Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6QAN4

Protein Details
Accession A0A2J6QAN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-28ITSLTPFQRRKGRLPKHAFQKGDHydrophilic
82-101SNEPSRKKRRLDSSISPPPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-89K
Subcellular Location(s) mito 14.5, nucl 11, cyto_mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MGLFVITSLTPFQRRKGRLPKHAFQKGDLSHVIDPSTSKLDPYSCSFQQRQSKKPIDLCRAKDRLQRTVGHSEPHRNMADASNEPSRKKRRLDSSISPPPLRRKIEVVDEAPKVIKSPFQLTRITDLPPASNVDTVTLKDILGDPLISECWEFNYLHDLDFLMEAFDEDIRDLVKVHVIHGFWKQEDANRRSLIDQAKKYPNITLRTAYMPEMFGTHHTKMLVLIRHDDRAQIIIHTANMIPFDWGNMAQAVWKSPLLPLATGSSTSLQTEQMGSGFKFKTDFLNYLRAYDSKRTVCKPLIEQLTKYDFSEIRAALVGSVPGRQDMETYSQTSWGWAGLKNVLKSVPVSGPEPDIVIQISSIATLGQNDKWLDKTLFNVLKTSKNLKSKPKFHIIFPTADEIRRSLNGYASGSAIHTKTQTAAQTKQLQYLKPMLYHWAGDGPQHASASSTATHDAGRKRAAPHIKTYIRFSDKTHSTIDWMLVTSANLSKQAWGEAQNAAGESRVSSYELGVLVWPELFGEKATMIPTFKADTPPLAGKGELVVGARMPYDLPFVPYAKEDEPWCATKAYQELDWMGRAYRLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.56
3 0.65
4 0.71
5 0.74
6 0.82
7 0.83
8 0.84
9 0.88
10 0.79
11 0.72
12 0.71
13 0.62
14 0.58
15 0.52
16 0.45
17 0.38
18 0.37
19 0.34
20 0.26
21 0.24
22 0.22
23 0.24
24 0.2
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.3
30 0.34
31 0.33
32 0.41
33 0.43
34 0.5
35 0.57
36 0.62
37 0.63
38 0.67
39 0.71
40 0.71
41 0.76
42 0.77
43 0.78
44 0.79
45 0.78
46 0.78
47 0.76
48 0.74
49 0.72
50 0.68
51 0.66
52 0.62
53 0.61
54 0.57
55 0.6
56 0.57
57 0.57
58 0.56
59 0.57
60 0.54
61 0.55
62 0.49
63 0.41
64 0.4
65 0.37
66 0.37
67 0.31
68 0.32
69 0.34
70 0.37
71 0.38
72 0.46
73 0.51
74 0.54
75 0.58
76 0.62
77 0.64
78 0.7
79 0.76
80 0.76
81 0.78
82 0.8
83 0.79
84 0.73
85 0.68
86 0.68
87 0.68
88 0.63
89 0.55
90 0.5
91 0.48
92 0.54
93 0.55
94 0.5
95 0.48
96 0.44
97 0.43
98 0.39
99 0.34
100 0.27
101 0.21
102 0.19
103 0.16
104 0.23
105 0.27
106 0.3
107 0.34
108 0.35
109 0.39
110 0.38
111 0.37
112 0.33
113 0.28
114 0.25
115 0.23
116 0.24
117 0.2
118 0.2
119 0.17
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.17
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.06
137 0.08
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.21
168 0.23
169 0.19
170 0.21
171 0.21
172 0.22
173 0.32
174 0.33
175 0.35
176 0.33
177 0.34
178 0.33
179 0.37
180 0.41
181 0.39
182 0.39
183 0.41
184 0.47
185 0.48
186 0.48
187 0.47
188 0.46
189 0.42
190 0.41
191 0.35
192 0.3
193 0.31
194 0.31
195 0.27
196 0.22
197 0.18
198 0.15
199 0.14
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.21
209 0.21
210 0.17
211 0.22
212 0.22
213 0.24
214 0.24
215 0.23
216 0.19
217 0.17
218 0.16
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.15
268 0.16
269 0.19
270 0.17
271 0.25
272 0.25
273 0.25
274 0.26
275 0.23
276 0.23
277 0.24
278 0.26
279 0.22
280 0.26
281 0.27
282 0.3
283 0.31
284 0.32
285 0.31
286 0.32
287 0.36
288 0.34
289 0.33
290 0.33
291 0.34
292 0.32
293 0.3
294 0.26
295 0.18
296 0.19
297 0.22
298 0.18
299 0.14
300 0.14
301 0.13
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.05
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.12
314 0.12
315 0.15
316 0.14
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.1
325 0.14
326 0.17
327 0.17
328 0.18
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.17
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.13
339 0.14
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.07
353 0.07
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.16
359 0.17
360 0.15
361 0.17
362 0.23
363 0.26
364 0.26
365 0.27
366 0.27
367 0.3
368 0.34
369 0.38
370 0.36
371 0.41
372 0.47
373 0.55
374 0.62
375 0.65
376 0.68
377 0.73
378 0.68
379 0.62
380 0.66
381 0.58
382 0.51
383 0.45
384 0.44
385 0.35
386 0.34
387 0.32
388 0.22
389 0.21
390 0.2
391 0.2
392 0.15
393 0.16
394 0.17
395 0.18
396 0.18
397 0.16
398 0.15
399 0.13
400 0.15
401 0.13
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.11
406 0.14
407 0.19
408 0.22
409 0.24
410 0.3
411 0.39
412 0.39
413 0.46
414 0.46
415 0.41
416 0.4
417 0.44
418 0.39
419 0.32
420 0.31
421 0.28
422 0.26
423 0.25
424 0.23
425 0.19
426 0.17
427 0.17
428 0.18
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.15
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.12
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.14
441 0.18
442 0.21
443 0.23
444 0.26
445 0.29
446 0.3
447 0.37
448 0.45
449 0.44
450 0.47
451 0.53
452 0.56
453 0.55
454 0.58
455 0.59
456 0.56
457 0.54
458 0.5
459 0.49
460 0.46
461 0.46
462 0.44
463 0.36
464 0.33
465 0.33
466 0.31
467 0.23
468 0.19
469 0.17
470 0.14
471 0.14
472 0.13
473 0.13
474 0.12
475 0.13
476 0.12
477 0.14
478 0.14
479 0.16
480 0.16
481 0.18
482 0.19
483 0.18
484 0.19
485 0.18
486 0.18
487 0.15
488 0.14
489 0.11
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.11
500 0.1
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.07
510 0.09
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.15
516 0.17
517 0.19
518 0.22
519 0.23
520 0.23
521 0.27
522 0.3
523 0.31
524 0.29
525 0.27
526 0.22
527 0.22
528 0.21
529 0.17
530 0.13
531 0.11
532 0.1
533 0.11
534 0.11
535 0.1
536 0.1
537 0.09
538 0.12
539 0.13
540 0.15
541 0.18
542 0.19
543 0.2
544 0.21
545 0.25
546 0.23
547 0.26
548 0.24
549 0.27
550 0.31
551 0.32
552 0.32
553 0.29
554 0.27
555 0.29
556 0.33
557 0.3
558 0.27
559 0.27
560 0.29
561 0.3
562 0.32
563 0.28
564 0.24