Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6RIK5

Protein Details
Accession A0A2J6RIK5    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-296LSTTRKTPPRPKPVLRKEDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-372PKRPKKIGAIGAKK
417-444VIRPRKKLGRIGGNKEPPPPEPEPEPER
448-477PPPARTTPAAQAPQPKKGKLGQIGGKKRRA
526-576ESRGRASAKPEREKTPPPRETSEERADKKRLQLKRELEEKAKAPVKKKKKF
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto_mito 8.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAWRALPLSASAGAQLPALFISEAFTPSSYTIQLTDLTHIWRESLDRRAIVRRSRQEGTSIDPSDGTDQLQIFLNKLKVGLAGGKDTALALTIAAGPDRPSLVLNIIVKLPGGLAPLQWPIQLDAAPESLMTSHFTVPLLKAQHASTQDFASLTEVVKEKDHVIQKLLDKLEGQGTELGQIFPQAAGRAGRKVDRKMAEERVKGLGPFDLAAWRRSTHHETSRDIAGLVGEVFAGDNAASSRADGDAPTEEESDIWWESIKGITINLATGKISTNGLSTTRKTPPRPKPVLRKEDTIEDDDAFQVQATPPHLVQSPKRVASKPVIDNSTDDDDDLDVPTQHSKIPDSFPVSPPQAVPSPKRPKKIGAIGAKKAALKLDTPDEESTVDEASSLHRLSADGSTASETPPPPPPPPSEPVIRPRKKLGRIGGNKEPPPPEPEPEPERDISPPPARTTPAAQAPQPKKGKLGQIGGKKRRAETPPPAEEEHAQPETSKTATTPKRKLGVIGNRHQSPAAKKENSPLIAEESRGRASAKPEREKTPPPRETSEERADKKRLQLKRELEEKAKAPVKKKKKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.1
4 0.08
5 0.1
6 0.08
7 0.07
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.15
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.19
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.2
28 0.18
29 0.22
30 0.23
31 0.29
32 0.31
33 0.32
34 0.36
35 0.44
36 0.51
37 0.55
38 0.61
39 0.62
40 0.64
41 0.64
42 0.62
43 0.59
44 0.54
45 0.52
46 0.51
47 0.43
48 0.37
49 0.33
50 0.33
51 0.3
52 0.28
53 0.22
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.2
58 0.19
59 0.17
60 0.21
61 0.22
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.14
66 0.16
67 0.19
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.09
76 0.07
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.11
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.1
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.18
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.23
131 0.25
132 0.27
133 0.23
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.18
138 0.15
139 0.13
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.14
147 0.2
148 0.25
149 0.23
150 0.24
151 0.28
152 0.3
153 0.36
154 0.35
155 0.29
156 0.24
157 0.24
158 0.26
159 0.21
160 0.19
161 0.14
162 0.13
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.09
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.08
171 0.06
172 0.07
173 0.1
174 0.11
175 0.14
176 0.16
177 0.21
178 0.26
179 0.29
180 0.35
181 0.36
182 0.39
183 0.42
184 0.5
185 0.53
186 0.49
187 0.48
188 0.43
189 0.4
190 0.36
191 0.31
192 0.21
193 0.14
194 0.12
195 0.1
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.15
201 0.17
202 0.22
203 0.28
204 0.29
205 0.36
206 0.39
207 0.4
208 0.42
209 0.42
210 0.37
211 0.31
212 0.24
213 0.16
214 0.12
215 0.09
216 0.06
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.02
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.17
267 0.23
268 0.28
269 0.34
270 0.43
271 0.51
272 0.59
273 0.66
274 0.69
275 0.74
276 0.78
277 0.83
278 0.76
279 0.7
280 0.61
281 0.59
282 0.53
283 0.45
284 0.35
285 0.26
286 0.23
287 0.19
288 0.17
289 0.11
290 0.08
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.12
299 0.14
300 0.15
301 0.22
302 0.26
303 0.29
304 0.33
305 0.32
306 0.34
307 0.37
308 0.42
309 0.39
310 0.38
311 0.36
312 0.33
313 0.33
314 0.33
315 0.31
316 0.23
317 0.18
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.09
323 0.06
324 0.06
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.12
331 0.15
332 0.18
333 0.23
334 0.25
335 0.25
336 0.29
337 0.29
338 0.27
339 0.25
340 0.24
341 0.23
342 0.24
343 0.26
344 0.32
345 0.42
346 0.47
347 0.52
348 0.52
349 0.52
350 0.57
351 0.61
352 0.6
353 0.58
354 0.61
355 0.58
356 0.59
357 0.56
358 0.48
359 0.4
360 0.33
361 0.23
362 0.16
363 0.16
364 0.18
365 0.18
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.19
371 0.17
372 0.12
373 0.11
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.1
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.08
386 0.09
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.13
391 0.12
392 0.14
393 0.2
394 0.23
395 0.23
396 0.27
397 0.31
398 0.34
399 0.37
400 0.38
401 0.37
402 0.39
403 0.47
404 0.54
405 0.55
406 0.53
407 0.59
408 0.64
409 0.65
410 0.67
411 0.66
412 0.66
413 0.7
414 0.74
415 0.74
416 0.73
417 0.69
418 0.66
419 0.6
420 0.51
421 0.49
422 0.44
423 0.38
424 0.34
425 0.38
426 0.39
427 0.41
428 0.43
429 0.37
430 0.36
431 0.35
432 0.34
433 0.35
434 0.36
435 0.34
436 0.34
437 0.36
438 0.36
439 0.36
440 0.37
441 0.35
442 0.37
443 0.37
444 0.36
445 0.44
446 0.46
447 0.53
448 0.55
449 0.49
450 0.45
451 0.48
452 0.53
453 0.5
454 0.54
455 0.52
456 0.57
457 0.67
458 0.71
459 0.73
460 0.69
461 0.64
462 0.64
463 0.63
464 0.62
465 0.62
466 0.63
467 0.62
468 0.63
469 0.63
470 0.57
471 0.53
472 0.48
473 0.44
474 0.35
475 0.29
476 0.25
477 0.24
478 0.24
479 0.22
480 0.19
481 0.13
482 0.22
483 0.31
484 0.4
485 0.46
486 0.51
487 0.56
488 0.57
489 0.6
490 0.6
491 0.61
492 0.61
493 0.63
494 0.64
495 0.6
496 0.6
497 0.58
498 0.53
499 0.49
500 0.48
501 0.49
502 0.45
503 0.45
504 0.51
505 0.58
506 0.55
507 0.51
508 0.44
509 0.41
510 0.38
511 0.38
512 0.34
513 0.3
514 0.29
515 0.28
516 0.27
517 0.23
518 0.29
519 0.37
520 0.43
521 0.5
522 0.54
523 0.59
524 0.65
525 0.72
526 0.74
527 0.76
528 0.74
529 0.7
530 0.71
531 0.72
532 0.72
533 0.7
534 0.7
535 0.69
536 0.68
537 0.69
538 0.69
539 0.67
540 0.7
541 0.7
542 0.67
543 0.64
544 0.68
545 0.69
546 0.72
547 0.75
548 0.73
549 0.7
550 0.69
551 0.65
552 0.64
553 0.63
554 0.59
555 0.6
556 0.63