FuNGI

A0A2J6QHL7

Protein Details

Accession

A0A2J6QHL7

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-53	QFVRKPKAADPLRPRKKPVRRPNGPPRQPVGL	Hydrophilic
420-445	KELEEEKKEAKKRKDLSKGLKKALIK	Basic
457-487	DDHPYSEKTIRRMKRNRRRLTEKRMKRRRTR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-49	RKPKAADPLRPRKKPVRRPNGPPRQ
426-446	KKEAKKRKDLSKGLKKALIKR
466-487	IRRMKRNRRRLTEKRMKRRRTR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGLSNGRTPTPNGGHPQFVRKPKAADPLRPRKKPVRRPNGPPRQPVGLGISAPGPPGRPNPLNGAAPARVMGGYQPPANGTYNPHLNGGWTNPPPAAGQYTDFPLFTTKRALREGLRYHIARFASTKKDIDPSNQDDFTRPVVLHRRDPKQPPPGKGVKDEDAVADEPMDSKEREKQEILKAEKEKQKAADLAQIAPTGNNPSALAAKKTQAFRNEKTTQVHRLDKTEEQKKASDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNVIFFIDGDKFRMIPIEKWYKFTPKGLFQHFTIEEAEAKMSKKHKESRWVMKTNEQKEADRAAQDTRKYLHNLYTVKAESNTIKSVGKREVEDMDDLDFDADDLFQDDDEQATVEPDKDEETKDAQDRIKREQLGANIFDKADEAEVEKELEEEKKEAKKRKDLSKGLKKALIKRERNYVYDSDSDDHPYSEKTIRRMKRNRRRLTEKRMKRRRTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.38
3	0.42
4	0.46
5	0.45
6	0.49
7	0.49
8	0.56
9	0.56
10	0.61
11	0.62
12	0.58
13	0.6
14	0.59
15	0.66
16	0.64
17	0.65
18	0.67
19	0.72
20	0.78
21	0.79
22	0.81
23	0.81
24	0.85
25	0.86
26	0.86
27	0.86
28	0.85
29	0.89
30	0.93
31	0.93
32	0.91
33	0.88
34	0.82
35	0.77
36	0.68
37	0.6
38	0.54
39	0.45
40	0.37
41	0.29
42	0.26
43	0.2
44	0.2
45	0.18
46	0.13
47	0.13
48	0.17
49	0.24
50	0.25
51	0.27
52	0.33
53	0.38
54	0.39
55	0.38
56	0.39
57	0.32
58	0.3
59	0.27
60	0.21
61	0.15
62	0.13
63	0.13
64	0.13
65	0.15
66	0.16
67	0.16
68	0.16
69	0.19
70	0.21
71	0.2
72	0.2
73	0.24
74	0.29
75	0.3
76	0.3
77	0.27
78	0.27
79	0.27
80	0.26
81	0.27
82	0.23
83	0.23
84	0.22
85	0.23
86	0.22
87	0.22
88	0.21
89	0.15
90	0.15
91	0.15
92	0.19
93	0.19
94	0.18
95	0.17
96	0.19
97	0.19
98	0.18
99	0.25
100	0.25
101	0.28
102	0.31
103	0.34
104	0.32
105	0.4
106	0.44
107	0.41
108	0.45
109	0.42
110	0.4
111	0.41
112	0.38
113	0.31
114	0.29
115	0.28
116	0.28
117	0.31
118	0.31
119	0.28
120	0.33
121	0.33
122	0.36
123	0.39
124	0.38
125	0.4
126	0.41
127	0.39
128	0.36
129	0.37
130	0.33
131	0.27
132	0.21
133	0.21
134	0.29
135	0.32
136	0.39
137	0.44
138	0.48
139	0.53
140	0.6
141	0.64
142	0.65
143	0.68
144	0.63
145	0.63
146	0.66
147	0.61
148	0.6
149	0.56
150	0.49
151	0.43
152	0.4
153	0.32
154	0.27
155	0.24
156	0.18
157	0.13
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.11
162	0.09
163	0.1
164	0.16
165	0.19
166	0.22
167	0.24
168	0.28
169	0.34
170	0.42
171	0.44
172	0.45
173	0.45
174	0.5
175	0.54
176	0.51
177	0.47
178	0.4
179	0.4
180	0.35
181	0.33
182	0.3
183	0.25
184	0.24
185	0.22
186	0.21
187	0.17
188	0.15
189	0.14
190	0.11
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.08
195	0.12
196	0.12
197	0.14
198	0.13
199	0.15
200	0.19
201	0.22
202	0.25
203	0.3
204	0.36
205	0.37
206	0.44
207	0.45
208	0.45
209	0.46
210	0.46
211	0.45
212	0.45
213	0.48
214	0.4
215	0.4
216	0.4
217	0.41
218	0.45
219	0.45
220	0.42
221	0.38
222	0.38
223	0.38
224	0.4
225	0.37
226	0.33
227	0.27
228	0.25
229	0.25
230	0.24
231	0.23
232	0.18
233	0.17
234	0.13
235	0.12
236	0.11
237	0.09
238	0.08
239	0.1
240	0.13
241	0.16
242	0.16
243	0.15
244	0.16
245	0.16
246	0.15
247	0.15
248	0.11
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.07
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.14
271	0.13
272	0.13
273	0.2
274	0.29
275	0.29
276	0.33
277	0.36
278	0.39
279	0.39
280	0.43
281	0.4
282	0.38
283	0.43
284	0.45
285	0.45
286	0.39
287	0.44
288	0.39
289	0.36
290	0.28
291	0.23
292	0.18
293	0.16
294	0.16
295	0.11
296	0.12
297	0.14
298	0.18
299	0.22
300	0.29
301	0.37
302	0.42
303	0.51
304	0.59
305	0.66
306	0.71
307	0.73
308	0.68
309	0.68
310	0.71
311	0.64
312	0.64
313	0.56
314	0.47
315	0.43
316	0.45
317	0.39
318	0.32
319	0.29
320	0.26
321	0.28
322	0.28
323	0.28
324	0.26
325	0.28
326	0.3
327	0.3
328	0.3
329	0.32
330	0.33
331	0.31
332	0.35
333	0.32
334	0.3
335	0.29
336	0.26
337	0.21
338	0.23
339	0.23
340	0.19
341	0.21
342	0.21
343	0.26
344	0.29
345	0.29
346	0.27
347	0.28
348	0.29
349	0.28
350	0.28
351	0.24
352	0.19
353	0.17
354	0.15
355	0.13
356	0.09
357	0.07
358	0.06
359	0.05
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.11
376	0.12
377	0.14
378	0.15
379	0.18
380	0.23
381	0.26
382	0.31
383	0.33
384	0.36
385	0.39
386	0.44
387	0.48
388	0.44
389	0.44
390	0.43
391	0.45
392	0.46
393	0.45
394	0.39
395	0.33
396	0.32
397	0.29
398	0.24
399	0.19
400	0.13
401	0.1
402	0.11
403	0.11
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.13
409	0.15
410	0.15
411	0.16
412	0.21
413	0.29
414	0.38
415	0.47
416	0.54
417	0.61
418	0.68
419	0.76
420	0.8
421	0.82
422	0.85
423	0.87
424	0.88
425	0.84
426	0.82
427	0.77
428	0.76
429	0.76
430	0.76
431	0.73
432	0.69
433	0.73
434	0.72
435	0.68
436	0.65
437	0.57
438	0.52
439	0.47
440	0.46
441	0.38
442	0.35
443	0.38
444	0.33
445	0.3
446	0.27
447	0.24
448	0.25
449	0.29
450	0.32
451	0.34
452	0.43
453	0.51
454	0.6
455	0.69
456	0.77
457	0.81
458	0.87
459	0.9
460	0.91
461	0.94
462	0.93
463	0.94
464	0.94
465	0.94
466	0.94
467	0.94

A0A2J6QHL7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer