Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6PU78

Protein Details
Accession A0A2J6PU78    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
615-643EDIEKVQKQMPRKTKRRRKLDDDSYEEYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
574-579KRRARK
625-633PRKTKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.333, cyto 9, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MESARGPPRVKNKAPSAIQISAEQLLREAVDRQEPGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEDYVRRNRINMNNWMRYAQWELEQKEFKRARSIFERALDVDATSVTLWIRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRIDKLWYKYVYMEEMLGNIPGTRQVFERWMSWEPDEAAWSSYIKLEKRYGEFQRAREIFQRFTMVHPEPRNWIKWARFEEEFGTSDLVREVFGSAVEALGDEFMDERLFIAYARYEAKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSLALHKAYTTFEKQFGDREGVEDVILSKRRVQYEEQIKENPKNYDVWFDYARLEETSGDVDRVRDVYERAIAQIPPTQEKRHWRRYIYLWVFYAIWEEMDSRDVERAREVYQECLKLIPHKKFTFAKIWLMKAQFEIRQQNLSAARKTLGQAIGMCPKDKLFKGYIELELKLFEFVRCRTLYEKHIEWNPANCQAWIKFAELERGLDDLERTRAIFELAIKQPVLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYDRTRELYERLLEKTEHVKVWISYAHFEINLPDEDEEDVEEEEVEKPVSELAKRRARKVFERALKSMKDKELREERVSLLNAWLSFERTHGSEEDIEKVQKQMPRKTKRRRKLDDDSYEEYIDYVFPADDRQTAKLSNLLAMAQSWKQAGGAITGDAANGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.72
3 0.69
4 0.63
5 0.58
6 0.5
7 0.44
8 0.38
9 0.35
10 0.28
11 0.21
12 0.17
13 0.16
14 0.15
15 0.15
16 0.14
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.29
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.27
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.35
43 0.35
44 0.39
45 0.42
46 0.45
47 0.54
48 0.6
49 0.61
50 0.68
51 0.74
52 0.78
53 0.76
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.62
62 0.61
63 0.53
64 0.47
65 0.44
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.35
70 0.41
71 0.48
72 0.46
73 0.51
74 0.53
75 0.48
76 0.51
77 0.49
78 0.49
79 0.49
80 0.55
81 0.51
82 0.51
83 0.52
84 0.43
85 0.44
86 0.37
87 0.29
88 0.22
89 0.16
90 0.13
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.13
101 0.16
102 0.2
103 0.22
104 0.24
105 0.27
106 0.28
107 0.35
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.18
161 0.16
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.13
166 0.16
167 0.16
168 0.2
169 0.23
170 0.27
171 0.31
172 0.39
173 0.41
174 0.47
175 0.51
176 0.49
177 0.55
178 0.51
179 0.5
180 0.48
181 0.47
182 0.38
183 0.35
184 0.37
185 0.27
186 0.28
187 0.33
188 0.29
189 0.32
190 0.33
191 0.33
192 0.35
193 0.38
194 0.39
195 0.35
196 0.39
197 0.36
198 0.41
199 0.45
200 0.43
201 0.4
202 0.39
203 0.38
204 0.34
205 0.31
206 0.24
207 0.21
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.12
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.14
242 0.19
243 0.2
244 0.25
245 0.26
246 0.31
247 0.32
248 0.35
249 0.33
250 0.29
251 0.3
252 0.26
253 0.26
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.25
258 0.27
259 0.31
260 0.33
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.33
265 0.39
266 0.43
267 0.4
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.29
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.13
290 0.12
291 0.14
292 0.18
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.29
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.43
301 0.44
302 0.46
303 0.47
304 0.39
305 0.3
306 0.28
307 0.25
308 0.26
309 0.24
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.12
317 0.12
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.52
349 0.56
350 0.62
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.36
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.06
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.17
373 0.17
374 0.19
375 0.23
376 0.23
377 0.22
378 0.22
379 0.21
380 0.24
381 0.3
382 0.32
383 0.36
384 0.36
385 0.41
386 0.43
387 0.46
388 0.46
389 0.42
390 0.44
391 0.4
392 0.41
393 0.4
394 0.38
395 0.35
396 0.29
397 0.3
398 0.24
399 0.26
400 0.29
401 0.26
402 0.27
403 0.26
404 0.28
405 0.31
406 0.32
407 0.28
408 0.24
409 0.23
410 0.22
411 0.23
412 0.23
413 0.18
414 0.15
415 0.15
416 0.17
417 0.23
418 0.23
419 0.22
420 0.18
421 0.18
422 0.22
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.25
429 0.29
430 0.27
431 0.27
432 0.24
433 0.22
434 0.2
435 0.17
436 0.15
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.16
441 0.16
442 0.18
443 0.2
444 0.24
445 0.29
446 0.31
447 0.32
448 0.32
449 0.36
450 0.39
451 0.37
452 0.38
453 0.36
454 0.36
455 0.35
456 0.3
457 0.29
458 0.25
459 0.27
460 0.24
461 0.22
462 0.19
463 0.19
464 0.24
465 0.22
466 0.22
467 0.19
468 0.18
469 0.16
470 0.14
471 0.14
472 0.1
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.17
482 0.19
483 0.21
484 0.2
485 0.2
486 0.19
487 0.19
488 0.19
489 0.12
490 0.1
491 0.09
492 0.16
493 0.16
494 0.16
495 0.15
496 0.13
497 0.13
498 0.14
499 0.14
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.12
509 0.12
510 0.11
511 0.1
512 0.11
513 0.12
514 0.11
515 0.16
516 0.21
517 0.24
518 0.26
519 0.28
520 0.27
521 0.28
522 0.33
523 0.32
524 0.27
525 0.26
526 0.26
527 0.23
528 0.26
529 0.26
530 0.22
531 0.19
532 0.2
533 0.2
534 0.18
535 0.18
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.09
552 0.08
553 0.07
554 0.07
555 0.09
556 0.12
557 0.14
558 0.2
559 0.29
560 0.39
561 0.42
562 0.5
563 0.56
564 0.6
565 0.65
566 0.68
567 0.69
568 0.69
569 0.73
570 0.71
571 0.71
572 0.69
573 0.67
574 0.64
575 0.62
576 0.61
577 0.55
578 0.59
579 0.62
580 0.63
581 0.61
582 0.57
583 0.51
584 0.5
585 0.49
586 0.41
587 0.33
588 0.29
589 0.25
590 0.25
591 0.23
592 0.19
593 0.18
594 0.18
595 0.17
596 0.16
597 0.18
598 0.16
599 0.19
600 0.21
601 0.23
602 0.26
603 0.28
604 0.28
605 0.26
606 0.28
607 0.29
608 0.28
609 0.35
610 0.41
611 0.48
612 0.57
613 0.67
614 0.76
615 0.83
616 0.89
617 0.93
618 0.92
619 0.92
620 0.92
621 0.92
622 0.91
623 0.88
624 0.83
625 0.76
626 0.66
627 0.56
628 0.45
629 0.34
630 0.24
631 0.16
632 0.11
633 0.07
634 0.07
635 0.09
636 0.11
637 0.15
638 0.18
639 0.2
640 0.22
641 0.24
642 0.25
643 0.26
644 0.26
645 0.24
646 0.22
647 0.2
648 0.17
649 0.17
650 0.19
651 0.17
652 0.18
653 0.16
654 0.15
655 0.14
656 0.16
657 0.16
658 0.15
659 0.15
660 0.13
661 0.13
662 0.13