Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6QM24

Protein Details
Accession A0A2J6QM24    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-29AAAKDLKAKKRKASMPEHNAEKPKKBasic
87-111EPSDQPSEKKEKKAKKAAKESVKEAHydrophilic
337-362EEAWEKRIEREQKRREKKAEKMKAIGBasic
407-434EAAPGTDSSKPKKKNKKSKAAKEGEPVAHydrophilic
466-490IAETAEKPSKKAKKDKKKKVKVVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-31DLKAKKRKASMPEHNAEKPKKVK
79-106KAKTTKKAEPSDQPSEKKEKKAKKAAKE
315-362NKRFKKVPWNKIEGRKLEQGASEEAWEKRIEREQKRREKKAEKMKAIG
369-381AIKSAKGVSKKGK
416-429KPKKKNKKSKAAKE
472-486KPSKKAKKDKKKKVK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 12.166, cyto_nucl 11.833, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKDAAAKDLKAKKRKASMPEHNAEKPKKVKNVVTDASEASAKKRKATEDASPVTAKKSKTPAADLTTDEGLVPTQTKKAKTTKKAEPSDQPSEKKEKKAKKAAKESVKEASNGVSVPVVSKTDKSSLKKQKASNDKAEATAEPKQAEDKDDEEVGEDSEDEMDDQTEALLKGFESDRDEELDEAEGGYEAGAKIPLITDNKELSKKRQAKLQKAADFPGQGKPGVVYVGRVPHGFYENEMKEYFGQFGTILNLRLSRNPKTGKSKHYAFIQFENAGVAEIVAKTMDNYLMFGHILKVKFIPEEQVPANVWKGANKRFKKVPWNKIEGRKLEQGASEEAWEKRIEREQKRREKKAEKMKAIGYELEAPAIKSAKGVSKKGKPVPELADKESQTAAVSTAEEGTKTIEAAPGTDSSKPKKKNKKSKAAKEGEPVAGLEEAGKPEKEAPSVDVRPAKEDVEESVAALIAETAEKPSKKAKKDKKKKVKVVAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.77
3 0.78
4 0.79
5 0.81
6 0.82
7 0.83
8 0.82
9 0.79
10 0.81
11 0.75
12 0.74
13 0.71
14 0.7
15 0.7
16 0.7
17 0.69
18 0.69
19 0.74
20 0.7
21 0.65
22 0.59
23 0.51
24 0.45
25 0.42
26 0.33
27 0.3
28 0.33
29 0.3
30 0.33
31 0.37
32 0.39
33 0.44
34 0.49
35 0.52
36 0.54
37 0.57
38 0.56
39 0.54
40 0.5
41 0.48
42 0.47
43 0.39
44 0.36
45 0.4
46 0.41
47 0.43
48 0.48
49 0.49
50 0.5
51 0.52
52 0.47
53 0.43
54 0.37
55 0.33
56 0.27
57 0.2
58 0.15
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.15
63 0.2
64 0.23
65 0.29
66 0.39
67 0.49
68 0.56
69 0.64
70 0.68
71 0.74
72 0.79
73 0.8
74 0.8
75 0.77
76 0.78
77 0.77
78 0.71
79 0.66
80 0.69
81 0.68
82 0.67
83 0.69
84 0.69
85 0.72
86 0.78
87 0.81
88 0.82
89 0.87
90 0.87
91 0.88
92 0.83
93 0.77
94 0.73
95 0.66
96 0.56
97 0.46
98 0.38
99 0.29
100 0.23
101 0.19
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.15
110 0.21
111 0.28
112 0.32
113 0.42
114 0.51
115 0.59
116 0.65
117 0.68
118 0.7
119 0.74
120 0.77
121 0.75
122 0.71
123 0.63
124 0.58
125 0.54
126 0.45
127 0.39
128 0.37
129 0.31
130 0.24
131 0.23
132 0.24
133 0.23
134 0.24
135 0.22
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.15
141 0.15
142 0.13
143 0.1
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.13
187 0.16
188 0.19
189 0.25
190 0.27
191 0.29
192 0.38
193 0.44
194 0.43
195 0.48
196 0.54
197 0.57
198 0.66
199 0.69
200 0.65
201 0.59
202 0.6
203 0.54
204 0.48
205 0.39
206 0.34
207 0.26
208 0.19
209 0.17
210 0.15
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.17
225 0.17
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.11
241 0.11
242 0.16
243 0.19
244 0.21
245 0.27
246 0.3
247 0.35
248 0.43
249 0.48
250 0.5
251 0.53
252 0.54
253 0.51
254 0.55
255 0.54
256 0.46
257 0.44
258 0.4
259 0.34
260 0.3
261 0.26
262 0.18
263 0.13
264 0.11
265 0.07
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.14
289 0.11
290 0.15
291 0.14
292 0.16
293 0.16
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.21
300 0.28
301 0.37
302 0.39
303 0.44
304 0.49
305 0.55
306 0.62
307 0.67
308 0.68
309 0.67
310 0.72
311 0.74
312 0.77
313 0.79
314 0.72
315 0.67
316 0.63
317 0.56
318 0.49
319 0.43
320 0.35
321 0.3
322 0.26
323 0.22
324 0.19
325 0.18
326 0.18
327 0.17
328 0.15
329 0.16
330 0.23
331 0.32
332 0.38
333 0.49
334 0.58
335 0.69
336 0.78
337 0.84
338 0.87
339 0.86
340 0.86
341 0.87
342 0.87
343 0.82
344 0.77
345 0.71
346 0.66
347 0.59
348 0.5
349 0.4
350 0.34
351 0.28
352 0.24
353 0.21
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.09
359 0.11
360 0.17
361 0.23
362 0.29
363 0.36
364 0.43
365 0.52
366 0.58
367 0.63
368 0.58
369 0.59
370 0.6
371 0.61
372 0.58
373 0.54
374 0.54
375 0.48
376 0.47
377 0.41
378 0.34
379 0.25
380 0.2
381 0.17
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.13
398 0.15
399 0.2
400 0.24
401 0.29
402 0.38
403 0.47
404 0.56
405 0.64
406 0.74
407 0.8
408 0.87
409 0.9
410 0.93
411 0.94
412 0.95
413 0.92
414 0.88
415 0.84
416 0.8
417 0.71
418 0.6
419 0.49
420 0.39
421 0.31
422 0.24
423 0.17
424 0.13
425 0.13
426 0.15
427 0.15
428 0.14
429 0.18
430 0.21
431 0.22
432 0.21
433 0.22
434 0.29
435 0.32
436 0.37
437 0.39
438 0.38
439 0.4
440 0.4
441 0.37
442 0.3
443 0.28
444 0.24
445 0.24
446 0.23
447 0.2
448 0.18
449 0.17
450 0.15
451 0.14
452 0.11
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.1
457 0.16
458 0.17
459 0.2
460 0.3
461 0.38
462 0.47
463 0.58
464 0.66
465 0.71
466 0.82
467 0.91
468 0.92
469 0.95
470 0.96