FuNGI

I2FNR6

Protein Details

Accession

I2FNR6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
310-333	SDAGTKKKSKAKKERKSDDKGSDD	Basic
339-392	IGGKRKRSSSKSSSRKKSKSSKSSSSKSKSKKSSSRSSSRSRSRSRSRSRAASS	Hydrophilic
406-438	SSTSSSTHSRRKSNSKKKRRSNGKSSSANRNSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
315-327	KKKSKAKKERKSD
339-388	IGGKRKRSSSKSSSRKKSKSSKSSSSKSKSKKSSSRSSSRSRSRSRSRSR
415-429	RRKSNSKKKRRSNGK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MPSARASSSSAAGGAKLTKLESALYRAAQSSPGGVITQDQISEQFKTEQLDDQLQAINGLLKKSLFTAQTLNGSIQFAATAKAEASMMGKLDENETMVYQHIKDSRNEGIWTKQLKVRTGLHQTIINRCLKSLEQKQLVKAVKSVKYPTRKIYMLYGLTPSIELSGGPWYTDNELDTGFINELSMAILNFIRSKSFPKNGQSRALFPTSHTSQLPSANAVHSYLRNSGLTETQLEVEHVVSLLDILVYDEQIEKIPVLPFSLGGRGMNGFDEDDEDYTDSGTSSGGSGSDSDSESGSDSKSEAEETGSDSDAGTKKKSKAKKERKSDDKGSDDDDGPVIGGKRKRSSSKSSSRKKSKSSKSSSSKSKSKKSSSRSSSRSRSRSRSRSRAASSSDSESGSESEASDSSTSSSTHSRRKSNSKKKRRSNGKSSSANRNSAAGGGDLVPFVYRAIRPHAVKVGWTETPCGHCPVFDFCDDTGPVNAESCQYYGGKTDEFGRKLKNGWIDTIVDDDNDEEDEEGENGGEREDANDEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.15
3	0.14
4	0.14
5	0.13
6	0.14
7	0.16
8	0.17
9	0.2
10	0.23
11	0.23
12	0.24
13	0.24
14	0.24
15	0.24
16	0.22
17	0.18
18	0.15
19	0.15
20	0.13
21	0.12
22	0.13
23	0.13
24	0.14
25	0.12
26	0.12
27	0.14
28	0.17
29	0.18
30	0.19
31	0.19
32	0.2
33	0.22
34	0.23
35	0.25
36	0.27
37	0.3
38	0.28
39	0.28
40	0.28
41	0.25
42	0.23
43	0.19
44	0.19
45	0.16
46	0.16
47	0.15
48	0.13
49	0.14
50	0.16
51	0.2
52	0.17
53	0.17
54	0.21
55	0.23
56	0.27
57	0.28
58	0.27
59	0.24
60	0.23
61	0.21
62	0.17
63	0.14
64	0.1
65	0.1
66	0.1
67	0.09
68	0.08
69	0.09
70	0.09
71	0.08
72	0.1
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.1
78	0.12
79	0.12
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.11
87	0.15
88	0.2
89	0.22
90	0.23
91	0.27
92	0.31
93	0.32
94	0.34
95	0.32
96	0.31
97	0.36
98	0.37
99	0.36
100	0.34
101	0.35
102	0.36
103	0.39
104	0.39
105	0.4
106	0.46
107	0.45
108	0.44
109	0.44
110	0.44
111	0.46
112	0.47
113	0.44
114	0.35
115	0.33
116	0.33
117	0.31
118	0.37
119	0.38
120	0.42
121	0.45
122	0.47
123	0.49
124	0.55
125	0.56
126	0.48
127	0.44
128	0.43
129	0.39
130	0.4
131	0.45
132	0.44
133	0.5
134	0.53
135	0.54
136	0.53
137	0.49
138	0.47
139	0.46
140	0.45
141	0.38
142	0.35
143	0.31
144	0.25
145	0.24
146	0.22
147	0.17
148	0.1
149	0.08
150	0.06
151	0.05
152	0.09
153	0.08
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.11
158	0.12
159	0.11
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.04
174	0.05
175	0.05
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.09
180	0.14
181	0.2
182	0.26
183	0.31
184	0.37
185	0.46
186	0.49
187	0.56
188	0.53
189	0.5
190	0.48
191	0.46
192	0.38
193	0.3
194	0.33
195	0.27
196	0.28
197	0.24
198	0.22
199	0.21
200	0.24
201	0.23
202	0.18
203	0.17
204	0.14
205	0.15
206	0.14
207	0.13
208	0.12
209	0.13
210	0.13
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.03
230	0.03
231	0.02
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.08
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.12
298	0.14
299	0.15
300	0.16
301	0.2
302	0.25
303	0.33
304	0.4
305	0.48
306	0.56
307	0.66
308	0.74
309	0.8
310	0.85
311	0.87
312	0.88
313	0.86
314	0.83
315	0.76
316	0.68
317	0.6
318	0.52
319	0.43
320	0.35
321	0.26
322	0.17
323	0.13
324	0.12
325	0.1
326	0.12
327	0.14
328	0.17
329	0.22
330	0.28
331	0.34
332	0.39
333	0.47
334	0.53
335	0.61
336	0.67
337	0.73
338	0.79
339	0.83
340	0.84
341	0.84
342	0.85
343	0.85
344	0.85
345	0.83
346	0.83
347	0.82
348	0.83
349	0.84
350	0.81
351	0.8
352	0.78
353	0.78
354	0.77
355	0.78
356	0.78
357	0.76
358	0.79
359	0.79
360	0.8
361	0.78
362	0.78
363	0.78
364	0.79
365	0.81
366	0.78
367	0.79
368	0.8
369	0.84
370	0.84
371	0.85
372	0.82
373	0.82
374	0.79
375	0.75
376	0.7
377	0.65
378	0.58
379	0.53
380	0.47
381	0.38
382	0.33
383	0.28
384	0.23
385	0.18
386	0.15
387	0.11
388	0.1
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.18
398	0.23
399	0.31
400	0.38
401	0.44
402	0.51
403	0.62
404	0.71
405	0.75
406	0.81
407	0.84
408	0.88
409	0.92
410	0.95
411	0.95
412	0.94
413	0.93
414	0.93
415	0.91
416	0.91
417	0.86
418	0.86
419	0.81
420	0.75
421	0.65
422	0.56
423	0.46
424	0.37
425	0.32
426	0.21
427	0.15
428	0.12
429	0.11
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.09
436	0.09
437	0.12
438	0.19
439	0.26
440	0.27
441	0.32
442	0.38
443	0.35
444	0.36
445	0.38
446	0.36
447	0.33
448	0.32
449	0.31
450	0.28
451	0.32
452	0.32
453	0.33
454	0.28
455	0.24
456	0.25
457	0.29
458	0.29
459	0.25
460	0.26
461	0.22
462	0.27
463	0.27
464	0.27
465	0.22
466	0.21
467	0.2
468	0.18
469	0.18
470	0.15
471	0.15
472	0.14
473	0.15
474	0.13
475	0.14
476	0.16
477	0.18
478	0.17
479	0.17
480	0.24
481	0.3
482	0.33
483	0.36
484	0.38
485	0.39
486	0.41
487	0.46
488	0.47
489	0.41
490	0.41
491	0.41
492	0.38
493	0.36
494	0.37
495	0.31
496	0.22
497	0.2
498	0.17
499	0.14
500	0.13
501	0.12
502	0.09
503	0.09
504	0.1
505	0.1
506	0.09
507	0.08
508	0.09
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.07
513	0.09

I2FNR6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer