Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6RYQ3

Protein Details
Accession A0A2J6RYQ3    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-306TTTTNGGRRKKRKGALTNPSSYHydrophilic
370-390GNYTMSGRKHVKKGKYQSGMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-297RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKKWIDKKTATHFTLVHRPQNDPLIHDESASSMVLNPTPLPNSNKVKKLDDLASELGSDVEKIRENEGEAANYGIYYDDSEYDYMQHMRDLGSGSGEAYFVEAQAPKNKGKGKQSLEDALKDASLEDGKGPLLDEEILPSKNLRNVTYQAQQDIPDALAGFQPDMDPRIREVLEALEDEAYVDEDEDIFGELAKDGEEVEEDEFEQEAWDDEDGGWESDDTAKPTKEYKDAPVLTAEMVDDEREDHGDGAWMQDFSKFKKDQKANKATPLAPSPSDLQSSIMTTTTNGGRRKKRKGALTNPSSYSMTSSSMFRTEGLTTLDARFEKLEEQYNEDFDDMASVSAASSTASSVQGPVRGDFDNIMDDFLGNYTMSGRKHVKKGKYQSGMEQLDEVRKGLGPARIRTQKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.55
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.4
14 0.38
15 0.35
16 0.31
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.15
21 0.1
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.17
28 0.22
29 0.25
30 0.33
31 0.42
32 0.48
33 0.54
34 0.56
35 0.58
36 0.57
37 0.57
38 0.54
39 0.48
40 0.46
41 0.4
42 0.36
43 0.32
44 0.28
45 0.22
46 0.17
47 0.14
48 0.1
49 0.1
50 0.13
51 0.15
52 0.17
53 0.18
54 0.2
55 0.24
56 0.24
57 0.23
58 0.2
59 0.19
60 0.17
61 0.15
62 0.13
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.08
91 0.1
92 0.11
93 0.18
94 0.21
95 0.21
96 0.28
97 0.33
98 0.37
99 0.44
100 0.51
101 0.5
102 0.53
103 0.57
104 0.59
105 0.56
106 0.51
107 0.45
108 0.36
109 0.3
110 0.23
111 0.18
112 0.12
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.08
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.15
131 0.18
132 0.17
133 0.18
134 0.21
135 0.26
136 0.31
137 0.31
138 0.29
139 0.28
140 0.27
141 0.24
142 0.22
143 0.17
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.16
214 0.18
215 0.2
216 0.22
217 0.23
218 0.3
219 0.3
220 0.3
221 0.28
222 0.26
223 0.22
224 0.2
225 0.16
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.11
243 0.12
244 0.14
245 0.22
246 0.23
247 0.27
248 0.37
249 0.45
250 0.51
251 0.61
252 0.69
253 0.65
254 0.7
255 0.71
256 0.63
257 0.58
258 0.52
259 0.44
260 0.34
261 0.32
262 0.27
263 0.24
264 0.24
265 0.2
266 0.18
267 0.15
268 0.16
269 0.15
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.12
274 0.14
275 0.2
276 0.25
277 0.33
278 0.43
279 0.51
280 0.61
281 0.68
282 0.71
283 0.75
284 0.79
285 0.82
286 0.83
287 0.82
288 0.78
289 0.71
290 0.67
291 0.57
292 0.47
293 0.39
294 0.29
295 0.23
296 0.19
297 0.18
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.15
302 0.16
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.2
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.16
315 0.17
316 0.25
317 0.23
318 0.29
319 0.3
320 0.3
321 0.3
322 0.28
323 0.25
324 0.16
325 0.16
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.12
341 0.16
342 0.17
343 0.17
344 0.19
345 0.19
346 0.2
347 0.18
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.16
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.11
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.13
361 0.14
362 0.21
363 0.28
364 0.35
365 0.45
366 0.54
367 0.6
368 0.67
369 0.77
370 0.8
371 0.81
372 0.78
373 0.76
374 0.78
375 0.72
376 0.62
377 0.55
378 0.47
379 0.43
380 0.41
381 0.33
382 0.24
383 0.21
384 0.22
385 0.23
386 0.27
387 0.28
388 0.33
389 0.43