Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R121

Protein Details
Accession C4R121    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-262FDPKGFKPKTEKKKKKVTFDLQEBasic
494-517APQEVYKPQAKKQRKSKNRESMEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-255FKPKTEKKKKK
507-507R
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012173  Mpp10  
Gene Ontology GO:0034457  C:Mpp10 complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0861  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04006  Mpp10  
Amino Acid Sequences MLEDLVENPSKVFSNVEVKDILKQAKQLIDPISKQNSVLDEVYIDGLASSQVWAQIKLVIDGVTEDVLFNKIPELKKTGQANEEVDGSLEEEGSSNAEEENEESESDIVEDEIEDEDEGEDEEEGSNENEALDVLNEELNEVEEEKPEDDVEEPKTAPRESNESSDDESEFIDTHTEEFAQAEDELNDEFFDLEQFQQQVIAMEKPNDDDDDEEIDYFGESDNAAEESDNEEVMYYNQFFDPKGFKPKTEKKKKKVTFDLQEEENLNEEDHMDKLVASTMEDLFDDHLSEDEEISETGEKNLSTFEKQQREIQKQIAELEQEQIAQKKWTLTGEASVKTREADALLEEDLDFERTSKPVPVITQDVTESIEDLIRKRISNYQFDELQKRLPTNIAKFKSSQKVEVSEQKSIKSLAELYEEDYVKPDSTANKELEKAHDEISQLYETLSHRLDSLCSAHFIPKPAKRSLEVKVQTDTITMEDAQPLTLAGESTFAPQEVYKPQAKKQRKSKNRESMED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.28
4 0.29
5 0.29
6 0.34
7 0.38
8 0.38
9 0.3
10 0.33
11 0.35
12 0.38
13 0.39
14 0.39
15 0.4
16 0.43
17 0.44
18 0.48
19 0.49
20 0.44
21 0.43
22 0.41
23 0.37
24 0.34
25 0.31
26 0.23
27 0.18
28 0.18
29 0.18
30 0.15
31 0.12
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.15
43 0.16
44 0.16
45 0.17
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.11
58 0.16
59 0.18
60 0.21
61 0.27
62 0.29
63 0.37
64 0.43
65 0.45
66 0.42
67 0.45
68 0.44
69 0.38
70 0.37
71 0.29
72 0.23
73 0.18
74 0.15
75 0.11
76 0.09
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.19
146 0.23
147 0.23
148 0.28
149 0.28
150 0.28
151 0.29
152 0.29
153 0.27
154 0.2
155 0.18
156 0.14
157 0.12
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.1
228 0.13
229 0.14
230 0.24
231 0.24
232 0.26
233 0.36
234 0.45
235 0.55
236 0.62
237 0.7
238 0.69
239 0.79
240 0.84
241 0.84
242 0.84
243 0.82
244 0.79
245 0.76
246 0.71
247 0.61
248 0.56
249 0.47
250 0.37
251 0.29
252 0.2
253 0.13
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.18
292 0.26
293 0.3
294 0.32
295 0.39
296 0.46
297 0.5
298 0.51
299 0.49
300 0.43
301 0.39
302 0.39
303 0.34
304 0.27
305 0.22
306 0.2
307 0.15
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.15
318 0.13
319 0.18
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.19
327 0.14
328 0.11
329 0.09
330 0.08
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.13
346 0.14
347 0.17
348 0.2
349 0.2
350 0.21
351 0.19
352 0.19
353 0.18
354 0.17
355 0.14
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.16
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.27
365 0.3
366 0.38
367 0.42
368 0.4
369 0.44
370 0.48
371 0.51
372 0.44
373 0.44
374 0.39
375 0.34
376 0.31
377 0.31
378 0.33
379 0.37
380 0.45
381 0.43
382 0.43
383 0.45
384 0.51
385 0.55
386 0.52
387 0.49
388 0.43
389 0.45
390 0.48
391 0.55
392 0.51
393 0.5
394 0.48
395 0.44
396 0.42
397 0.38
398 0.33
399 0.25
400 0.22
401 0.16
402 0.19
403 0.19
404 0.19
405 0.24
406 0.24
407 0.22
408 0.22
409 0.22
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.17
414 0.22
415 0.28
416 0.29
417 0.3
418 0.33
419 0.35
420 0.38
421 0.37
422 0.33
423 0.29
424 0.29
425 0.27
426 0.25
427 0.26
428 0.22
429 0.18
430 0.16
431 0.17
432 0.15
433 0.19
434 0.18
435 0.15
436 0.16
437 0.16
438 0.17
439 0.17
440 0.19
441 0.16
442 0.17
443 0.19
444 0.24
445 0.25
446 0.3
447 0.35
448 0.39
449 0.43
450 0.47
451 0.49
452 0.48
453 0.51
454 0.51
455 0.54
456 0.53
457 0.51
458 0.48
459 0.46
460 0.42
461 0.37
462 0.33
463 0.23
464 0.19
465 0.16
466 0.14
467 0.15
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.12
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.06
476 0.08
477 0.08
478 0.11
479 0.12
480 0.11
481 0.12
482 0.12
483 0.16
484 0.2
485 0.25
486 0.3
487 0.33
488 0.41
489 0.5
490 0.6
491 0.67
492 0.73
493 0.78
494 0.82
495 0.88
496 0.91
497 0.92