Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R1R6

Protein Details
Accession C4R1R6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-109PPGRGEHKFSRRKLRPQKGSGRARVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-107GRGEHKFSRRKLRPQKGSGRAR
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 10, nucl 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002136  Ribosomal_L4/L1e  
IPR023574  Ribosomal_L4_dom_sf  
IPR013005  Ribosomal_uL4/L1e  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0890  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00573  Ribosomal_L4  
Amino Acid Sequences MPITQMMVLRGLQVGFREYSTSLVNAISNAPTYLLSTVRSFPSLEPHTVLPISTEFLNSPLRRDLLWKAVVMEFDNIRVGASNPPGRGEHKFSRRKLRPQKGSGRARVGDANSPTRHNGARALARNAPNDFSTDLPFKVYARAYRIALSSFYIKGHLHIIGGCSSLIPFNRGDQNILELSTDKKEALEIFQAIHNLKGLNILFISDSLNNSQNLNKAIQALNDDQISLLDKENVEVRHLLKANRVFIDQASLQFFAKEFAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.14
6 0.16
7 0.17
8 0.16
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.12
13 0.13
14 0.12
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.18
28 0.17
29 0.25
30 0.27
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.27
35 0.26
36 0.25
37 0.17
38 0.15
39 0.14
40 0.12
41 0.13
42 0.1
43 0.13
44 0.21
45 0.19
46 0.21
47 0.23
48 0.23
49 0.22
50 0.26
51 0.27
52 0.26
53 0.28
54 0.25
55 0.25
56 0.25
57 0.26
58 0.23
59 0.22
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.15
69 0.18
70 0.18
71 0.2
72 0.21
73 0.24
74 0.26
75 0.31
76 0.34
77 0.41
78 0.49
79 0.53
80 0.63
81 0.68
82 0.75
83 0.79
84 0.81
85 0.8
86 0.81
87 0.86
88 0.85
89 0.86
90 0.81
91 0.75
92 0.65
93 0.57
94 0.51
95 0.42
96 0.36
97 0.3
98 0.3
99 0.25
100 0.26
101 0.25
102 0.24
103 0.23
104 0.2
105 0.2
106 0.18
107 0.22
108 0.24
109 0.26
110 0.29
111 0.32
112 0.33
113 0.31
114 0.28
115 0.23
116 0.21
117 0.18
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.2
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.1
157 0.16
158 0.16
159 0.18
160 0.16
161 0.19
162 0.18
163 0.18
164 0.15
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.11
183 0.11
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.13
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.18
199 0.2
200 0.21
201 0.21
202 0.19
203 0.2
204 0.2
205 0.21
206 0.23
207 0.21
208 0.22
209 0.21
210 0.2
211 0.17
212 0.16
213 0.18
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.19
220 0.2
221 0.19
222 0.21
223 0.21
224 0.27
225 0.3
226 0.3
227 0.33
228 0.39
229 0.42
230 0.41
231 0.41
232 0.34
233 0.31
234 0.36
235 0.3
236 0.27
237 0.25
238 0.24
239 0.23
240 0.22
241 0.22