FuNGI

A0A2J6QA42

Protein Details

Accession

A0A2J6QA42

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
518-539	QELHNRNWRYHKKLRVWLTKDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

extr 18, mito 6, cyto 1, plas 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038635 CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf IPR040168 Not2/3/5 IPR007282 NOT2/3/5_C
Gene Ontology	GO:0030015 C:CCR4-NOT core complex GO:0000289 P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04153 NOT2_3_5

Amino Acid Sequences

MSSRLQQYKRSFAITSSGSPLSAHIFCNLFCIAHYSSNSESRAMFLSFPFAAVEAVWKLVRRLALICFVLAVGPQSLRGLPNGFPSQQQIQQSRSVSSRLPPSGKMGNGATWAFGGGVPMGNAGLGNPRPNNGPMSSFAQTIGSSSQPATPLDLSEFPSLSNNQPQPSQSTWAASGARGLGPSSSMRLQQQQQQQQPTLSSQQQMNAQQQAQQQHDDLFSSSSQLPSSQGGFRFGAQNAVGQSSQSNPVDEFPPLNRNANGEIGQDRGSSLIQNVGFGAQSNGLGFGSANPPQPPRNNGLLNALSGNSRVPSAIRVASPANMPVTSNSRSPIEPARQENDSSAFSSAQFGSSIAQPQREDSAPQSTMSRTDGHQQIEGGAPRSQNLDSTVGSSQGNPEDTGPEVQDPLANMSEIDKWGLKGFTLMMNNFPDYAALVTGMDVTSLGLDLNSNEMISDQVYSLWDNEPPRPAVPKFKLPDCYTVGNVARLDTKMTNFNDEALLFMFYSNPGDVQQIMAAQELHNRNWRYHKKLRVWLTKDEMMVPQPLGNGTERGYYVFFDINSWVRERREFTLVYDDLENIPAVPRTLDR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.35
4	0.32
5	0.27
6	0.27
7	0.26
8	0.24
9	0.23
10	0.2
11	0.19
12	0.19
13	0.19
14	0.22
15	0.22
16	0.17
17	0.15
18	0.19
19	0.18
20	0.22
21	0.24
22	0.25
23	0.28
24	0.34
25	0.35
26	0.32
27	0.29
28	0.26
29	0.28
30	0.24
31	0.22
32	0.16
33	0.19
34	0.17
35	0.18
36	0.16
37	0.13
38	0.12
39	0.11
40	0.14
41	0.09
42	0.12
43	0.13
44	0.13
45	0.14
46	0.16
47	0.18
48	0.17
49	0.18
50	0.19
51	0.24
52	0.24
53	0.23
54	0.2
55	0.19
56	0.17
57	0.15
58	0.13
59	0.08
60	0.07
61	0.08
62	0.09
63	0.1
64	0.11
65	0.13
66	0.14
67	0.14
68	0.21
69	0.25
70	0.25
71	0.25
72	0.29
73	0.32
74	0.34
75	0.4
76	0.37
77	0.36
78	0.42
79	0.43
80	0.41
81	0.38
82	0.36
83	0.31
84	0.32
85	0.37
86	0.36
87	0.37
88	0.35
89	0.39
90	0.42
91	0.4
92	0.39
93	0.32
94	0.27
95	0.28
96	0.26
97	0.21
98	0.15
99	0.15
100	0.12
101	0.1
102	0.09
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.06
108	0.05
109	0.05
110	0.05
111	0.09
112	0.1
113	0.15
114	0.15
115	0.17
116	0.19
117	0.21
118	0.24
119	0.2
120	0.21
121	0.21
122	0.26
123	0.26
124	0.24
125	0.23
126	0.21
127	0.19
128	0.18
129	0.17
130	0.11
131	0.11
132	0.11
133	0.13
134	0.13
135	0.13
136	0.15
137	0.14
138	0.14
139	0.15
140	0.17
141	0.18
142	0.18
143	0.18
144	0.16
145	0.18
146	0.19
147	0.19
148	0.25
149	0.24
150	0.24
151	0.26
152	0.27
153	0.29
154	0.3
155	0.32
156	0.25
157	0.24
158	0.24
159	0.25
160	0.25
161	0.19
162	0.18
163	0.14
164	0.14
165	0.12
166	0.11
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.11
171	0.11
172	0.13
173	0.15
174	0.2
175	0.23
176	0.28
177	0.37
178	0.43
179	0.47
180	0.5
181	0.5
182	0.46
183	0.45
184	0.4
185	0.36
186	0.3
187	0.27
188	0.23
189	0.24
190	0.28
191	0.3
192	0.31
193	0.3
194	0.28
195	0.29
196	0.32
197	0.34
198	0.31
199	0.29
200	0.26
201	0.23
202	0.23
203	0.19
204	0.16
205	0.12
206	0.1
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.11
211	0.1
212	0.11
213	0.11
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.16
218	0.17
219	0.17
220	0.19
221	0.17
222	0.18
223	0.15
224	0.16
225	0.13
226	0.14
227	0.13
228	0.1
229	0.11
230	0.1
231	0.14
232	0.13
233	0.13
234	0.11
235	0.13
236	0.14
237	0.14
238	0.14
239	0.11
240	0.16
241	0.17
242	0.19
243	0.18
244	0.18
245	0.2
246	0.2
247	0.19
248	0.16
249	0.15
250	0.14
251	0.14
252	0.12
253	0.11
254	0.09
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.04
271	0.05
272	0.04
273	0.05
274	0.07
275	0.09
276	0.1
277	0.11
278	0.13
279	0.16
280	0.19
281	0.2
282	0.23
283	0.26
284	0.26
285	0.26
286	0.29
287	0.26
288	0.24
289	0.22
290	0.18
291	0.12
292	0.11
293	0.11
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.11
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.09
309	0.1
310	0.09
311	0.13
312	0.14
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.16
317	0.18
318	0.22
319	0.23
320	0.26
321	0.29
322	0.3
323	0.3
324	0.31
325	0.3
326	0.26
327	0.22
328	0.18
329	0.16
330	0.13
331	0.12
332	0.14
333	0.12
334	0.1
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.14
340	0.13
341	0.15
342	0.15
343	0.16
344	0.18
345	0.18
346	0.18
347	0.16
348	0.21
349	0.19
350	0.19
351	0.2
352	0.17
353	0.18
354	0.19
355	0.18
356	0.13
357	0.19
358	0.23
359	0.23
360	0.23
361	0.22
362	0.21
363	0.23
364	0.23
365	0.19
366	0.16
367	0.15
368	0.15
369	0.17
370	0.16
371	0.14
372	0.15
373	0.15
374	0.13
375	0.16
376	0.16
377	0.15
378	0.15
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.14
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.12
387	0.13
388	0.12
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.11
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.12
402	0.1
403	0.1
404	0.12
405	0.12
406	0.11
407	0.1
408	0.1
409	0.13
410	0.16
411	0.16
412	0.18
413	0.2
414	0.2
415	0.19
416	0.18
417	0.14
418	0.11
419	0.11
420	0.08
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.05
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.04
434	0.04
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.05
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.1
449	0.13
450	0.15
451	0.18
452	0.21
453	0.22
454	0.24
455	0.28
456	0.3
457	0.37
458	0.4
459	0.46
460	0.47
461	0.51
462	0.57
463	0.54
464	0.58
465	0.52
466	0.5
467	0.42
468	0.44
469	0.4
470	0.35
471	0.33
472	0.27
473	0.25
474	0.22
475	0.25
476	0.2
477	0.21
478	0.24
479	0.26
480	0.3
481	0.28
482	0.28
483	0.27
484	0.24
485	0.23
486	0.17
487	0.16
488	0.11
489	0.11
490	0.1
491	0.09
492	0.11
493	0.1
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.1
498	0.11
499	0.11
500	0.1
501	0.11
502	0.11
503	0.11
504	0.1
505	0.18
506	0.21
507	0.23
508	0.3
509	0.32
510	0.35
511	0.45
512	0.54
513	0.56
514	0.62
515	0.68
516	0.7
517	0.78
518	0.84
519	0.84
520	0.8
521	0.79
522	0.78
523	0.72
524	0.63
525	0.57
526	0.49
527	0.4
528	0.37
529	0.29
530	0.23
531	0.19
532	0.19
533	0.18
534	0.17
535	0.17
536	0.15
537	0.18
538	0.17
539	0.18
540	0.18
541	0.17
542	0.18
543	0.18
544	0.17
545	0.15
546	0.19
547	0.21
548	0.22
549	0.25
550	0.27
551	0.28
552	0.33
553	0.37
554	0.37
555	0.39
556	0.38
557	0.38
558	0.43
559	0.4
560	0.37
561	0.34
562	0.31
563	0.26
564	0.26
565	0.22
566	0.13
567	0.15
568	0.13
569	0.13

A0A2J6QA42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer