Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R0V6

Protein Details
Accession C4R0V6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-207GFNGRDKSKGKKRVNQDDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-199DKSKGKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0852  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
CDD cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MSEEQSKKEILEQVEFYFSDSNLPKDRFLYTTAQANEGWVSISVLANFTRMRKFRPIELIVEALRESENLLEVSENGEMVRRKVPLPSREEQIKIAQRSVVVEDVPEDATLEQLQEFFKKYGKTNQVRMKRNRKTKEFFGKVIVEFSSVEEQKAFLEAEPKPTFNEKELKITSKVAYDESRESKRTAGFNGRDKSKGKKRVNQDDDESNKRVKDDKEVEADKETADDAAKEAGEDTATEPEKTEVPEENKEESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.29
4 0.25
5 0.21
6 0.23
7 0.22
8 0.25
9 0.29
10 0.31
11 0.31
12 0.31
13 0.33
14 0.28
15 0.3
16 0.31
17 0.26
18 0.33
19 0.32
20 0.33
21 0.3
22 0.29
23 0.26
24 0.2
25 0.18
26 0.1
27 0.1
28 0.08
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.21
37 0.22
38 0.27
39 0.34
40 0.37
41 0.41
42 0.49
43 0.49
44 0.44
45 0.45
46 0.44
47 0.34
48 0.33
49 0.27
50 0.18
51 0.15
52 0.12
53 0.09
54 0.06
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.21
71 0.29
72 0.32
73 0.38
74 0.4
75 0.42
76 0.45
77 0.46
78 0.42
79 0.43
80 0.42
81 0.37
82 0.35
83 0.3
84 0.26
85 0.25
86 0.24
87 0.18
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.08
104 0.08
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.23
109 0.32
110 0.36
111 0.43
112 0.51
113 0.57
114 0.64
115 0.72
116 0.75
117 0.74
118 0.79
119 0.79
120 0.79
121 0.75
122 0.76
123 0.77
124 0.71
125 0.64
126 0.58
127 0.53
128 0.44
129 0.4
130 0.31
131 0.2
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.06
143 0.11
144 0.11
145 0.19
146 0.2
147 0.21
148 0.21
149 0.25
150 0.26
151 0.24
152 0.31
153 0.24
154 0.31
155 0.33
156 0.35
157 0.34
158 0.35
159 0.33
160 0.28
161 0.28
162 0.23
163 0.23
164 0.22
165 0.26
166 0.29
167 0.33
168 0.32
169 0.32
170 0.32
171 0.34
172 0.33
173 0.32
174 0.36
175 0.37
176 0.45
177 0.5
178 0.5
179 0.51
180 0.51
181 0.56
182 0.57
183 0.61
184 0.62
185 0.63
186 0.7
187 0.77
188 0.82
189 0.79
190 0.74
191 0.73
192 0.71
193 0.69
194 0.62
195 0.54
196 0.47
197 0.42
198 0.43
199 0.35
200 0.38
201 0.38
202 0.41
203 0.47
204 0.49
205 0.5
206 0.47
207 0.46
208 0.35
209 0.3
210 0.24
211 0.16
212 0.14
213 0.11
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.15
224 0.17
225 0.17
226 0.18
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.23
231 0.24
232 0.28
233 0.35
234 0.38