Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0T1C6

Protein Details
Accession G0T1C6    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-397KEESEGRRKKRVRQMVRKGARVDBasic
409-435EVEGGRKKASPKKRGRKKKAARASDAEBasic
569-590SSPAPASPKRRGRQPKATSTSAHydrophilic
594-616SDDPPFPPKKRRTKAATASTPTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
373-393RRKEESEGRRKKRVRQMVRKG
413-470GRKKASPKKRGRKKKAARASDAEKPAKKSRARAGAKVKKTPTKTRAATSKKGKGKAKA
561-584KSRAKKAISSPAPASPKRRGRQPK
667-676KAASPKATKK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MPRASSPALAARRSSYPSTSTSALSTILNHSIPPFYACYLLKSYNVKRPNMTYIGSTPDPPRRFKQHMGDRIGGALQTRFGRPWEMEAIVHGFPSKLQALQFEWCWQNPESSRLLRQPAPPPDLNPDADPSLAPKKRKTTSTAPPKTVPQFPRRVMSHRALPRIQVLQYMLTVPPWSRFDLSVTLFSEQAREWWDEGRRLGPVVRTEAELKKWEKQRREDEDAWGVEKGRKLDSVKVHYREEGVDGERLVRAKKQKEGEGIERMRVDDDDFFHFHWDKFLSLSSSNDSPDCYICRKPIDTEDHLSFHLCTALPSTPASSPCLATFHPLCLSTHFLSTTTSSSSSSAPLLPTTSSCPSCLSDLHWTDLVRGMYRRKEESEGRRKKRVRQMVRKGARVDEDEGIEGEEDEEVEGGRKKASPKKRGRKKKAARASDAEKPAKKSRARAGAKVKKTPTKTRAATSKKGKGKAKAASPASSDAGEGFYFSDMPSDADLNAGDAGAAPDEDVRFDFDEDDSDVERSFVRMDAAIDANLADGALFSGDQEAGDLDLQEAIAAFAPANKSRAKKAISSPAPASPKRRGRQPKATSTSAATLSDDPPFPPKKRRTKAATASTPTSATLLASFSTTKATIATTKPKKGVAQSASLSLSGSEEDLPPPVALGKTVAKKAASPKATKKKAVAYVGLSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.35
3 0.33
4 0.34
5 0.37
6 0.35
7 0.32
8 0.28
9 0.26
10 0.24
11 0.21
12 0.2
13 0.19
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.19
21 0.18
22 0.15
23 0.2
24 0.2
25 0.23
26 0.27
27 0.29
28 0.31
29 0.38
30 0.43
31 0.47
32 0.54
33 0.54
34 0.53
35 0.56
36 0.58
37 0.54
38 0.49
39 0.44
40 0.39
41 0.43
42 0.39
43 0.37
44 0.36
45 0.41
46 0.44
47 0.45
48 0.5
49 0.52
50 0.58
51 0.64
52 0.68
53 0.69
54 0.74
55 0.76
56 0.72
57 0.63
58 0.58
59 0.5
60 0.39
61 0.3
62 0.21
63 0.18
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.22
69 0.21
70 0.25
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.24
75 0.26
76 0.22
77 0.22
78 0.18
79 0.13
80 0.12
81 0.16
82 0.14
83 0.12
84 0.13
85 0.16
86 0.18
87 0.22
88 0.23
89 0.25
90 0.27
91 0.26
92 0.29
93 0.27
94 0.31
95 0.29
96 0.32
97 0.32
98 0.33
99 0.38
100 0.39
101 0.44
102 0.42
103 0.47
104 0.52
105 0.54
106 0.57
107 0.53
108 0.5
109 0.51
110 0.5
111 0.46
112 0.38
113 0.33
114 0.27
115 0.26
116 0.23
117 0.21
118 0.27
119 0.3
120 0.33
121 0.36
122 0.43
123 0.49
124 0.54
125 0.56
126 0.55
127 0.61
128 0.68
129 0.71
130 0.68
131 0.65
132 0.67
133 0.65
134 0.65
135 0.62
136 0.59
137 0.59
138 0.57
139 0.62
140 0.59
141 0.59
142 0.57
143 0.55
144 0.55
145 0.53
146 0.57
147 0.5
148 0.48
149 0.47
150 0.45
151 0.4
152 0.33
153 0.27
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.16
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.16
165 0.17
166 0.19
167 0.23
168 0.24
169 0.24
170 0.24
171 0.23
172 0.22
173 0.21
174 0.2
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.18
181 0.22
182 0.23
183 0.25
184 0.25
185 0.22
186 0.22
187 0.23
188 0.21
189 0.21
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.25
194 0.27
195 0.28
196 0.31
197 0.31
198 0.34
199 0.42
200 0.48
201 0.52
202 0.58
203 0.65
204 0.67
205 0.74
206 0.68
207 0.65
208 0.63
209 0.56
210 0.48
211 0.39
212 0.31
213 0.25
214 0.25
215 0.21
216 0.16
217 0.19
218 0.2
219 0.25
220 0.32
221 0.38
222 0.44
223 0.46
224 0.46
225 0.43
226 0.43
227 0.37
228 0.32
229 0.26
230 0.19
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.13
237 0.15
238 0.21
239 0.24
240 0.3
241 0.34
242 0.38
243 0.43
244 0.48
245 0.49
246 0.51
247 0.48
248 0.45
249 0.4
250 0.36
251 0.3
252 0.25
253 0.2
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.18
260 0.19
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.17
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.27
285 0.31
286 0.32
287 0.34
288 0.34
289 0.32
290 0.31
291 0.3
292 0.24
293 0.17
294 0.14
295 0.1
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.14
309 0.12
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.17
318 0.14
319 0.15
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.11
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.15
347 0.19
348 0.19
349 0.2
350 0.21
351 0.2
352 0.19
353 0.23
354 0.2
355 0.15
356 0.16
357 0.18
358 0.21
359 0.23
360 0.25
361 0.23
362 0.28
363 0.34
364 0.43
365 0.5
366 0.57
367 0.6
368 0.68
369 0.69
370 0.74
371 0.76
372 0.76
373 0.76
374 0.76
375 0.81
376 0.82
377 0.85
378 0.81
379 0.73
380 0.65
381 0.57
382 0.48
383 0.4
384 0.3
385 0.24
386 0.19
387 0.17
388 0.15
389 0.12
390 0.09
391 0.06
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.1
402 0.15
403 0.24
404 0.34
405 0.44
406 0.54
407 0.64
408 0.75
409 0.84
410 0.89
411 0.92
412 0.92
413 0.93
414 0.92
415 0.89
416 0.85
417 0.8
418 0.74
419 0.71
420 0.68
421 0.64
422 0.56
423 0.53
424 0.53
425 0.55
426 0.53
427 0.51
428 0.51
429 0.55
430 0.56
431 0.59
432 0.64
433 0.66
434 0.69
435 0.7
436 0.68
437 0.65
438 0.67
439 0.69
440 0.64
441 0.64
442 0.61
443 0.6
444 0.64
445 0.64
446 0.67
447 0.66
448 0.69
449 0.67
450 0.72
451 0.71
452 0.68
453 0.68
454 0.66
455 0.63
456 0.62
457 0.58
458 0.53
459 0.49
460 0.45
461 0.38
462 0.32
463 0.25
464 0.17
465 0.15
466 0.12
467 0.1
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.08
494 0.09
495 0.1
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.13
501 0.12
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.08
519 0.07
520 0.04
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.04
540 0.04
541 0.05
542 0.04
543 0.06
544 0.1
545 0.11
546 0.14
547 0.18
548 0.21
549 0.26
550 0.33
551 0.34
552 0.38
553 0.44
554 0.52
555 0.53
556 0.56
557 0.54
558 0.54
559 0.59
560 0.57
561 0.55
562 0.54
563 0.59
564 0.59
565 0.66
566 0.7
567 0.72
568 0.79
569 0.82
570 0.83
571 0.8
572 0.79
573 0.71
574 0.64
575 0.58
576 0.48
577 0.4
578 0.31
579 0.26
580 0.24
581 0.25
582 0.22
583 0.19
584 0.25
585 0.31
586 0.33
587 0.41
588 0.49
589 0.57
590 0.66
591 0.74
592 0.76
593 0.8
594 0.85
595 0.86
596 0.86
597 0.81
598 0.76
599 0.68
600 0.6
601 0.49
602 0.4
603 0.29
604 0.2
605 0.14
606 0.11
607 0.09
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.13
612 0.13
613 0.12
614 0.12
615 0.14
616 0.17
617 0.23
618 0.33
619 0.39
620 0.45
621 0.48
622 0.52
623 0.55
624 0.56
625 0.6
626 0.54
627 0.53
628 0.48
629 0.49
630 0.46
631 0.41
632 0.35
633 0.25
634 0.21
635 0.14
636 0.13
637 0.1
638 0.1
639 0.11
640 0.12
641 0.14
642 0.12
643 0.12
644 0.14
645 0.12
646 0.12
647 0.15
648 0.21
649 0.25
650 0.29
651 0.32
652 0.31
653 0.35
654 0.43
655 0.49
656 0.49
657 0.51
658 0.59
659 0.67
660 0.75
661 0.76
662 0.74
663 0.74
664 0.75
665 0.73
666 0.67