Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6QBT7

Protein Details
Accession A0A2J6QBT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-63VSTSKMGSEKHKSKPDKKHKSTNGEKKRKRDHGEDGHKSKSKKHKSDKAASQASABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-55EKHKSKPDKKHKSTNGEKKRKRDHGEDGHKSKSKKHKSD
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, mito 4, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025533  DUF4419  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF14388  DUF4419  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSIEKAPEVSTSKMGSEKHKSKPDKKHKSTNGEKKRKRDHGEDGHKSKSKKHKSDKAASQASALDVTAPASPFHIQTASLYLPLAPVSQKYPLEGLCAEHISPLILTYYPPFNGVVLSYSDPRLSEKPFKDDGESVLLQNIDEYAVSWAWLTAEFLLFKPEKDALLEGYVNLQNPGHLGIVCWNLFNASIESKRLPSDWKWKDVSELRNKEGIEAGETYAEEGPGFWVDGEGNKVEGIVKFRVREIESSHDRERGFLSIEGTMLSKADEDELVQSEREGARSTRDSAGRLLGGSRALGATSLGVAVEADMMTIDPDAKTERHRQGNIVPSLGCTVTMAVLIKLQNEKAGVNNDAAFTSGGEIVKEILCQWSIPYALPTGLNQEPAEEPVIIGYTFLGGEGSVGVIPYGNGFVTALIRAYHQGLHLRLAPEDVWLSILSQLRAYAYRHPSSIPGFSSSLDLNVELTINLDSDLETSDSTPLDEKFSGLANIVVNDDDLRDWFTPNFSTTNTTDKAVASIVMIGGLRKSTEPDHDIHQRAGLSSINLLGEKSDWEEILRRVEGRIPSFGEEAVQWCKILVPVIQGMISSFDSPNLAQTKEFWHKACHFDGTDLRNDKETMTGWITAFCFWSDSGYCLHPSLIKEGTLHHPRRRISFDEFGYGDEPQIFWEDDKDDWYATKLTDRKEIFTGGEKCHRIFPKNIPSGTATAVAYVRDYYNRRVYSVTIVAGSMGAIPTEVGYFSDETVLQPSSGWFLLQDEVKAMQPPQQLPTLIEDGHEVFVLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.36
3 0.43
4 0.48
5 0.54
6 0.63
7 0.71
8 0.76
9 0.84
10 0.88
11 0.88
12 0.9
13 0.91
14 0.91
15 0.92
16 0.93
17 0.93
18 0.93
19 0.93
20 0.91
21 0.91
22 0.92
23 0.91
24 0.88
25 0.85
26 0.85
27 0.85
28 0.87
29 0.87
30 0.83
31 0.82
32 0.8
33 0.72
34 0.71
35 0.71
36 0.71
37 0.71
38 0.76
39 0.76
40 0.81
41 0.9
42 0.91
43 0.9
44 0.87
45 0.76
46 0.68
47 0.59
48 0.49
49 0.39
50 0.29
51 0.19
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.13
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.1
73 0.11
74 0.13
75 0.19
76 0.19
77 0.2
78 0.23
79 0.22
80 0.25
81 0.23
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.2
86 0.18
87 0.18
88 0.14
89 0.13
90 0.11
91 0.09
92 0.07
93 0.08
94 0.1
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.17
108 0.17
109 0.21
110 0.22
111 0.26
112 0.33
113 0.35
114 0.4
115 0.45
116 0.46
117 0.46
118 0.44
119 0.4
120 0.38
121 0.35
122 0.28
123 0.26
124 0.24
125 0.19
126 0.17
127 0.15
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.17
147 0.18
148 0.17
149 0.17
150 0.18
151 0.14
152 0.17
153 0.17
154 0.14
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.14
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.1
164 0.08
165 0.08
166 0.11
167 0.16
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.22
183 0.25
184 0.34
185 0.37
186 0.42
187 0.44
188 0.43
189 0.49
190 0.52
191 0.55
192 0.55
193 0.56
194 0.52
195 0.53
196 0.53
197 0.46
198 0.42
199 0.32
200 0.24
201 0.19
202 0.17
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.11
207 0.1
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.13
225 0.15
226 0.18
227 0.18
228 0.19
229 0.24
230 0.24
231 0.25
232 0.25
233 0.3
234 0.33
235 0.39
236 0.4
237 0.4
238 0.38
239 0.37
240 0.35
241 0.27
242 0.24
243 0.19
244 0.18
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.1
267 0.14
268 0.17
269 0.2
270 0.22
271 0.23
272 0.24
273 0.23
274 0.25
275 0.2
276 0.18
277 0.16
278 0.12
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.03
302 0.04
303 0.06
304 0.07
305 0.11
306 0.2
307 0.27
308 0.33
309 0.34
310 0.36
311 0.4
312 0.48
313 0.45
314 0.38
315 0.31
316 0.25
317 0.25
318 0.23
319 0.17
320 0.08
321 0.07
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.09
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.08
374 0.08
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.05
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.02
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.02
391 0.02
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.11
409 0.12
410 0.13
411 0.15
412 0.15
413 0.14
414 0.15
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.09
419 0.07
420 0.06
421 0.07
422 0.09
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.12
429 0.13
430 0.17
431 0.21
432 0.22
433 0.23
434 0.23
435 0.25
436 0.26
437 0.27
438 0.2
439 0.17
440 0.17
441 0.17
442 0.18
443 0.15
444 0.14
445 0.11
446 0.1
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.05
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.11
472 0.11
473 0.09
474 0.1
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.05
483 0.05
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.13
491 0.14
492 0.12
493 0.16
494 0.16
495 0.22
496 0.21
497 0.21
498 0.21
499 0.19
500 0.19
501 0.15
502 0.14
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.05
513 0.08
514 0.09
515 0.13
516 0.15
517 0.17
518 0.22
519 0.3
520 0.31
521 0.3
522 0.3
523 0.26
524 0.24
525 0.24
526 0.19
527 0.12
528 0.1
529 0.11
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.09
537 0.08
538 0.08
539 0.09
540 0.13
541 0.14
542 0.18
543 0.18
544 0.17
545 0.17
546 0.22
547 0.25
548 0.24
549 0.25
550 0.23
551 0.24
552 0.24
553 0.23
554 0.19
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.15
559 0.12
560 0.11
561 0.12
562 0.12
563 0.13
564 0.11
565 0.1
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.11
570 0.11
571 0.12
572 0.12
573 0.11
574 0.1
575 0.09
576 0.11
577 0.11
578 0.16
579 0.16
580 0.16
581 0.14
582 0.16
583 0.23
584 0.3
585 0.34
586 0.3
587 0.34
588 0.38
589 0.43
590 0.44
591 0.41
592 0.34
593 0.34
594 0.39
595 0.36
596 0.4
597 0.38
598 0.37
599 0.34
600 0.34
601 0.3
602 0.26
603 0.24
604 0.2
605 0.19
606 0.2
607 0.18
608 0.2
609 0.2
610 0.18
611 0.18
612 0.14
613 0.13
614 0.1
615 0.14
616 0.12
617 0.12
618 0.14
619 0.15
620 0.16
621 0.16
622 0.17
623 0.17
624 0.17
625 0.21
626 0.2
627 0.19
628 0.18
629 0.21
630 0.3
631 0.37
632 0.43
633 0.44
634 0.49
635 0.51
636 0.58
637 0.6
638 0.56
639 0.54
640 0.54
641 0.5
642 0.5
643 0.47
644 0.42
645 0.38
646 0.32
647 0.25
648 0.18
649 0.16
650 0.11
651 0.13
652 0.12
653 0.1
654 0.13
655 0.14
656 0.14
657 0.16
658 0.16
659 0.14
660 0.14
661 0.16
662 0.15
663 0.14
664 0.22
665 0.24
666 0.26
667 0.34
668 0.35
669 0.37
670 0.37
671 0.39
672 0.33
673 0.38
674 0.41
675 0.37
676 0.45
677 0.44
678 0.42
679 0.49
680 0.52
681 0.47
682 0.48
683 0.53
684 0.55
685 0.61
686 0.6
687 0.54
688 0.52
689 0.49
690 0.45
691 0.38
692 0.27
693 0.21
694 0.21
695 0.19
696 0.16
697 0.16
698 0.15
699 0.18
700 0.22
701 0.27
702 0.35
703 0.36
704 0.37
705 0.38
706 0.38
707 0.38
708 0.38
709 0.33
710 0.24
711 0.23
712 0.21
713 0.19
714 0.17
715 0.11
716 0.08
717 0.06
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.08
725 0.09
726 0.09
727 0.11
728 0.11
729 0.12
730 0.15
731 0.15
732 0.13
733 0.12
734 0.13
735 0.14
736 0.14
737 0.13
738 0.11
739 0.12
740 0.15
741 0.17
742 0.16
743 0.15
744 0.17
745 0.18
746 0.2
747 0.19
748 0.22
749 0.27
750 0.29
751 0.3
752 0.33
753 0.33
754 0.32
755 0.37
756 0.34
757 0.28
758 0.26
759 0.25
760 0.22
761 0.22