Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6Q6D2

Protein Details
Accession A0A2J6Q6D2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-377EVPEKAPTKKEQKKKAEAKVNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-370TKKEQKKK
Subcellular Location(s) cyto 8.5cyto_nucl 8.5, nucl 7.5, mito 7, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAPQGPGTMGPPSKPIEKPKEDGMDVMDVLGGTGIDLREEEAYTFQMYNTSFNSQLSGSQSGTISSGNSFTQFPPADERSFYGAGPANAVPEKANIKSQDEYHKKVADKAWHDAARNLALSRQKELDNPFLQVGLVHTRVSKIARDNGLMLNTDQKGMMGTMKLPENFQHREVRVQTAVGPGVALTATNGNFLPLDSMLVDQLALLSIATKHRLRGLIEDAAKLSKGRRTGSHGIIPEEWNDAAAPSNPDSSSLVPEGGFRSGWESAVSPHSNPLKRSFSSANKIPTPVSEGGKTSAISIKITNEVVLALRATATKERDYEEARLRKRMKRSTGGEGTPRQGSVPGTPASNSVAPEVPEKAPTKKEQKKKAEAKVNEAASHAAANVTTAQFLGGGGGIFGKKKKYSWMTGGAGGSASGTSTPGRITTQGLPGTPGGAVGNPAPEKLTAEGARRLGQWREDREKGVGIQMRDWVTVLEEDGHEKKALQMAYMALDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.46
3 0.49
4 0.54
5 0.57
6 0.61
7 0.65
8 0.59
9 0.54
10 0.48
11 0.41
12 0.34
13 0.3
14 0.22
15 0.14
16 0.13
17 0.11
18 0.08
19 0.04
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.13
31 0.14
32 0.12
33 0.15
34 0.15
35 0.17
36 0.19
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.22
41 0.18
42 0.21
43 0.23
44 0.23
45 0.19
46 0.2
47 0.2
48 0.19
49 0.2
50 0.17
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.13
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.27
62 0.3
63 0.3
64 0.3
65 0.32
66 0.29
67 0.3
68 0.28
69 0.25
70 0.24
71 0.22
72 0.24
73 0.22
74 0.19
75 0.19
76 0.2
77 0.16
78 0.16
79 0.19
80 0.18
81 0.23
82 0.23
83 0.26
84 0.29
85 0.32
86 0.4
87 0.43
88 0.48
89 0.48
90 0.51
91 0.48
92 0.51
93 0.53
94 0.51
95 0.48
96 0.48
97 0.51
98 0.49
99 0.49
100 0.45
101 0.42
102 0.36
103 0.33
104 0.28
105 0.23
106 0.26
107 0.26
108 0.27
109 0.27
110 0.25
111 0.29
112 0.33
113 0.37
114 0.32
115 0.33
116 0.3
117 0.27
118 0.26
119 0.21
120 0.19
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.16
127 0.17
128 0.19
129 0.19
130 0.24
131 0.26
132 0.27
133 0.29
134 0.29
135 0.29
136 0.26
137 0.22
138 0.21
139 0.19
140 0.18
141 0.15
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.17
153 0.22
154 0.24
155 0.27
156 0.31
157 0.29
158 0.35
159 0.36
160 0.37
161 0.32
162 0.29
163 0.27
164 0.22
165 0.21
166 0.15
167 0.13
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.02
193 0.03
194 0.04
195 0.05
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.14
200 0.16
201 0.17
202 0.19
203 0.22
204 0.24
205 0.25
206 0.25
207 0.23
208 0.2
209 0.2
210 0.17
211 0.14
212 0.11
213 0.13
214 0.15
215 0.16
216 0.24
217 0.3
218 0.33
219 0.36
220 0.35
221 0.34
222 0.34
223 0.32
224 0.25
225 0.2
226 0.16
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.07
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.14
255 0.15
256 0.12
257 0.17
258 0.23
259 0.25
260 0.26
261 0.31
262 0.31
263 0.31
264 0.35
265 0.37
266 0.37
267 0.4
268 0.44
269 0.43
270 0.39
271 0.4
272 0.35
273 0.3
274 0.29
275 0.26
276 0.23
277 0.19
278 0.18
279 0.19
280 0.2
281 0.19
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.07
300 0.1
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.17
305 0.2
306 0.23
307 0.27
308 0.33
309 0.39
310 0.4
311 0.48
312 0.52
313 0.54
314 0.61
315 0.64
316 0.63
317 0.64
318 0.66
319 0.67
320 0.68
321 0.65
322 0.62
323 0.56
324 0.52
325 0.43
326 0.38
327 0.29
328 0.24
329 0.21
330 0.16
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.17
337 0.18
338 0.16
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.19
344 0.17
345 0.2
346 0.22
347 0.25
348 0.28
349 0.34
350 0.44
351 0.5
352 0.59
353 0.64
354 0.72
355 0.78
356 0.83
357 0.86
358 0.85
359 0.79
360 0.78
361 0.75
362 0.67
363 0.57
364 0.48
365 0.39
366 0.29
367 0.26
368 0.18
369 0.1
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.06
385 0.08
386 0.1
387 0.15
388 0.16
389 0.18
390 0.27
391 0.32
392 0.38
393 0.43
394 0.5
395 0.48
396 0.51
397 0.5
398 0.41
399 0.34
400 0.27
401 0.21
402 0.12
403 0.09
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.09
410 0.1
411 0.12
412 0.16
413 0.19
414 0.25
415 0.27
416 0.27
417 0.27
418 0.26
419 0.25
420 0.21
421 0.17
422 0.11
423 0.09
424 0.1
425 0.09
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.15
430 0.15
431 0.17
432 0.17
433 0.23
434 0.21
435 0.26
436 0.31
437 0.33
438 0.35
439 0.35
440 0.38
441 0.35
442 0.4
443 0.44
444 0.48
445 0.53
446 0.55
447 0.56
448 0.54
449 0.54
450 0.47
451 0.47
452 0.43
453 0.36
454 0.34
455 0.36
456 0.35
457 0.32
458 0.31
459 0.23
460 0.19
461 0.18
462 0.17
463 0.14
464 0.13
465 0.18
466 0.2
467 0.22
468 0.2
469 0.2
470 0.22
471 0.25
472 0.24
473 0.2
474 0.19
475 0.19