Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6QGJ1

Protein Details
Accession A0A2J6QGJ1    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-47NLKSRDSKSMSKLKKEKSSKKRKAESLDEDSEKHydrophilic
59-87EEPVPAPKLKKDKSSKKRKAELSDEVPRKBasic
96-124DDKPVPTPKSKDKSSKKRKAETIDQTSQSHydrophilic
174-198APEPPSKKALRRLKKGKPLPPSKSGBasic
422-449SEIVSKPKTKKTKTRKWWVNKIKGRPLRHydrophilic
526-552KEPQTTTSPRHHQRKTKEDCHPPKANLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-38SKSMSKLKKEKSSKKRKA
64-78APKLKKDKSSKKRKA
103-114PKSKDKSSKKRK
178-212PSKKALRRLKKGKPLPPSKSGAESTPEPEKKPAKK
427-447KPKTKKTKTRKWWVNKIKGRP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 10, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATSIDVSVNGAKDNLKSRDSKSMSKLKKEKSSKKRKAESLDEDSEKSIKLPDPAMPNEEPVPAPKLKKDKSSKKRKAELSDEVPRKSTELASTPDDKPVPTPKSKDKSSKKRKAETIDQTSQSDIKLEDRSIPEDTAETSLEPTLNAAEERSTQPMSKKRKASVEEIEVDITAPEPPSKKALRRLKKGKPLPPSKSGAESTPEPEKKPAKKTEVEQRSEHGIWIGNLPWHLSKEDLRKFFVEYSDITDEMITRVHMPTPNDGKPANKVEEKKKFVKVVNNQGYAYVDFNCPEAIGYAIELSEQLLSGRRVLIKNNKSFEGRPQKTKEESRNDGKPPSKRVFLGNLTFDTTEESLKEHFEKCGAVANVKVAQFEDSGKCKGYAWITFEELEGAKNAVRGFVLIEEDVSDASESESEDEGSGSEIVSKPKTKKTKTRKWWVNKIKGRPLRMEFAEDAQVRYKKRYGKDGTKSRSAGAPENAVDNVKAIEGAPKKVEYMLPHGSARLTGGIVESTGKKPSQSSSLFPKEPQTTTSPRHHQRKTKEDCHPPKANLFEIISENRRSTAIRRKQTCLSYHTTSTSIVPMVPGLAGARNLNHLRTMVPETFKRLYKRYNHNTTSWESKMGIAIANRVAKSPVPANIPEGDLFLPASAWYLSSAEGVAFVQRVWMEWARGGKAVWSPAATGPMPGYTCVRTALPAPQAALIGPPPNLTVTGDTDDEDDEDSEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.32
4 0.36
5 0.39
6 0.49
7 0.53
8 0.56
9 0.57
10 0.62
11 0.66
12 0.72
13 0.77
14 0.76
15 0.81
16 0.84
17 0.86
18 0.87
19 0.9
20 0.9
21 0.92
22 0.93
23 0.91
24 0.89
25 0.89
26 0.87
27 0.84
28 0.82
29 0.75
30 0.66
31 0.59
32 0.51
33 0.41
34 0.32
35 0.28
36 0.22
37 0.21
38 0.22
39 0.25
40 0.31
41 0.34
42 0.39
43 0.36
44 0.36
45 0.34
46 0.34
47 0.3
48 0.25
49 0.28
50 0.27
51 0.29
52 0.33
53 0.42
54 0.45
55 0.54
56 0.62
57 0.68
58 0.74
59 0.83
60 0.86
61 0.87
62 0.91
63 0.9
64 0.88
65 0.86
66 0.85
67 0.82
68 0.82
69 0.77
70 0.7
71 0.63
72 0.54
73 0.47
74 0.39
75 0.32
76 0.26
77 0.25
78 0.27
79 0.3
80 0.35
81 0.34
82 0.38
83 0.36
84 0.32
85 0.32
86 0.37
87 0.39
88 0.41
89 0.47
90 0.52
91 0.59
92 0.67
93 0.73
94 0.75
95 0.8
96 0.84
97 0.88
98 0.87
99 0.89
100 0.89
101 0.87
102 0.86
103 0.86
104 0.84
105 0.81
106 0.74
107 0.66
108 0.59
109 0.51
110 0.41
111 0.32
112 0.23
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.22
117 0.24
118 0.27
119 0.27
120 0.27
121 0.23
122 0.21
123 0.21
124 0.18
125 0.16
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.11
138 0.13
139 0.16
140 0.17
141 0.19
142 0.26
143 0.34
144 0.42
145 0.48
146 0.53
147 0.55
148 0.62
149 0.64
150 0.65
151 0.64
152 0.62
153 0.56
154 0.51
155 0.45
156 0.36
157 0.32
158 0.24
159 0.16
160 0.1
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.18
166 0.23
167 0.29
168 0.38
169 0.49
170 0.56
171 0.66
172 0.75
173 0.78
174 0.84
175 0.87
176 0.85
177 0.85
178 0.85
179 0.8
180 0.77
181 0.72
182 0.63
183 0.59
184 0.53
185 0.44
186 0.38
187 0.34
188 0.3
189 0.35
190 0.35
191 0.31
192 0.37
193 0.43
194 0.46
195 0.53
196 0.58
197 0.55
198 0.58
199 0.63
200 0.67
201 0.68
202 0.65
203 0.58
204 0.53
205 0.52
206 0.48
207 0.41
208 0.32
209 0.23
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.17
221 0.26
222 0.33
223 0.34
224 0.35
225 0.35
226 0.36
227 0.36
228 0.32
229 0.24
230 0.18
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.18
235 0.16
236 0.15
237 0.13
238 0.13
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.1
243 0.13
244 0.14
245 0.2
246 0.26
247 0.28
248 0.29
249 0.3
250 0.29
251 0.31
252 0.35
253 0.33
254 0.32
255 0.36
256 0.43
257 0.52
258 0.56
259 0.57
260 0.57
261 0.58
262 0.57
263 0.6
264 0.59
265 0.6
266 0.62
267 0.59
268 0.54
269 0.49
270 0.46
271 0.37
272 0.3
273 0.2
274 0.13
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.04
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.12
297 0.13
298 0.18
299 0.27
300 0.33
301 0.39
302 0.41
303 0.42
304 0.41
305 0.41
306 0.46
307 0.48
308 0.43
309 0.45
310 0.47
311 0.5
312 0.54
313 0.6
314 0.59
315 0.56
316 0.59
317 0.57
318 0.59
319 0.57
320 0.57
321 0.56
322 0.52
323 0.51
324 0.48
325 0.44
326 0.39
327 0.39
328 0.38
329 0.36
330 0.35
331 0.29
332 0.26
333 0.25
334 0.24
335 0.21
336 0.17
337 0.14
338 0.11
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.09
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.15
350 0.14
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.13
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.18
375 0.16
376 0.14
377 0.12
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.09
412 0.11
413 0.16
414 0.18
415 0.27
416 0.36
417 0.41
418 0.51
419 0.6
420 0.69
421 0.75
422 0.83
423 0.85
424 0.86
425 0.9
426 0.9
427 0.9
428 0.87
429 0.85
430 0.84
431 0.8
432 0.73
433 0.69
434 0.62
435 0.56
436 0.49
437 0.45
438 0.35
439 0.32
440 0.34
441 0.28
442 0.26
443 0.26
444 0.28
445 0.25
446 0.28
447 0.31
448 0.31
449 0.33
450 0.42
451 0.45
452 0.52
453 0.61
454 0.68
455 0.69
456 0.7
457 0.68
458 0.59
459 0.54
460 0.46
461 0.41
462 0.32
463 0.29
464 0.22
465 0.23
466 0.22
467 0.19
468 0.16
469 0.12
470 0.1
471 0.07
472 0.07
473 0.05
474 0.12
475 0.13
476 0.15
477 0.17
478 0.17
479 0.17
480 0.18
481 0.2
482 0.16
483 0.21
484 0.23
485 0.24
486 0.24
487 0.24
488 0.23
489 0.21
490 0.2
491 0.14
492 0.09
493 0.07
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.08
498 0.1
499 0.1
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.15
504 0.17
505 0.23
506 0.24
507 0.26
508 0.33
509 0.41
510 0.42
511 0.41
512 0.46
513 0.42
514 0.41
515 0.4
516 0.36
517 0.35
518 0.39
519 0.47
520 0.5
521 0.56
522 0.65
523 0.7
524 0.72
525 0.76
526 0.81
527 0.81
528 0.81
529 0.81
530 0.83
531 0.84
532 0.84
533 0.82
534 0.74
535 0.7
536 0.64
537 0.56
538 0.48
539 0.4
540 0.33
541 0.29
542 0.32
543 0.3
544 0.28
545 0.27
546 0.24
547 0.24
548 0.23
549 0.26
550 0.33
551 0.39
552 0.46
553 0.51
554 0.55
555 0.61
556 0.67
557 0.65
558 0.6
559 0.57
560 0.52
561 0.5
562 0.47
563 0.41
564 0.35
565 0.32
566 0.27
567 0.2
568 0.15
569 0.13
570 0.1
571 0.09
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.07
576 0.08
577 0.09
578 0.09
579 0.15
580 0.17
581 0.18
582 0.18
583 0.18
584 0.17
585 0.2
586 0.25
587 0.23
588 0.26
589 0.28
590 0.33
591 0.37
592 0.42
593 0.44
594 0.44
595 0.48
596 0.53
597 0.63
598 0.66
599 0.72
600 0.71
601 0.7
602 0.69
603 0.65
604 0.63
605 0.54
606 0.46
607 0.36
608 0.33
609 0.3
610 0.26
611 0.24
612 0.17
613 0.18
614 0.21
615 0.24
616 0.24
617 0.23
618 0.24
619 0.22
620 0.25
621 0.25
622 0.25
623 0.25
624 0.26
625 0.29
626 0.29
627 0.3
628 0.26
629 0.25
630 0.2
631 0.16
632 0.15
633 0.12
634 0.1
635 0.08
636 0.09
637 0.07
638 0.07
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.09
651 0.09
652 0.1
653 0.15
654 0.17
655 0.18
656 0.21
657 0.25
658 0.25
659 0.27
660 0.25
661 0.23
662 0.24
663 0.26
664 0.24
665 0.21
666 0.21
667 0.21
668 0.26
669 0.23
670 0.2
671 0.18
672 0.2
673 0.2
674 0.19
675 0.21
676 0.17
677 0.18
678 0.19
679 0.19
680 0.17
681 0.19
682 0.24
683 0.26
684 0.26
685 0.26
686 0.26
687 0.25
688 0.24
689 0.23
690 0.19
691 0.17
692 0.16
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.16
697 0.16
698 0.16
699 0.18
700 0.21
701 0.21
702 0.2
703 0.21
704 0.2
705 0.19
706 0.18
707 0.14