Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6S6J4

Protein Details
Accession A0A2J6S6J4    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-83TGQAEKAEKNSKKRKRDGERDAAEAVVQNGQKAKKDKNKRRKIEEAEAAEHydrophilic
85-110VKDAVKAPKKEKKSKKGKASESTEDCHydrophilic
124-148EAPEEPKKTKKERKAERKARQAAETBasic
169-197SSKGEEEKKSKKNNRNRDKKRKGTSANGEBasic
297-316GGNTKERKAKIQGKNEKLNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-55EKNSKKRKRDGERDA
62-102NGQKAKKDKNKRRKIEEAEAAEEVKDAVKAPKKEKKSKKGK
129-145PKKTKKERKAERKARQA
174-191EEKKSKKNNRNRDKKRKG
303-311RKAKIQGKN
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGKSTDISRAERKAKKRALEDAIPDLPGDNEVETGQAEKAEKNSKKRKRDGERDAAEAVVQNGQKAKKDKNKRRKIEEAEAAEEVKDAVKAPKKEKKSKKGKASESTEDCEVPKPLKVDTNMAEAPEEPKKTKKERKAERKARQAAETAAKGPDPPSPPETTPQANGDSSKGEEEKKSKKNNRNRDKKRKGTSANGEVSQPEEGKASKAARFIVFIGNLPYTATTESITAHFASVKPKSVRHLTQKDNPSKSKGCAFIEFEGYDHMKTCLKLFHHSTFDDGLSAPRKINVELTAGGGGNTKERKAKIQGKNEKLNEERYRKIQEEAKAKLEKAPEGGKTIDESAIHPSRRGRVPVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.74
3 0.74
4 0.74
5 0.72
6 0.71
7 0.68
8 0.65
9 0.59
10 0.51
11 0.44
12 0.35
13 0.27
14 0.21
15 0.17
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.18
27 0.28
28 0.34
29 0.43
30 0.54
31 0.61
32 0.71
33 0.79
34 0.84
35 0.85
36 0.9
37 0.9
38 0.9
39 0.84
40 0.78
41 0.69
42 0.58
43 0.47
44 0.37
45 0.28
46 0.22
47 0.17
48 0.14
49 0.18
50 0.2
51 0.25
52 0.3
53 0.39
54 0.44
55 0.56
56 0.66
57 0.72
58 0.81
59 0.85
60 0.89
61 0.9
62 0.88
63 0.87
64 0.85
65 0.78
66 0.71
67 0.62
68 0.53
69 0.43
70 0.34
71 0.24
72 0.15
73 0.1
74 0.08
75 0.13
76 0.19
77 0.25
78 0.33
79 0.42
80 0.51
81 0.61
82 0.71
83 0.75
84 0.8
85 0.85
86 0.87
87 0.89
88 0.89
89 0.88
90 0.85
91 0.83
92 0.76
93 0.69
94 0.6
95 0.51
96 0.42
97 0.35
98 0.29
99 0.21
100 0.19
101 0.16
102 0.16
103 0.2
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.28
108 0.26
109 0.25
110 0.24
111 0.2
112 0.21
113 0.21
114 0.22
115 0.17
116 0.23
117 0.29
118 0.39
119 0.48
120 0.55
121 0.61
122 0.7
123 0.79
124 0.85
125 0.89
126 0.89
127 0.9
128 0.89
129 0.82
130 0.73
131 0.64
132 0.56
133 0.5
134 0.41
135 0.32
136 0.24
137 0.2
138 0.18
139 0.17
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.25
147 0.27
148 0.24
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.14
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.14
161 0.19
162 0.27
163 0.34
164 0.44
165 0.52
166 0.6
167 0.69
168 0.77
169 0.82
170 0.84
171 0.88
172 0.89
173 0.91
174 0.91
175 0.89
176 0.88
177 0.82
178 0.8
179 0.77
180 0.74
181 0.66
182 0.57
183 0.49
184 0.4
185 0.35
186 0.27
187 0.19
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.14
203 0.15
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.14
221 0.15
222 0.22
223 0.23
224 0.24
225 0.29
226 0.35
227 0.41
228 0.47
229 0.54
230 0.53
231 0.6
232 0.68
233 0.72
234 0.72
235 0.68
236 0.65
237 0.6
238 0.56
239 0.53
240 0.49
241 0.42
242 0.4
243 0.4
244 0.35
245 0.36
246 0.33
247 0.28
248 0.25
249 0.24
250 0.19
251 0.16
252 0.16
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.18
257 0.19
258 0.25
259 0.3
260 0.35
261 0.37
262 0.37
263 0.38
264 0.35
265 0.33
266 0.27
267 0.22
268 0.2
269 0.19
270 0.2
271 0.18
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.23
276 0.2
277 0.2
278 0.19
279 0.2
280 0.19
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.14
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.22
289 0.24
290 0.3
291 0.39
292 0.49
293 0.53
294 0.62
295 0.7
296 0.74
297 0.82
298 0.8
299 0.78
300 0.72
301 0.72
302 0.71
303 0.67
304 0.63
305 0.6
306 0.64
307 0.57
308 0.59
309 0.56
310 0.54
311 0.56
312 0.56
313 0.58
314 0.55
315 0.54
316 0.52
317 0.5
318 0.44
319 0.4
320 0.41
321 0.35
322 0.34
323 0.34
324 0.31
325 0.3
326 0.29
327 0.27
328 0.22
329 0.2
330 0.25
331 0.32
332 0.31
333 0.32
334 0.34
335 0.4
336 0.46