Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6Q3M6

Protein Details
Accession A0A2J6Q3M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
494-515IGHKHQSPATKKKRLSQPEELEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-287KTPPKPKPA
410-428EKPQRKLGRIGGKKEAPPP
441-475PPAKTIPAPETVKPKKGKLGQIGAKNRRAETPPPT
478-508APEASKTETPKRKLGAIGHKHQSPATKKKRL
536-565SEERADRKRQELKRELEEKAKAPVKKKRKF
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 13.333, nucl 11, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAWKPLRISPSAAGHLPPLLISQSFRPSSYTVQLTDLTYIWSESLDRRGIIRRSREQNTSIDPSDGDQMQIFLDKVKSGLAGGKDTTLALTISADRPSLVLNINVKLPGGLDPLEWPIQLAAAPQSLMTSQFTIPLLKAQHAKVQDIESLAEVVKEKDHVIQKLLDKLEGQGTELGQIFPQAAGRVGRKVDRKQAVERVKGLGQFNMDAWRKSRDHEILRDAAGLSGDVFGGNSAEGFEVEISSPATEESEHWWESIKGITINLDTGKFSTNGLSGARKTPPKPKPALKKEETIEDDDAFQVQVTPPRLTRSPKRTPSKVVIDDSTDDDELDAPTQRSKIPDSFPISSPPVASSSKKTKKLGSVGAKKAAAKIDPPDEEITEDEASPPHISDGDKSTASPTPPPEKTVPEKPQRKLGRIGGKKEAPPPEPELEAERDTPPPPAKTIPAPETVKPKKGKLGQIGAKNRRAETPPPTEEAPEASKTETPKRKLGAIGHKHQSPATKKKRLSQPEELEIRGRTSVNPEKEKTPQPRETSEERADRKRQELKRELEEKAKAPVKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.27
4 0.21
5 0.16
6 0.13
7 0.13
8 0.14
9 0.17
10 0.24
11 0.25
12 0.26
13 0.27
14 0.28
15 0.32
16 0.37
17 0.37
18 0.3
19 0.32
20 0.33
21 0.31
22 0.3
23 0.25
24 0.2
25 0.17
26 0.16
27 0.13
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.18
32 0.19
33 0.19
34 0.22
35 0.3
36 0.37
37 0.43
38 0.5
39 0.54
40 0.6
41 0.66
42 0.69
43 0.64
44 0.63
45 0.62
46 0.6
47 0.52
48 0.44
49 0.38
50 0.34
51 0.35
52 0.29
53 0.22
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.15
58 0.13
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.16
73 0.16
74 0.12
75 0.1
76 0.07
77 0.08
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.12
87 0.15
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.15
101 0.16
102 0.14
103 0.13
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.22
126 0.21
127 0.26
128 0.26
129 0.28
130 0.26
131 0.27
132 0.25
133 0.22
134 0.21
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.14
145 0.2
146 0.2
147 0.22
148 0.26
149 0.29
150 0.34
151 0.34
152 0.29
153 0.24
154 0.24
155 0.26
156 0.21
157 0.19
158 0.14
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.07
167 0.08
168 0.06
169 0.07
170 0.1
171 0.11
172 0.14
173 0.16
174 0.21
175 0.27
176 0.32
177 0.39
178 0.44
179 0.47
180 0.5
181 0.58
182 0.6
183 0.57
184 0.54
185 0.49
186 0.44
187 0.43
188 0.39
189 0.3
190 0.23
191 0.2
192 0.19
193 0.23
194 0.22
195 0.19
196 0.2
197 0.24
198 0.24
199 0.25
200 0.31
201 0.31
202 0.35
203 0.38
204 0.41
205 0.37
206 0.37
207 0.36
208 0.29
209 0.22
210 0.17
211 0.12
212 0.08
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.09
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.11
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.11
262 0.1
263 0.13
264 0.16
265 0.19
266 0.22
267 0.31
268 0.36
269 0.41
270 0.47
271 0.52
272 0.59
273 0.65
274 0.72
275 0.65
276 0.65
277 0.59
278 0.59
279 0.53
280 0.46
281 0.38
282 0.29
283 0.26
284 0.2
285 0.19
286 0.12
287 0.1
288 0.06
289 0.05
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.16
295 0.19
296 0.24
297 0.32
298 0.37
299 0.45
300 0.54
301 0.61
302 0.62
303 0.65
304 0.67
305 0.67
306 0.62
307 0.55
308 0.46
309 0.4
310 0.37
311 0.34
312 0.28
313 0.2
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.12
325 0.15
326 0.18
327 0.19
328 0.26
329 0.3
330 0.32
331 0.32
332 0.35
333 0.34
334 0.3
335 0.28
336 0.22
337 0.19
338 0.19
339 0.2
340 0.22
341 0.3
342 0.38
343 0.45
344 0.47
345 0.48
346 0.52
347 0.56
348 0.59
349 0.59
350 0.6
351 0.57
352 0.6
353 0.58
354 0.51
355 0.48
356 0.41
357 0.31
358 0.24
359 0.23
360 0.23
361 0.22
362 0.25
363 0.23
364 0.22
365 0.22
366 0.21
367 0.2
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.15
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.19
384 0.2
385 0.21
386 0.23
387 0.24
388 0.29
389 0.3
390 0.34
391 0.34
392 0.37
393 0.42
394 0.49
395 0.53
396 0.55
397 0.63
398 0.61
399 0.68
400 0.69
401 0.67
402 0.64
403 0.63
404 0.64
405 0.62
406 0.65
407 0.64
408 0.63
409 0.62
410 0.61
411 0.6
412 0.51
413 0.47
414 0.47
415 0.41
416 0.38
417 0.35
418 0.32
419 0.29
420 0.29
421 0.27
422 0.24
423 0.23
424 0.23
425 0.27
426 0.27
427 0.25
428 0.26
429 0.26
430 0.27
431 0.31
432 0.37
433 0.35
434 0.39
435 0.41
436 0.42
437 0.5
438 0.53
439 0.55
440 0.53
441 0.52
442 0.53
443 0.57
444 0.61
445 0.59
446 0.64
447 0.63
448 0.68
449 0.76
450 0.75
451 0.74
452 0.7
453 0.62
454 0.57
455 0.55
456 0.51
457 0.49
458 0.5
459 0.46
460 0.47
461 0.47
462 0.43
463 0.39
464 0.37
465 0.33
466 0.26
467 0.24
468 0.22
469 0.24
470 0.27
471 0.37
472 0.41
473 0.42
474 0.46
475 0.48
476 0.5
477 0.53
478 0.57
479 0.58
480 0.58
481 0.63
482 0.63
483 0.63
484 0.6
485 0.57
486 0.56
487 0.55
488 0.56
489 0.58
490 0.61
491 0.63
492 0.71
493 0.79
494 0.81
495 0.81
496 0.8
497 0.78
498 0.78
499 0.78
500 0.7
501 0.64
502 0.54
503 0.48
504 0.39
505 0.32
506 0.23
507 0.28
508 0.35
509 0.4
510 0.47
511 0.47
512 0.5
513 0.57
514 0.65
515 0.67
516 0.67
517 0.67
518 0.65
519 0.68
520 0.7
521 0.7
522 0.69
523 0.67
524 0.67
525 0.65
526 0.68
527 0.7
528 0.69
529 0.72
530 0.73
531 0.72
532 0.74
533 0.76
534 0.75
535 0.77
536 0.78
537 0.73
538 0.72
539 0.7
540 0.62
541 0.62
542 0.61
543 0.56
544 0.59
545 0.64