Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6PDX8

Protein Details
Accession A0A2J6PDX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
209-239YVCWKAKIEKFVRRKKPLRPTKRKNIFSVVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-232KIEKFVRRKKPLRPTKRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00636  Ribonuclease_3  
Amino Acid Sequences MSEPINTNNFNPYQEISNSNPHQPQCPGSIDSWERPRSPSFITRPAASNASQHSQHAAPSSPTLTAHSAPESGLGDQPYPPKAGAAVAERVWPSDQESGGHRTEPTLARGIWSSAGSGSSQWLLAIQVVLQYEFTNPDLLEEALESPGSGVNCVGKSHRHFSDGNRGLADVGEMVMKLVLTDQCYLFKVPDGDAANILERLIGRKNLAYVCWKAKIEKFVRRKKPLRPTKRKNIFSVVKDDASREDPSRTAARAIRAIIGAVYYNGGPQSARRVMAELGFIIKPSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.29
4 0.37
5 0.39
6 0.42
7 0.46
8 0.43
9 0.45
10 0.44
11 0.43
12 0.37
13 0.39
14 0.35
15 0.3
16 0.37
17 0.37
18 0.4
19 0.46
20 0.46
21 0.43
22 0.44
23 0.45
24 0.41
25 0.42
26 0.44
27 0.42
28 0.46
29 0.48
30 0.47
31 0.48
32 0.47
33 0.45
34 0.37
35 0.34
36 0.3
37 0.31
38 0.29
39 0.27
40 0.27
41 0.24
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.18
46 0.19
47 0.19
48 0.17
49 0.17
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.15
57 0.17
58 0.15
59 0.13
60 0.14
61 0.13
62 0.12
63 0.14
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.14
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.16
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.17
89 0.15
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.17
98 0.14
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.12
143 0.15
144 0.21
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.27
149 0.38
150 0.38
151 0.36
152 0.31
153 0.3
154 0.26
155 0.25
156 0.21
157 0.1
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.05
166 0.05
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.16
178 0.17
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.16
183 0.15
184 0.15
185 0.1
186 0.08
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.16
193 0.16
194 0.18
195 0.21
196 0.23
197 0.26
198 0.3
199 0.3
200 0.31
201 0.34
202 0.42
203 0.44
204 0.5
205 0.56
206 0.62
207 0.71
208 0.78
209 0.82
210 0.82
211 0.86
212 0.87
213 0.88
214 0.89
215 0.89
216 0.9
217 0.93
218 0.89
219 0.84
220 0.83
221 0.8
222 0.72
223 0.7
224 0.63
225 0.55
226 0.5
227 0.45
228 0.38
229 0.34
230 0.33
231 0.27
232 0.25
233 0.23
234 0.27
235 0.29
236 0.27
237 0.29
238 0.29
239 0.31
240 0.32
241 0.33
242 0.31
243 0.27
244 0.26
245 0.21
246 0.18
247 0.14
248 0.1
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.17
257 0.2
258 0.22
259 0.22
260 0.24
261 0.26
262 0.27
263 0.27
264 0.2
265 0.2
266 0.18