.14
386 0.13
387 0.14
388 0.19
389 0.19
390 0.19
391 0.19
392 0.16
393 0.14
394 0.13
395 0.12
396 0.09
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.14
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.14
411 0.1
412 0.09
413 0.07
414 0.06
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.09
429 0.1
430 0.12
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.11
435 0.14
436 0.11
437 0.12
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.05
456 0.08
457 0.11
458 0.15
459 0.17
460 0.23
461 0.32
462 0.4
463 0.49
464 0.56
465 0.62
466 0.68
467 0.75
468 0.73
469 0.7
470 0.66
471 0.6
472 0.55
473 0.47
474 0.39
475 0.29
476 0.26
477 0.2
478 0.17
479 0.14
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.1
505 0.17
506 0.21
507 0.25
508 0.25
509 0.26
510 0.27
511 0.3
512 0.32
513 0.26
514 0.21
515 0.2
516 0.2
517 0.19
518 0.18
519 0.15
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.13
528 0.12
529 0.14
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.14
534 0.13
535 0.1
536 0.09
537 0.08
538 0.06
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.1
553 0.16
554 0.2
555 0.23
556 0.24
557 0.26
558 0.33
559 0.39
560 0.44
561 0.49
562 0.56
563 0.62
564 0.65
565 0.72
566 0.68
567 0.66
568 0.59
569 0.57
570 0.56
571 0.54
572 0.51
573 0.48
574 0.56
575 0.6
576 0.66
577 0.65
578 0.65
579 0.61
580 0.64
581 0.65
582 0.63
583 0.63
584 0.63
585 0.63
586 0.64
587 0.67
588 0.71
589 0.74
590 0.76
591 0.77
592 0.8
593 0.83
594 0.85
595 0.89
596 0.91
597 0.89
598 0.89
599 0.9
600 0.87
601 0.84
602 0.77
603 0.7
604 0.61
605 0.52
606 0.42
607 0.32
608 0.23
609 0.15
610 0.11
611 0.08
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.08
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.09
620 0.1
621 0.12
622 0.17
623 0.2
624 0.2
625 0.27
626 0.34
627 0.38
628 0.41
629 0.41
630 0.38
631 0.37
632 0.39
633 0.33
634 0.25
635 0.23
636 0.2
637 0.18
638 0.15
639 0.13
640 0.12
641 0.14
642 0.17
643 0.17
644 0.21
645 0.21
646 0.23
647 0.23
648 0.21
649 0.19
650 0.17
651 0.15
652 0.11
653 0.11
654 0.09
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.07
659 0.09
660 0.09
661 0.1
662 0.13
663 0.13
664 0.13
665 0.14
666 0.13
667 0.12
668 0.12
669 0.1
670 0.1
671 0.13
672 0.12
673 0.12
674 0.11
675 0.11
676 0.12
677 0.12
678 0.11
679 0.09
680 0.11
681 0.1
682 0.11
683 0.12
684 0.11
685 0.11
686 0.1
687 0.1
688 0.08
689 0.08
690 0.07
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.08
695 0.08
696 0.11
697 0.11
698 0.14
699 0.21
700 0.26
701 0.31
702 0.39
703 0.48
704 0.55
705 0.66
706 0.75
707 0.79
708 0.85
709 0.91
710 0.9
711 0.91
712 0.92
713 0.91
714 0.88
715 0.85
716 0.8
717 0.76
718 0.7
719 0.63
720 0.53
721 0.43
722 0.35
723 0.29
724 0.23
725 0.17
726 0.15
727 0.14
728 0.19
729 0.19
730 0.22
731 0.23
732 0.3
733 0.31
734 0.36
735 0.34
736 0.31
737 0.35
738 0.34
739 0.32
740 0.26
741 0.23
742 0.2
743 0.22
744 0.19
745 0.15
746 0.14
747 0.14
748 0.15
749 0.15
750 0.13
751 0.13
752 0.21
753 0.28
754 0.36
755 0.42
756 0.5
757 0.59
758 0.68
759 0.71
760 0.72
761 0.69
762 0.71
763 0.68
764 0.64
765 0.6
766 0.53
767 0.51
768 0.48
769 0.43
770 0.33
771 0.32
772 0.29
773 0.25
774 0.3
775 0.31
776 0.32
777 0.32
778 0.33
779 0.3
780 0.3
781 0.29
782 0.23
783 0.19
784 0.13
785 0.12
786 0.1
787 0.09
788 0.08
789 0.09
790 0.07
791 0.07
792 0.07
793 0.08
794 0.09
795 0.09
796 0.09
797 0.08
798 0.07
799 0.07
800 0.07
801 0.06
802 0.05
803 0.05
804 0.05
805 0.05
806 0.06
807 0.06
808 0.05
809 0.06
810 0.07
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.08
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.12
819 0.12
820 0.12
821 0.14
822 0.13
823 0.11
824 0.11