FuNGI

A0A2J6PX85

Protein Details

Accession

A0A2J6PX85

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
120-139	KPVGSRFKPKNIRRDAKELE	Basic
433-462	AAASGQKHRKARRPSKKKEKKPVIQTEEDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-19	AVRGPGRGRGRGRGK
122-184	VGSRFKPKNIRRDAKELEDLQKKEKIRLDAIAAEEARKAARAARGRGWGMRGRGDAMGRGGGR
438-454	QKHRKARRPSKKKEKKP

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAVRGPGRGRGRGRGKALASSLEEDPSISQSDPQSNVDSQSAMASSSSLEIPIPKSTTPQNEFLDADPSPNSSPATVWTETPAPTPIRPPSTLKTESSSRILPPTRGGIASRGSEVKPVGSRFKPKNIRRDAKELEDLQKKEKIRLDAIAAEEARKAARAARGRGWGMRGRGDAMGRGGGRAARVATASGTFGVVPEGLQKNPEFFASKAGASGPGGSSRSGGSGLSGVVKAEGAHFSRGDYTSTGRTGNRDFIPDPQYPYEDIDAPRVDIELINVVSDDSDDDPVITGVRKVPTGRDKSTSKGGLKPVRLHRQEHKERITMVNTEPTIKIQSDSEDESPVIDELQSSRAPVKEKEFKGTYQDVEDTRIKAEPDTAEHGMPMNLPVHGIPHPPKPQVPFKEGTHSPESKRKTKDQLVSSTIDLDGPEDEAAASGQKHRKARRPSKKKEKKPVIQTEEDRAEYERHMEDVAILANELGGLQGNLGAPPREPNGDIPMEDVEVRDKKEGRLYLFQFPPVLPELYNPLNEKPKTKAETKSEKSAEKATKADEDVQMTGMSAKTKGKMKEKVDLTGDATVKVEEEVELGPDGKLKKEEDKRRREEVVHEEGWIGKLVVRESGKVELCWGGTNLAVGRGVDAGFLTTGVMVDMIEKGPPGGGPPEGKALSMGQIMGKFVVTPDWEKMV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.74
3	0.71
4	0.69
5	0.62
6	0.59
7	0.57
8	0.52
9	0.46
10	0.41
11	0.36
12	0.3
13	0.27
14	0.22
15	0.21
16	0.18
17	0.17
18	0.14
19	0.16
20	0.19
21	0.24
22	0.27
23	0.29
24	0.31
25	0.3
26	0.32
27	0.3
28	0.26
29	0.21
30	0.2
31	0.17
32	0.13
33	0.12
34	0.09
35	0.09
36	0.1
37	0.1
38	0.08
39	0.09
40	0.11
41	0.13
42	0.18
43	0.2
44	0.18
45	0.22
46	0.28
47	0.37
48	0.39
49	0.44
50	0.42
51	0.43
52	0.45
53	0.42
54	0.4
55	0.3
56	0.28
57	0.21
58	0.21
59	0.19
60	0.19
61	0.18
62	0.14
63	0.15
64	0.17
65	0.23
66	0.21
67	0.2
68	0.22
69	0.24
70	0.24
71	0.26
72	0.25
73	0.22
74	0.23
75	0.28
76	0.32
77	0.34
78	0.37
79	0.41
80	0.41
81	0.47
82	0.5
83	0.46
84	0.44
85	0.44
86	0.45
87	0.44
88	0.41
89	0.35
90	0.39
91	0.4
92	0.36
93	0.34
94	0.35
95	0.33
96	0.31
97	0.3
98	0.26
99	0.26
100	0.26
101	0.26
102	0.24
103	0.22
104	0.24
105	0.23
106	0.23
107	0.24
108	0.26
109	0.31
110	0.34
111	0.43
112	0.45
113	0.55
114	0.62
115	0.65
116	0.72
117	0.75
118	0.8
119	0.76
120	0.8
121	0.75
122	0.71
123	0.71
124	0.65
125	0.63
126	0.61
127	0.57
128	0.52
129	0.52
130	0.47
131	0.46
132	0.47
133	0.43
134	0.37
135	0.38
136	0.38
137	0.35
138	0.36
139	0.34
140	0.29
141	0.25
142	0.22
143	0.2
144	0.17
145	0.14
146	0.12
147	0.11
148	0.18
149	0.24
150	0.28
151	0.34
152	0.39
153	0.41
154	0.43
155	0.44
156	0.42
157	0.38
158	0.37
159	0.32
160	0.28
161	0.28
162	0.27
163	0.23
164	0.19
165	0.2
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.13
170	0.12
171	0.12
172	0.11
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.06
185	0.05
186	0.11
187	0.12
188	0.12
189	0.15
190	0.15
191	0.16
192	0.16
193	0.18
194	0.15
195	0.13
196	0.18
197	0.18
198	0.18
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.13
203	0.14
204	0.1
205	0.1
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.09
224	0.09
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.14
229	0.14
230	0.15
231	0.13
232	0.14
233	0.15
234	0.16
235	0.18
236	0.16
237	0.18
238	0.19
239	0.23
240	0.22
241	0.23
242	0.23
243	0.26
244	0.3
245	0.29
246	0.31
247	0.27
248	0.27
249	0.25
250	0.26
251	0.22
252	0.2
253	0.19
254	0.19
255	0.18
256	0.17
257	0.16
258	0.14
259	0.13
260	0.09
261	0.09
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.07
280	0.09
281	0.1
282	0.1
283	0.16
284	0.24
285	0.3
286	0.32
287	0.35
288	0.36
289	0.38
290	0.44
291	0.44
292	0.38
293	0.37
294	0.42
295	0.42
296	0.44
297	0.48
298	0.5
299	0.54
300	0.55
301	0.55
302	0.55
303	0.6
304	0.65
305	0.66
306	0.62
307	0.54
308	0.53
309	0.51
310	0.45
311	0.37
312	0.29
313	0.25
314	0.21
315	0.21
316	0.19
317	0.17
318	0.16
319	0.14
320	0.14
321	0.1
322	0.11
323	0.11
324	0.14
325	0.14
326	0.13
327	0.12
328	0.12
329	0.12
330	0.1
331	0.08
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.09
339	0.11
340	0.13
341	0.15
342	0.21
343	0.27
344	0.28
345	0.34
346	0.34
347	0.33
348	0.37
349	0.37
350	0.31
351	0.24
352	0.25
353	0.2
354	0.23
355	0.24
356	0.19
357	0.17
358	0.18
359	0.16
360	0.14
361	0.15
362	0.11
363	0.12
364	0.16
365	0.17
366	0.15
367	0.15
368	0.15
369	0.13
370	0.13
371	0.11
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.08
378	0.12
379	0.13
380	0.2
381	0.24
382	0.25
383	0.28
384	0.31
385	0.39
386	0.4
387	0.43
388	0.4
389	0.37
390	0.44
391	0.42
392	0.43
393	0.41
394	0.39
395	0.38
396	0.41
397	0.45
398	0.45
399	0.49
400	0.5
401	0.52
402	0.57
403	0.62
404	0.6
405	0.61
406	0.57
407	0.54
408	0.48
409	0.4
410	0.32
411	0.25
412	0.18
413	0.12
414	0.08
415	0.07
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.1
424	0.15
425	0.2
426	0.27
427	0.34
428	0.43
429	0.53
430	0.64
431	0.7
432	0.77
433	0.83
434	0.88
435	0.93
436	0.94
437	0.95
438	0.94
439	0.92
440	0.92
441	0.91
442	0.87
443	0.84
444	0.76
445	0.72
446	0.65
447	0.56
448	0.46
449	0.37
450	0.31
451	0.23
452	0.24
453	0.17
454	0.13
455	0.13
456	0.12
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.07
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.09
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.14
481	0.19
482	0.2
483	0.19
484	0.19
485	0.18
486	0.17
487	0.16
488	0.14
489	0.15
490	0.16
491	0.17
492	0.2
493	0.21
494	0.22
495	0.29
496	0.32
497	0.32
498	0.38
499	0.4
500	0.44
501	0.44
502	0.44
503	0.38
504	0.34
505	0.32
506	0.26
507	0.23
508	0.15
509	0.14
510	0.18
511	0.19
512	0.22
513	0.21
514	0.23
515	0.31
516	0.32
517	0.34
518	0.34
519	0.41
520	0.43
521	0.46
522	0.5
523	0.52
524	0.61
525	0.63
526	0.68
527	0.65
528	0.63
529	0.6
530	0.61
531	0.56
532	0.5
533	0.47
534	0.4
535	0.39
536	0.38
537	0.4
538	0.34
539	0.31
540	0.27
541	0.26
542	0.23
543	0.19
544	0.18
545	0.14
546	0.12
547	0.12
548	0.13
549	0.17
550	0.24
551	0.31
552	0.39
553	0.47
554	0.5
555	0.57
556	0.58
557	0.59
558	0.56
559	0.52
560	0.45
561	0.43
562	0.39
563	0.31
564	0.28
565	0.22
566	0.19
567	0.16
568	0.13
569	0.07
570	0.08
571	0.07
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.12
577	0.13
578	0.15
579	0.18
580	0.19
581	0.29
582	0.38
583	0.5
584	0.57
585	0.67
586	0.71
587	0.76
588	0.79
589	0.72
590	0.7
591	0.67
592	0.65
593	0.55
594	0.49
595	0.42
596	0.37
597	0.35
598	0.27
599	0.19
600	0.12
601	0.14
602	0.13
603	0.19
604	0.19
605	0.2
606	0.22
607	0.28
608	0.28
609	0.26
610	0.27
611	0.23
612	0.23
613	0.23
614	0.21
615	0.15
616	0.14
617	0.15
618	0.14
619	0.13
620	0.13
621	0.11
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.09
626	0.09
627	0.08
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.04
636	0.05
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.08
644	0.1
645	0.11
646	0.14
647	0.17
648	0.19
649	0.26
650	0.26
651	0.26
652	0.25
653	0.23
654	0.22
655	0.21
656	0.2
657	0.16
658	0.16
659	0.17
660	0.16
661	0.15
662	0.12
663	0.11
664	0.14
665	0.15
666	0.17

A0A2J6PX85

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer