FuNGI

A0A2J6S7B2

Protein Details

Accession

A0A2J6S7B2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-53	QFVRKSKAADPLRPRKKPVRRPNVPPRQPVGL	Hydrophilic
533-559	ESSGNESSRKKQKNKHPSSSQPTRTST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-45	RKSKAADPLRPRKKPVRRPNV
427-446	EAKKRKELGKDLVKALKKRE
480-529	KKDEEAKNKAKMESKLPSGASTKGTNTPSGRPKHTDPLKKTKGLKRPGSP
541-546	RKKQKN
630-641	RKAKKIKLTIKG

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 3, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGLSNGRTPTPNGGPPQFVRKSKAADPLRPRKKPVRRPNVPPRQPVGLGISASGPAGRPTSLNGVAQARGSGGYQTPANGAQNPNINGGWTNPPPPNGQYQDFPLYTTKRALREGLRYHVARFAAPKKDIDPSNQDEFTRPVVLHRRDPKQPPPGKGVKDEDAAAEEPMDSKEREKQEILKAEKEKQKAADLAQIAPTGNNASALAAKKTQAFRNEKTTQVHRLDKTEEQKKASDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNAIFFIDGATFRMIPLEKWYKFTPKGQFKTFTIEEAEAKMSKKHKESRWVMKTNEQKESDRATQDTRRTLHNLYTVKAESNTFKNAGKRELEDMDDLDFDDDLFQDDDEQATVEPDKDEETKDAQDRIKREQLGANIFDKANEAEVDHELEEEAKEAKKRKELGKDLVKALKKRERNLAYESDSDGNPYSETSEDDTSDEEKQKEIDRKKDEEAKNKAKMESKLPSGASTKGTNTPSGRPKHTDPLKKTKGLKRPGSPNLSESSGNESSRKKQKNKHPSSSQPTRTSTPVPGSRPMSPAPSASQPLPNQSPRKSSIVKLNVNPSKLSDIQSAPPNPSPVYNAMSDGEATGGEGSDGGARKAKKIKLTIKGQSPIGSRAGSPAPGKAGSVGGSRAGSPAAPQNGSTAEAGPPRAKSPALGPIQPHEIVAALPTSGAGIVAGVLMNMFSKRVGEQPNQTKKKDFIQMVKENSRYGPDKLLRRKDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.39
3	0.43
4	0.45
5	0.44
6	0.46
7	0.47
8	0.54
9	0.55
10	0.53
11	0.53
12	0.52
13	0.55
14	0.55
15	0.62
16	0.6
17	0.62
18	0.68
19	0.73
20	0.79
21	0.79
22	0.81
23	0.81
24	0.84
25	0.86
26	0.86
27	0.87
28	0.85
29	0.9
30	0.93
31	0.94
32	0.92
33	0.89
34	0.83
35	0.78
36	0.69
37	0.61
38	0.55
39	0.48
40	0.39
41	0.31
42	0.26
43	0.2
44	0.19
45	0.16
46	0.11
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.13
52	0.19
53	0.22
54	0.22
55	0.24
56	0.26
57	0.26
58	0.26
59	0.23
60	0.17
61	0.15
62	0.15
63	0.13
64	0.11
65	0.13
66	0.13
67	0.13
68	0.15
69	0.17
70	0.19
71	0.21
72	0.22
73	0.24
74	0.3
75	0.31
76	0.32
77	0.29
78	0.28
79	0.24
80	0.25
81	0.28
82	0.23
83	0.27
84	0.26
85	0.29
86	0.31
87	0.33
88	0.38
89	0.37
90	0.38
91	0.35
92	0.38
93	0.42
94	0.39
95	0.39
96	0.36
97	0.34
98	0.33
99	0.37
100	0.36
101	0.34
102	0.37
103	0.4
104	0.4
105	0.46
106	0.49
107	0.49
108	0.52
109	0.49
110	0.47
111	0.47
112	0.41
113	0.34
114	0.35
115	0.35
116	0.36
117	0.37
118	0.38
119	0.35
120	0.42
121	0.42
122	0.41
123	0.42
124	0.4
125	0.45
126	0.45
127	0.43
128	0.38
129	0.38
130	0.36
131	0.3
132	0.24
133	0.24
134	0.32
135	0.36
136	0.43
137	0.49
138	0.52
139	0.58
140	0.66
141	0.68
142	0.69
143	0.72
144	0.68
145	0.68
146	0.7
147	0.65
148	0.65
149	0.61
150	0.54
151	0.49
152	0.45
153	0.37
154	0.31
155	0.28
156	0.21
157	0.16
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.13
162	0.1
163	0.12
164	0.19
165	0.23
166	0.27
167	0.28
168	0.33
169	0.39
170	0.48
171	0.5
172	0.51
173	0.52
174	0.56
175	0.6
176	0.57
177	0.53
178	0.46
179	0.46
180	0.41
181	0.39
182	0.37
183	0.31
184	0.3
185	0.28
186	0.26
187	0.21
188	0.18
189	0.17
190	0.12
191	0.1
192	0.09
193	0.07
194	0.07
195	0.1
196	0.12
197	0.13
198	0.13
199	0.14
200	0.19
201	0.23
202	0.27
203	0.33
204	0.39
205	0.4
206	0.49
207	0.51
208	0.51
209	0.52
210	0.53
211	0.52
212	0.52
213	0.56
214	0.48
215	0.48
216	0.48
217	0.49
218	0.53
219	0.53
220	0.5
221	0.46
222	0.45
223	0.45
224	0.48
225	0.44
226	0.4
227	0.34
228	0.32
229	0.32
230	0.31
231	0.29
232	0.24
233	0.23
234	0.18
235	0.16
236	0.15
237	0.12
238	0.12
239	0.14
240	0.17
241	0.19
242	0.19
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.19
247	0.18
248	0.13
249	0.1
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.08
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.15
274	0.23
275	0.22
276	0.26
277	0.29
278	0.34
279	0.36
280	0.43
281	0.46
282	0.48
283	0.52
284	0.53
285	0.55
286	0.49
287	0.54
288	0.48
289	0.39
290	0.31
291	0.27
292	0.23
293	0.2
294	0.21
295	0.15
296	0.15
297	0.18
298	0.2
299	0.23
300	0.29
301	0.36
302	0.39
303	0.48
304	0.56
305	0.63
306	0.68
307	0.7
308	0.65
309	0.65
310	0.68
311	0.62
312	0.62
313	0.54
314	0.45
315	0.43
316	0.46
317	0.42
318	0.36
319	0.33
320	0.3
321	0.33
322	0.35
323	0.37
324	0.33
325	0.32
326	0.34
327	0.33
328	0.32
329	0.33
330	0.3
331	0.26
332	0.28
333	0.26
334	0.23
335	0.22
336	0.2
337	0.16
338	0.17
339	0.18
340	0.16
341	0.18
342	0.21
343	0.22
344	0.25
345	0.24
346	0.23
347	0.24
348	0.23
349	0.22
350	0.19
351	0.18
352	0.14
353	0.13
354	0.11
355	0.08
356	0.07
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.11
379	0.14
380	0.15
381	0.19
382	0.2
383	0.23
384	0.25
385	0.29
386	0.32
387	0.3
388	0.3
389	0.3
390	0.3
391	0.31
392	0.31
393	0.26
394	0.22
395	0.21
396	0.2
397	0.17
398	0.13
399	0.1
400	0.08
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.07
412	0.07
413	0.11
414	0.16
415	0.19
416	0.25
417	0.3
418	0.36
419	0.44
420	0.49
421	0.55
422	0.59
423	0.6
424	0.58
425	0.6
426	0.57
427	0.5
428	0.52
429	0.5
430	0.46
431	0.46
432	0.52
433	0.5
434	0.5
435	0.52
436	0.5
437	0.46
438	0.42
439	0.41
440	0.33
441	0.28
442	0.25
443	0.21
444	0.15
445	0.12
446	0.1
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.11
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.13
455	0.13
456	0.16
457	0.18
458	0.16
459	0.15
460	0.16
461	0.22
462	0.29
463	0.33
464	0.39
465	0.42
466	0.46
467	0.51
468	0.59
469	0.6
470	0.61
471	0.65
472	0.65
473	0.66
474	0.65
475	0.63
476	0.59
477	0.56
478	0.53
479	0.48
480	0.42
481	0.39
482	0.37
483	0.36
484	0.32
485	0.31
486	0.27
487	0.24
488	0.23
489	0.24
490	0.25
491	0.27
492	0.27
493	0.32
494	0.38
495	0.41
496	0.43
497	0.42
498	0.45
499	0.51
500	0.58
501	0.6
502	0.6
503	0.66
504	0.68
505	0.7
506	0.75
507	0.73
508	0.73
509	0.73
510	0.74
511	0.71
512	0.74
513	0.75
514	0.74
515	0.67
516	0.6
517	0.53
518	0.47
519	0.4
520	0.31
521	0.3
522	0.27
523	0.26
524	0.28
525	0.28
526	0.33
527	0.43
528	0.51
529	0.51
530	0.57
531	0.67
532	0.75
533	0.82
534	0.85
535	0.84
536	0.85
537	0.87
538	0.88
539	0.86
540	0.81
541	0.75
542	0.68
543	0.61
544	0.54
545	0.49
546	0.46
547	0.44
548	0.41
549	0.42
550	0.43
551	0.42
552	0.42
553	0.4
554	0.36
555	0.31
556	0.29
557	0.26
558	0.27
559	0.27
560	0.25
561	0.3
562	0.27
563	0.33
564	0.37
565	0.41
566	0.44
567	0.45
568	0.49
569	0.46
570	0.52
571	0.49
572	0.47
573	0.49
574	0.52
575	0.55
576	0.54
577	0.6
578	0.58
579	0.56
580	0.53
581	0.44
582	0.41
583	0.36
584	0.35
585	0.29
586	0.27
587	0.3
588	0.37
589	0.37
590	0.35
591	0.36
592	0.35
593	0.31
594	0.3
595	0.29
596	0.25
597	0.25
598	0.22
599	0.21
600	0.19
601	0.19
602	0.18
603	0.15
604	0.11
605	0.08
606	0.08
607	0.06
608	0.05
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.08
613	0.08
614	0.09
615	0.14
616	0.15
617	0.21
618	0.29
619	0.33
620	0.37
621	0.46
622	0.54
623	0.59
624	0.68
625	0.7
626	0.71
627	0.71
628	0.66
629	0.62
630	0.55
631	0.49
632	0.43
633	0.36
634	0.27
635	0.26
636	0.26
637	0.25
638	0.23
639	0.21
640	0.22
641	0.21
642	0.21
643	0.18
644	0.18
645	0.16
646	0.17
647	0.16
648	0.14
649	0.15
650	0.15
651	0.14
652	0.13
653	0.11
654	0.11
655	0.17
656	0.2
657	0.2
658	0.2
659	0.21
660	0.22
661	0.24
662	0.23
663	0.17
664	0.16
665	0.18
666	0.21
667	0.22
668	0.23
669	0.23
670	0.24
671	0.23
672	0.21
673	0.23
674	0.29
675	0.31
676	0.33
677	0.33
678	0.35
679	0.4
680	0.39
681	0.34
682	0.25
683	0.21
684	0.17
685	0.16
686	0.12
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.05
692	0.05
693	0.04
694	0.03
695	0.03
696	0.04
697	0.04
698	0.03
699	0.03
700	0.04
701	0.05
702	0.05
703	0.06
704	0.06
705	0.08
706	0.09
707	0.17
708	0.24
709	0.29
710	0.39
711	0.5
712	0.61
713	0.67
714	0.69
715	0.68
716	0.65
717	0.67
718	0.66
719	0.63
720	0.61
721	0.64
722	0.69
723	0.73
724	0.77
725	0.71
726	0.64
727	0.58
728	0.55
729	0.49
730	0.43
731	0.44
732	0.43
733	0.51
734	0.59

A0A2J6S7B2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer