Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6S3U4

Protein Details
Accession A0A2J6S3U4    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-131LDARSWLIKQKKRQKEIEKARKREQELAHydrophilic
278-303DVSEIKIKKPKKKKAKSTRQRAVDEDBasic
639-659GMSNATQQQRKKQRQAGVRLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-89AKRRRDAKAEAVKKARDAAKRFT
112-126KQKKRQKEIEKARKR
283-296KIKKPKKKKAKSTR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADAISIEETNRIRVSLGMKPLPVPGATGPVFKDAPSAPTEEVGSTLESRQAEGYDNYRKLQEAEEAKRRRDAKAEAVKKARDAAKRFTKLEGKGLGDADEEDLDARSWLIKQKKRQKEIEKARKREQELADAEVAAEYTAKDLAGVKVGHEIDTFEEGEVQVLTLKDTTIDENEEEGDELENLDLRERERLNEKLELKKKKPVYNPNDVDETGEKSILAHYDEEIEGKKGKRFTLDGMGSTAEAMREGVSLQKMKPKVFSLDILSNLDDEPKSDYLDVSEIKIKKPKKKKAKSTRQRAVDEDDIFPEIAAADTPQQDGNSMEVDQPIVTKKRTFNDMSFVDDEDLQASLAAQRRNALKKRQKLRPEDIVQQLKAESASPTAEDTVEGEAGLVIDETSEFVANLQKPAGPERKRSSNSQQPETVTAMNADSDDDDVDMQQSYANVEDDEDRLARLNREESATGDITENGLEKEATLDHGVGSTLKLLKERGIIKTAESGDLNAIFRQKQLFLAEKQRRESEAERKARTQRERDRATGRLDRMSAREKEDYARSQNTFRDQQESRQLAEHFNKEYKPNVELKYIDDFGRSMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGKQKTEKMLKKIEDEKRKEAQSSLDGSQIGGMSNATQQQRKKQRQAGVRLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.25
4 0.33
5 0.33
6 0.33
7 0.34
8 0.36
9 0.35
10 0.3
11 0.26
12 0.19
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.23
17 0.26
18 0.26
19 0.23
20 0.26
21 0.2
22 0.22
23 0.21
24 0.24
25 0.2
26 0.21
27 0.22
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.15
33 0.15
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.2
41 0.25
42 0.3
43 0.33
44 0.33
45 0.34
46 0.34
47 0.32
48 0.32
49 0.33
50 0.33
51 0.39
52 0.48
53 0.53
54 0.55
55 0.61
56 0.6
57 0.55
58 0.53
59 0.5
60 0.51
61 0.56
62 0.61
63 0.62
64 0.68
65 0.66
66 0.61
67 0.62
68 0.59
69 0.56
70 0.53
71 0.54
72 0.58
73 0.63
74 0.63
75 0.63
76 0.63
77 0.58
78 0.6
79 0.55
80 0.47
81 0.43
82 0.42
83 0.36
84 0.28
85 0.26
86 0.2
87 0.14
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.16
97 0.25
98 0.32
99 0.42
100 0.53
101 0.64
102 0.71
103 0.8
104 0.82
105 0.84
106 0.89
107 0.9
108 0.89
109 0.87
110 0.88
111 0.87
112 0.81
113 0.79
114 0.71
115 0.69
116 0.61
117 0.56
118 0.47
119 0.38
120 0.34
121 0.25
122 0.21
123 0.11
124 0.09
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.07
131 0.07
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.17
142 0.17
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.15
175 0.15
176 0.18
177 0.22
178 0.26
179 0.28
180 0.35
181 0.39
182 0.43
183 0.51
184 0.58
185 0.56
186 0.6
187 0.64
188 0.65
189 0.7
190 0.71
191 0.7
192 0.71
193 0.72
194 0.67
195 0.63
196 0.55
197 0.48
198 0.39
199 0.34
200 0.24
201 0.2
202 0.16
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.14
215 0.15
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.22
220 0.23
221 0.25
222 0.3
223 0.3
224 0.27
225 0.26
226 0.25
227 0.22
228 0.2
229 0.17
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.07
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.18
241 0.21
242 0.21
243 0.24
244 0.24
245 0.25
246 0.25
247 0.27
248 0.25
249 0.25
250 0.26
251 0.24
252 0.22
253 0.19
254 0.17
255 0.16
256 0.11
257 0.09
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.1
267 0.16
268 0.16
269 0.18
270 0.24
271 0.29
272 0.36
273 0.47
274 0.55
275 0.61
276 0.7
277 0.8
278 0.85
279 0.91
280 0.92
281 0.93
282 0.91
283 0.88
284 0.81
285 0.72
286 0.66
287 0.61
288 0.52
289 0.41
290 0.33
291 0.26
292 0.22
293 0.19
294 0.13
295 0.07
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.13
318 0.16
319 0.19
320 0.24
321 0.26
322 0.24
323 0.29
324 0.29
325 0.3
326 0.28
327 0.26
328 0.21
329 0.18
330 0.17
331 0.11
332 0.1
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.06
337 0.1
338 0.11
339 0.1
340 0.13
341 0.18
342 0.26
343 0.31
344 0.39
345 0.44
346 0.52
347 0.62
348 0.68
349 0.72
350 0.73
351 0.74
352 0.74
353 0.7
354 0.68
355 0.67
356 0.63
357 0.54
358 0.46
359 0.39
360 0.3
361 0.25
362 0.19
363 0.11
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.02
381 0.02
382 0.02
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.18
395 0.27
396 0.26
397 0.33
398 0.38
399 0.48
400 0.49
401 0.55
402 0.58
403 0.59
404 0.62
405 0.59
406 0.57
407 0.49
408 0.49
409 0.45
410 0.36
411 0.27
412 0.21
413 0.16
414 0.13
415 0.11
416 0.08
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.12
440 0.13
441 0.14
442 0.15
443 0.15
444 0.17
445 0.18
446 0.17
447 0.2
448 0.19
449 0.18
450 0.17
451 0.15
452 0.13
453 0.13
454 0.12
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.09
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.13
474 0.15
475 0.2
476 0.24
477 0.24
478 0.26
479 0.26
480 0.25
481 0.3
482 0.3
483 0.26
484 0.22
485 0.2
486 0.18
487 0.19
488 0.19
489 0.14
490 0.16
491 0.14
492 0.15
493 0.16
494 0.15
495 0.16
496 0.2
497 0.23
498 0.26
499 0.37
500 0.44
501 0.47
502 0.51
503 0.51
504 0.49
505 0.5
506 0.51
507 0.51
508 0.53
509 0.56
510 0.56
511 0.6
512 0.66
513 0.69
514 0.71
515 0.72
516 0.72
517 0.73
518 0.75
519 0.75
520 0.73
521 0.69
522 0.68
523 0.66
524 0.58
525 0.53
526 0.49
527 0.44
528 0.44
529 0.46
530 0.42
531 0.39
532 0.39
533 0.36
534 0.39
535 0.43
536 0.43
537 0.42
538 0.46
539 0.43
540 0.44
541 0.47
542 0.5
543 0.5
544 0.46
545 0.47
546 0.42
547 0.47
548 0.53
549 0.51
550 0.46
551 0.44
552 0.43
553 0.43
554 0.48
555 0.45
556 0.4
557 0.42
558 0.43
559 0.41
560 0.45
561 0.41
562 0.4
563 0.42
564 0.4
565 0.41
566 0.39
567 0.4
568 0.41
569 0.4
570 0.35
571 0.29
572 0.26
573 0.22
574 0.3
575 0.29
576 0.24
577 0.29
578 0.34
579 0.36
580 0.39
581 0.45
582 0.41
583 0.4
584 0.46
585 0.47
586 0.48
587 0.48
588 0.54
589 0.49
590 0.47
591 0.54
592 0.51
593 0.5
594 0.52
595 0.57
596 0.54
597 0.58
598 0.59
599 0.61
600 0.67
601 0.68
602 0.68
603 0.69
604 0.69
605 0.7
606 0.76
607 0.76
608 0.76
609 0.75
610 0.75
611 0.73
612 0.73
613 0.67
614 0.59
615 0.55
616 0.51
617 0.49
618 0.43
619 0.38
620 0.34
621 0.31
622 0.31
623 0.25
624 0.18
625 0.13
626 0.12
627 0.09
628 0.12
629 0.18
630 0.21
631 0.26
632 0.31
633 0.42
634 0.53
635 0.62
636 0.7
637 0.73
638 0.77
639 0.81