Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6PGJ5

Protein Details
Accession A0A2J6PGJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50HILDSQRPRKRIKQDTETLKLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
544-593NARGGRGNNQRGGNQRGGGQQRGGAQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPG
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11, nucl 7.5, pero 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDDSLVAALENVRLSSSTSDNTADDLVDHILDSQRPRKRIKQDTETLKLSLEEKYLTPSTSFSPEWLNKLQQRWEAPTDYTTLFKIAPTQTRTITRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSFLRKPANRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEAAAALEEQAIRDEVKVQDGKSKLERVINFSGEGGLLEVPPGFERGLDFGKKKKDESDIKEAEEVENVLEEEPEDELAQEGGKENGAVADPGDASDEDGEDDIDSLLPVEFPALEPHGVLAASSAKRGGREWAHMVDVKRDITNFRELVPDMAKEWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQVFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKRKDIYVISTPKRPVPLEHYLWADKGVHKIVDSEKRFIEKGWKDANDVLSGRDKQKVLPAPEANARGGGNARGGRGNNQRGGNQRGGGQQRGGAQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPGGRTSAAQDKTLWVHLVQFLKKESLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTATEKSAIHMIIEKSIARLKPEDRVLPQIVRLRDLLGRGIAVHHGGLLPIVKEVVEMLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVASGGGEAPPVTELRQMILGDPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKVSEADLAKIKREACDTCDKDLDDCHQAAQNYKQLTLDLHLGLLATPVGRRMFSPKRLVVYTRDGIRTPGILLREGATSGPAPTVHVLEIRTRRDQRDSTDLLPYLPKFRSLFTRLPLQHKKSIVTKALHIPVSDIECVTQTVLKGVIPDIFNGGEEYQKARDQLWLVCQSWQLDEWNEMDLSRVKDLALRDFIAKRFEEMKVAQKGQCLKCPQFVKHFAMCHDQWLIKENISQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRLQVLKDLDFIDDSSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILDNVLAAYEPAEIVALLSAFVFQEKTDMVPNLTGNLEKGMKTIIEISEKVNERQTYHQVILSSDDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPELFTKMQTCQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.14
3 0.17
4 0.17
5 0.19
6 0.21
7 0.21
8 0.22
9 0.21
10 0.17
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.12
18 0.16
19 0.22
20 0.29
21 0.35
22 0.41
23 0.49
24 0.57
25 0.65
26 0.72
27 0.77
28 0.78
29 0.81
30 0.84
31 0.85
32 0.79
33 0.69
34 0.59
35 0.5
36 0.42
37 0.34
38 0.27
39 0.21
40 0.18
41 0.23
42 0.24
43 0.24
44 0.23
45 0.22
46 0.23
47 0.27
48 0.26
49 0.22
50 0.29
51 0.31
52 0.36
53 0.4
54 0.45
55 0.45
56 0.51
57 0.56
58 0.54
59 0.56
60 0.57
61 0.57
62 0.52
63 0.49
64 0.44
65 0.41
66 0.35
67 0.32
68 0.26
69 0.22
70 0.19
71 0.17
72 0.22
73 0.24
74 0.3
75 0.33
76 0.37
77 0.4
78 0.47
79 0.49
80 0.5
81 0.5
82 0.48
83 0.47
84 0.45
85 0.46
86 0.41
87 0.42
88 0.4
89 0.38
90 0.32
91 0.31
92 0.33
93 0.28
94 0.26
95 0.24
96 0.21
97 0.17
98 0.19
99 0.2
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.27
113 0.28
114 0.33
115 0.4
116 0.43
117 0.49
118 0.57
119 0.61
120 0.59
121 0.6
122 0.61
123 0.54
124 0.51
125 0.49
126 0.38
127 0.32
128 0.27
129 0.24
130 0.17
131 0.14
132 0.14
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.12
156 0.12
157 0.19
158 0.22
159 0.21
160 0.28
161 0.29
162 0.34
163 0.36
164 0.4
165 0.37
166 0.41
167 0.43
168 0.43
169 0.47
170 0.43
171 0.38
172 0.34
173 0.3
174 0.23
175 0.21
176 0.15
177 0.09
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.11
188 0.17
189 0.21
190 0.24
191 0.29
192 0.39
193 0.42
194 0.43
195 0.45
196 0.49
197 0.54
198 0.59
199 0.63
200 0.57
201 0.57
202 0.57
203 0.53
204 0.43
205 0.35
206 0.27
207 0.17
208 0.13
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.07
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.14
267 0.14
268 0.16
269 0.17
270 0.22
271 0.2
272 0.25
273 0.29
274 0.29
275 0.32
276 0.34
277 0.35
278 0.33
279 0.32
280 0.29
281 0.25
282 0.24
283 0.23
284 0.23
285 0.29
286 0.24
287 0.22
288 0.24
289 0.23
290 0.26
291 0.25
292 0.23
293 0.17
294 0.22
295 0.21
296 0.18
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.17
302 0.17
303 0.19
304 0.21
305 0.2
306 0.2
307 0.19
308 0.2
309 0.2
310 0.19
311 0.17
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.15
316 0.14
317 0.1
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.1
347 0.11
348 0.18
349 0.19
350 0.21
351 0.23
352 0.26
353 0.26
354 0.3
355 0.38
356 0.38
357 0.47
358 0.47
359 0.52
360 0.53
361 0.55
362 0.61
363 0.52
364 0.45
365 0.42
366 0.41
367 0.34
368 0.3
369 0.29
370 0.17
371 0.17
372 0.15
373 0.08
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.09
412 0.07
413 0.06
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.16
458 0.21
459 0.26
460 0.28
461 0.32
462 0.36
463 0.37
464 0.4
465 0.37
466 0.38
467 0.41
468 0.48
469 0.46
470 0.46
471 0.45
472 0.43
473 0.44
474 0.38
475 0.31
476 0.3
477 0.35
478 0.33
479 0.34
480 0.36
481 0.33
482 0.32
483 0.31
484 0.25
485 0.19
486 0.18
487 0.17
488 0.14
489 0.13
490 0.15
491 0.2
492 0.28
493 0.29
494 0.29
495 0.28
496 0.31
497 0.31
498 0.29
499 0.33
500 0.26
501 0.31
502 0.35
503 0.34
504 0.34
505 0.37
506 0.37
507 0.31
508 0.28
509 0.23
510 0.21
511 0.23
512 0.22
513 0.24
514 0.23
515 0.2
516 0.27
517 0.31
518 0.29
519 0.34
520 0.34
521 0.32
522 0.36
523 0.37
524 0.31
525 0.26
526 0.22
527 0.16
528 0.16
529 0.14
530 0.13
531 0.12
532 0.12
533 0.13
534 0.14
535 0.19
536 0.27
537 0.3
538 0.32
539 0.32
540 0.35
541 0.38
542 0.42
543 0.38
544 0.31
545 0.29
546 0.3
547 0.31
548 0.29
549 0.24
550 0.22
551 0.23
552 0.27
553 0.26
554 0.24
555 0.22
556 0.24
557 0.27
558 0.27
559 0.25
560 0.26
561 0.27
562 0.29
563 0.3
564 0.34
565 0.34
566 0.37
567 0.37
568 0.35
569 0.4
570 0.36
571 0.36
572 0.31
573 0.28
574 0.25
575 0.3
576 0.28
577 0.21
578 0.21
579 0.2
580 0.19
581 0.19
582 0.18
583 0.14
584 0.22
585 0.22
586 0.22
587 0.21
588 0.21
589 0.21
590 0.22
591 0.19
592 0.1
593 0.1
594 0.13
595 0.17
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.16
600 0.16
601 0.16
602 0.14
603 0.12
604 0.13
605 0.12
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.17
612 0.17
613 0.24
614 0.24
615 0.26
616 0.27
617 0.32
618 0.34
619 0.34
620 0.38
621 0.33
622 0.31
623 0.29
624 0.28
625 0.23
626 0.19
627 0.13
628 0.08
629 0.06
630 0.11
631 0.11
632 0.1
633 0.14
634 0.14
635 0.13
636 0.16
637 0.16
638 0.12
639 0.15
640 0.14
641 0.12
642 0.13
643 0.12
644 0.1
645 0.14
646 0.14
647 0.12
648 0.14
649 0.14
650 0.19
651 0.22
652 0.24
653 0.22
654 0.27
655 0.27
656 0.25
657 0.29
658 0.28
659 0.26
660 0.24
661 0.23
662 0.19
663 0.18
664 0.19
665 0.15
666 0.1
667 0.1
668 0.08
669 0.08
670 0.07
671 0.06
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.04
694 0.05
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.06
700 0.05
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.06
710 0.06
711 0.07
712 0.07
713 0.07
714 0.08
715 0.1
716 0.13
717 0.19
718 0.23
719 0.28
720 0.28
721 0.29
722 0.34
723 0.36
724 0.38
725 0.41
726 0.41
727 0.36
728 0.41
729 0.4
730 0.34
731 0.29
732 0.25
733 0.19
734 0.15
735 0.15
736 0.09
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.11
741 0.11
742 0.11
743 0.12
744 0.12
745 0.12
746 0.12
747 0.12
748 0.11
749 0.09
750 0.09
751 0.07
752 0.07
753 0.05
754 0.05
755 0.04
756 0.03
757 0.02
758 0.02
759 0.02
760 0.02
761 0.02
762 0.02
763 0.02
764 0.03
765 0.04
766 0.05
767 0.06
768 0.07
769 0.07
770 0.1
771 0.1
772 0.1
773 0.14
774 0.14
775 0.14
776 0.15
777 0.16
778 0.17
779 0.19
780 0.2
781 0.19
782 0.24
783 0.29
784 0.32
785 0.37
786 0.35
787 0.38
788 0.38
789 0.36
790 0.32
791 0.25
792 0.22
793 0.15
794 0.13
795 0.09
796 0.07
797 0.06
798 0.05
799 0.06
800 0.06
801 0.07
802 0.09
803 0.11
804 0.13
805 0.14
806 0.14
807 0.14
808 0.15
809 0.17
810 0.17
811 0.19
812 0.19
813 0.23
814 0.25
815 0.25
816 0.24
817 0.26
818 0.26
819 0.24
820 0.22
821 0.19
822 0.17
823 0.18
824 0.17
825 0.16
826 0.15
827 0.13
828 0.13
829 0.16
830 0.15
831 0.15
832 0.2
833 0.18
834 0.18
835 0.21
836 0.21
837 0.18
838 0.21
839 0.21
840 0.21
841 0.32
842 0.33
843 0.33
844 0.36
845 0.34
846 0.31
847 0.32
848 0.3
849 0.23
850 0.21
851 0.19
852 0.18
853 0.18
854 0.21
855 0.23
856 0.24
857 0.22
858 0.22
859 0.21
860 0.19
861 0.19
862 0.18
863 0.17
864 0.12
865 0.11
866 0.1
867 0.1
868 0.09
869 0.09
870 0.07
871 0.04
872 0.04
873 0.07
874 0.07
875 0.08
876 0.08
877 0.17
878 0.24
879 0.3
880 0.38
881 0.38
882 0.42
883 0.44
884 0.46
885 0.42
886 0.42
887 0.4
888 0.38
889 0.37
890 0.33
891 0.32
892 0.31
893 0.26
894 0.2
895 0.18
896 0.15
897 0.14
898 0.14
899 0.13
900 0.13
901 0.13
902 0.11
903 0.1
904 0.09
905 0.09
906 0.09
907 0.08
908 0.08
909 0.09
910 0.1
911 0.09
912 0.11
913 0.11
914 0.17
915 0.24
916 0.27
917 0.35
918 0.38
919 0.41
920 0.46
921 0.48
922 0.47
923 0.49
924 0.49
925 0.43
926 0.44
927 0.41
928 0.35
929 0.35
930 0.31
931 0.28
932 0.24
933 0.26
934 0.21
935 0.23
936 0.29
937 0.32
938 0.35
939 0.33
940 0.42
941 0.42
942 0.51
943 0.59
944 0.57
945 0.57
946 0.55
947 0.56
948 0.53
949 0.56
950 0.53
951 0.46
952 0.45
953 0.46
954 0.49
955 0.46
956 0.39
957 0.33
958 0.29
959 0.29
960 0.25
961 0.18
962 0.13
963 0.12
964 0.13
965 0.12
966 0.11
967 0.08
968 0.08
969 0.09
970 0.09
971 0.09
972 0.1
973 0.13
974 0.12
975 0.12
976 0.13
977 0.12
978 0.12
979 0.13
980 0.13
981 0.1
982 0.11
983 0.13
984 0.14
985 0.16
986 0.16
987 0.16
988 0.19
989 0.2
990 0.22
991 0.27
992 0.3
993 0.29
994 0.3
995 0.32
996 0.29
997 0.28
998 0.26
999 0.21
1000 0.16
1001 0.17
1002 0.16
1003 0.16
1004 0.15
1005 0.13
1006 0.14
1007 0.16
1008 0.17
1009 0.16
1010 0.16
1011 0.14
1012 0.17
1013 0.19
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.21
1017 0.24
1018 0.27
1019 0.29
1020 0.3
1021 0.29
1022 0.26
1023 0.27
1024 0.26
1025 0.27
1026 0.27
1027 0.33
1028 0.36
1029 0.4
1030 0.39
1031 0.4
1032 0.48
1033 0.47
1034 0.51
1035 0.5
1036 0.46
1037 0.5
1038 0.54
1039 0.55
1040 0.54
1041 0.58
1042 0.57
1043 0.55
1044 0.55
1045 0.5
1046 0.52
1047 0.47
1048 0.41
1049 0.38
1050 0.33
1051 0.28
1052 0.3
1053 0.29
1054 0.22
1055 0.24
1056 0.26
1057 0.29
1058 0.29
1059 0.3
1060 0.26
1061 0.26
1062 0.26
1063 0.25
1064 0.26
1065 0.22
1066 0.26
1067 0.25
1068 0.27
1069 0.25
1070 0.25
1071 0.24
1072 0.2
1073 0.19
1074 0.19
1075 0.23
1076 0.21
1077 0.23
1078 0.24
1079 0.26
1080 0.25
1081 0.27
1082 0.24
1083 0.2
1084 0.23
1085 0.22
1086 0.22
1087 0.2
1088 0.2
1089 0.18
1090 0.16
1091 0.16
1092 0.17
1093 0.18
1094 0.18
1095 0.19
1096 0.23
1097 0.26
1098 0.31
1099 0.32
1100 0.35
1101 0.33
1102 0.34
1103 0.36
1104 0.34
1105 0.3
1106 0.25
1107 0.24
1108 0.17
1109 0.17
1110 0.16
1111 0.13
1112 0.11
1113 0.09
1114 0.07
1115 0.07
1116 0.07
1117 0.06
1118 0.05
1119 0.04
1120 0.04
1121 0.04
1122 0.04
1123 0.03
1124 0.04
1125 0.04
1126 0.04
1127 0.04
1128 0.04
1129 0.04
1130 0.04
1131 0.05
1132 0.04
1133 0.04
1134 0.04
1135 0.05
1136 0.05
1137 0.06
1138 0.06
1139 0.05
1140 0.07
1141 0.08
1142 0.09
1143 0.14
1144 0.15
1145 0.16
1146 0.18
1147 0.19
1148 0.19
1149 0.2
1150 0.19
1151 0.15
1152 0.18
1153 0.18
1154 0.16
1155 0.16
1156 0.16
1157 0.15
1158 0.15
1159 0.18
1160 0.17
1161 0.2
1162 0.21
1163 0.23
1164 0.29
1165 0.32
1166 0.33
1167 0.37
1168 0.36
1169 0.35
1170 0.4
1171 0.45
1172 0.43
1173 0.42
1174 0.43
1175 0.37
1176 0.35
1177 0.36
1178 0.32
1179 0.26
1180 0.2
1181 0.19
1182 0.17
1183 0.18
1184 0.18
1185 0.14
1186 0.17
1187 0.19
1188 0.2
1189 0.2
1190 0.21
1191 0.2
1192 0.2
1193 0.26
1194 0.22
1195 0.23
1196 0.21
1197 0.23
1198 0.21
1199 0.21
1200 0.2
1201 0.14
1202 0.13
1203 0.1
1204 0.12
1205 0.16
1206 0.2
1207 0.2
1208 0.25
1209 0.26
1210 0.27
1211 0.29
1212 0.27
1213 0.22
1214 0.21
1215 0.19
1216 0.15
1217 0.15
1218 0.14
1219 0.12
1220 0.14
1221 0.11
1222 0.09
1223 0.1
1224 0.1
1225 0.11
1226 0.16
1227 0.17
1228 0.19
1229 0.24
1230 0.29
1231 0.35
1232 0.38
1233 0.38
1234 0.36
1235 0.39
1236 0.43
1237 0.44
1238 0.42
1239 0.37
1240 0.36
1241 0.38
1242 0.41
1243 0.37
1244 0.29
1245 0.25
1246 0.27
1247 0.25
1248 0.24
1249 0.22
1250 0.19
1251 0.25
1252 0.26
1253 0.26
1254 0.3
1255 0.37
1256 0.43
1257 0.44
1258 0.46
1259 0.4
1260 0.39
1261 0.4
1262 0.34
1263 0.28