Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2J6RYR9

Protein Details
Accession A0A2J6RYR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-61KTGNKFRRQDLHVKQKKAKDSQRRDERFKRKREEDRDPELRRERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-61KAALPFKTGNKFRRQDLHVKQKKAKDSQRRDERFKRKREEDRDPELRRER
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 9.5, cyto_mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MGSKRVKPLSAKAALPFKTGNKFRRQDLHVKQKKAKDSQRRDERFKRKREEDRDPELRRERLAKNVPITIDKKRVWDDVDGDDLGISVDVEQLKRRRIEEAEAAEQEALQDEEEGEKDEDADSMLDSDSGSEEDEEEPKRARQRASSNAPSTTSTNLDLTPSSLALKFPTLFSDEPPPVPKILLTTSLNSNLHKEAHLLCTLFPNTHYVPRSSHRYGHKFSLREISKFAANREYTTVILLKEDQKKPTGLTIVHLPEGPTCHFSIANWVEGKKLPGHGNPTNHYPELILNNFRTPLGLLTARIFLTLFPPQPELQGRQVVTLHNQRDYIFVRRHRYVFRDKKETEKSVVGPDGKPVKGVEDIRAGLQELGPRFTLKLRRVDKGVGRAGSDGPDKIQWEWKAGMEKKRTRFNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.48
4 0.44
5 0.48
6 0.53
7 0.55
8 0.57
9 0.6
10 0.63
11 0.69
12 0.7
13 0.7
14 0.73
15 0.76
16 0.75
17 0.79
18 0.81
19 0.79
20 0.82
21 0.82
22 0.81
23 0.81
24 0.83
25 0.85
26 0.88
27 0.89
28 0.9
29 0.9
30 0.91
31 0.9
32 0.89
33 0.88
34 0.88
35 0.9
36 0.89
37 0.9
38 0.87
39 0.88
40 0.88
41 0.82
42 0.81
43 0.78
44 0.71
45 0.64
46 0.62
47 0.55
48 0.55
49 0.59
50 0.56
51 0.53
52 0.54
53 0.52
54 0.51
55 0.52
56 0.49
57 0.49
58 0.44
59 0.45
60 0.45
61 0.46
62 0.42
63 0.42
64 0.38
65 0.33
66 0.35
67 0.29
68 0.25
69 0.22
70 0.19
71 0.14
72 0.11
73 0.07
74 0.04
75 0.06
76 0.08
77 0.09
78 0.15
79 0.19
80 0.25
81 0.28
82 0.29
83 0.31
84 0.33
85 0.37
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.38
90 0.38
91 0.33
92 0.3
93 0.24
94 0.17
95 0.11
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.18
126 0.24
127 0.27
128 0.28
129 0.32
130 0.39
131 0.47
132 0.54
133 0.59
134 0.56
135 0.53
136 0.53
137 0.47
138 0.41
139 0.33
140 0.26
141 0.19
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.13
158 0.12
159 0.14
160 0.19
161 0.18
162 0.19
163 0.22
164 0.21
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.12
169 0.13
170 0.16
171 0.15
172 0.16
173 0.17
174 0.22
175 0.23
176 0.21
177 0.22
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.16
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.14
186 0.12
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.14
192 0.13
193 0.18
194 0.19
195 0.17
196 0.19
197 0.23
198 0.3
199 0.29
200 0.34
201 0.38
202 0.43
203 0.45
204 0.5
205 0.52
206 0.45
207 0.44
208 0.48
209 0.41
210 0.36
211 0.35
212 0.29
213 0.27
214 0.27
215 0.27
216 0.24
217 0.22
218 0.22
219 0.23
220 0.23
221 0.19
222 0.19
223 0.19
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.18
228 0.25
229 0.28
230 0.28
231 0.29
232 0.3
233 0.3
234 0.31
235 0.28
236 0.19
237 0.18
238 0.22
239 0.22
240 0.22
241 0.22
242 0.19
243 0.16
244 0.18
245 0.18
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.2
252 0.19
253 0.22
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.22
258 0.24
259 0.17
260 0.2
261 0.19
262 0.21
263 0.29
264 0.32
265 0.37
266 0.38
267 0.41
268 0.42
269 0.38
270 0.35
271 0.28
272 0.26
273 0.26
274 0.26
275 0.24
276 0.21
277 0.23
278 0.23
279 0.22
280 0.2
281 0.15
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.1
292 0.13
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.19
297 0.19
298 0.23
299 0.27
300 0.27
301 0.27
302 0.31
303 0.3
304 0.29
305 0.31
306 0.28
307 0.31
308 0.35
309 0.34
310 0.3
311 0.31
312 0.29
313 0.33
314 0.34
315 0.36
316 0.35
317 0.4
318 0.45
319 0.49
320 0.53
321 0.54
322 0.57
323 0.61
324 0.64
325 0.66
326 0.68
327 0.65
328 0.71
329 0.74
330 0.72
331 0.66
332 0.6
333 0.54
334 0.5
335 0.54
336 0.47
337 0.39
338 0.41
339 0.43
340 0.38
341 0.37
342 0.31
343 0.27
344 0.3
345 0.32
346 0.29
347 0.28
348 0.28
349 0.28
350 0.28
351 0.27
352 0.21
353 0.2
354 0.21
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.18
359 0.18
360 0.24
361 0.31
362 0.32
363 0.41
364 0.44
365 0.49
366 0.52
367 0.59
368 0.6
369 0.6
370 0.62
371 0.54
372 0.5
373 0.47
374 0.44
375 0.4
376 0.36
377 0.28
378 0.22
379 0.24
380 0.24
381 0.25
382 0.32
383 0.29
384 0.31
385 0.32
386 0.34
387 0.41
388 0.46
389 0.53
390 0.55
391 0.62
392 0.66