Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6RXD7

Protein Details
Accession A0A2J6RXD7    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAEPPHKRARRPDSKQMWDDSHydrophilic
34-75EPAPRDRDRRDDRRDDRDRDRDRRYRSRSPRREDRGGRRDDRBasic
124-148GERDRERSRSPRREREREREREREPBasic
198-224LDSGEGKKDKKKGKKAKAKEKLEAQEDBasic
259-279IYAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-153PLPSRERDEPAPRDRDRRDDRRDDRDRDRDRRYRSRSPRREDRGGRRDDRDRRGGGRGRDERDEDRRGGRGEDRGGRRDRERERERDRDTGRERERRGGERDRERSRSPRREREREREREREPEKEKR
203-218GKKDKKKGKKAKAKEK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPHKRARRPDSKQMWDDSDRRAPLPSRERDEPAPRDRDRRDDRRDDRDRDRDRRYRSRSPRREDRGGRRDDRDRRGGGRGRDERDEDRRGGRGEDRGGRRDRERERERDRDTGRERERRGGERDRERSRSPRREREREREREREPEKEKRVEAKVLVEEEFTKSRTATPPVSFKVGEKVAGGAAGQGQDHDRMELDSGEGKKDKKKGKKAKAKEKLEAQEDEDIMVDDDGLADMQAMMGFGGFGTTHQQKVSGNDIYAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPTRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.84
3 0.8
4 0.76
5 0.71
6 0.66
7 0.63
8 0.6
9 0.52
10 0.48
11 0.46
12 0.43
13 0.46
14 0.52
15 0.53
16 0.52
17 0.55
18 0.59
19 0.62
20 0.68
21 0.66
22 0.65
23 0.66
24 0.63
25 0.67
26 0.66
27 0.68
28 0.69
29 0.71
30 0.72
31 0.74
32 0.77
33 0.79
34 0.85
35 0.82
36 0.82
37 0.82
38 0.82
39 0.8
40 0.83
41 0.8
42 0.8
43 0.83
44 0.82
45 0.82
46 0.84
47 0.86
48 0.86
49 0.87
50 0.89
51 0.87
52 0.88
53 0.87
54 0.87
55 0.85
56 0.84
57 0.8
58 0.76
59 0.77
60 0.76
61 0.73
62 0.7
63 0.64
64 0.58
65 0.61
66 0.61
67 0.56
68 0.58
69 0.57
70 0.54
71 0.54
72 0.55
73 0.52
74 0.52
75 0.51
76 0.43
77 0.39
78 0.38
79 0.35
80 0.34
81 0.31
82 0.29
83 0.3
84 0.35
85 0.37
86 0.4
87 0.42
88 0.43
89 0.44
90 0.49
91 0.51
92 0.54
93 0.56
94 0.6
95 0.64
96 0.7
97 0.7
98 0.7
99 0.66
100 0.64
101 0.62
102 0.63
103 0.63
104 0.61
105 0.59
106 0.58
107 0.6
108 0.56
109 0.57
110 0.57
111 0.57
112 0.58
113 0.65
114 0.63
115 0.63
116 0.62
117 0.65
118 0.66
119 0.69
120 0.68
121 0.7
122 0.73
123 0.79
124 0.84
125 0.85
126 0.85
127 0.84
128 0.83
129 0.81
130 0.74
131 0.73
132 0.67
133 0.65
134 0.61
135 0.6
136 0.59
137 0.55
138 0.54
139 0.5
140 0.5
141 0.44
142 0.39
143 0.32
144 0.28
145 0.25
146 0.23
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.16
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.13
155 0.15
156 0.19
157 0.2
158 0.22
159 0.27
160 0.28
161 0.31
162 0.29
163 0.27
164 0.28
165 0.25
166 0.22
167 0.17
168 0.16
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.12
187 0.12
188 0.15
189 0.17
190 0.19
191 0.24
192 0.32
193 0.4
194 0.46
195 0.56
196 0.64
197 0.73
198 0.82
199 0.87
200 0.91
201 0.92
202 0.9
203 0.86
204 0.84
205 0.8
206 0.74
207 0.66
208 0.57
209 0.51
210 0.43
211 0.36
212 0.27
213 0.2
214 0.15
215 0.13
216 0.1
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218 0.05
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220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.1
235 0.13
236 0.14
237 0.15
238 0.17
239 0.18
240 0.22
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242 0.25
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245 0.29
246 0.31
247 0.34
248 0.37
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250 0.37
251 0.41
252 0.46
253 0.54
254 0.6
255 0.66
256 0.69
257 0.74
258 0.78
259 0.83
260 0.82
261 0.78
262 0.72
263 0.65
264 0.57
265 0.54
266 0.5
267 0.45
268 0.41
269 0.38