Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6RHW6

Protein Details
Accession A0A2J6RHW6    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-124EATASGKKERKKRQHDPNAPKRPLTBasic
240-263KEPTPPPKTPKTKGGRKGKATPATBasic
276-306IVPPKPVEKEKSPDKKRKRASKKSDEPTPTIBasic
311-330LAVETPKSAPKPRKKKAKGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-119GKKERKKRQHDPNAP
245-259PPKTPKTKGGRKGKA
279-299PKPVEKEKSPDKKRKRASKKS
317-330KSAPKPRKKKAKGE
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARPKKVAEEKPKEGATLSIDVDSFVRTRDSVVTGLATLQDAIQTLSSAYIKHTNAVLGEHGAGLDVESALAKLGENPLLKLGELNRAISPAGKSNATGEATASGKKERKKRQHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIANDLGAEAAKGAVSDEGTRRWGTMAAEDKQLWTNAYKDNLRLYNARMHSYKAGNALAKEMTDDDALIYADEHNISVENTADAQLAGDAAAALHDEDAEGEPDKEPTPPPKTPKTKGGRKGKATPATAPDSIVPPASSSIVPPKPVEKEKSPDKKRKRASKKSDEPTPTIEKEDLAVETPKSAPKPRKKKAKGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.46
3 0.38
4 0.32
5 0.27
6 0.21
7 0.19
8 0.19
9 0.19
10 0.18
11 0.14
12 0.11
13 0.12
14 0.1
15 0.12
16 0.15
17 0.17
18 0.16
19 0.17
20 0.17
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.11
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.12
37 0.18
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.19
42 0.19
43 0.2
44 0.18
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.07
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.19
71 0.19
72 0.21
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.16
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.21
84 0.2
85 0.18
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.16
91 0.18
92 0.21
93 0.27
94 0.37
95 0.45
96 0.55
97 0.64
98 0.73
99 0.78
100 0.85
101 0.9
102 0.92
103 0.92
104 0.93
105 0.84
106 0.75
107 0.67
108 0.62
109 0.55
110 0.49
111 0.42
112 0.33
113 0.33
114 0.34
115 0.32
116 0.27
117 0.26
118 0.22
119 0.18
120 0.15
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.1
147 0.14
148 0.18
149 0.17
150 0.2
151 0.19
152 0.2
153 0.19
154 0.19
155 0.15
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.2
163 0.2
164 0.22
165 0.21
166 0.21
167 0.25
168 0.25
169 0.27
170 0.24
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.25
175 0.21
176 0.22
177 0.2
178 0.19
179 0.19
180 0.15
181 0.14
182 0.13
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.19
230 0.26
231 0.31
232 0.38
233 0.47
234 0.55
235 0.59
236 0.67
237 0.69
238 0.72
239 0.76
240 0.81
241 0.8
242 0.78
243 0.82
244 0.82
245 0.8
246 0.73
247 0.67
248 0.61
249 0.57
250 0.5
251 0.42
252 0.34
253 0.28
254 0.26
255 0.22
256 0.17
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.21
263 0.22
264 0.25
265 0.25
266 0.29
267 0.35
268 0.42
269 0.47
270 0.44
271 0.5
272 0.58
273 0.68
274 0.73
275 0.77
276 0.8
277 0.84
278 0.88
279 0.91
280 0.92
281 0.92
282 0.93
283 0.93
284 0.94
285 0.92
286 0.92
287 0.87
288 0.8
289 0.75
290 0.72
291 0.63
292 0.56
293 0.48
294 0.38
295 0.33
296 0.3
297 0.25
298 0.2
299 0.2
300 0.16
301 0.18
302 0.2
303 0.23
304 0.26
305 0.34
306 0.42
307 0.51
308 0.62
309 0.69
310 0.79