FuNGI

G0SWT3

Protein Details

Accession

G0SWT3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
590-609	AVKAERAARRQEKKGTKEAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
580-623	TADDKKARKAAVKAERAARRQEKKGTKEAFESETKRQKRIQGRR

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPSLWRRPGTKTFQLVHRSQRDPLINDPSASDRVLKLVDRSQKKHRGDGATSYAASESAGVEDDEEDAKLAAGDAAAYGIFYDDADEYDYLQHLRSVGGGGESYLIEAPSQQDSKQKGKGKAKDLGGFELSEEALRRQDAQQSGAPAPFEMPEDVLPSHPLDEVSYDKIMASKAPERGLMPDLDPNIREVLEALDDEAYAADDGTGTDDEDEFWNGVLEGGEVQDKSEQVWEDDEAEGVAEGVEKLALDGDEGAGGADDQWAALKRFKAAGGAGAGASDDEDEEDYGSEGGDTIADLRATLATAKRPSRKSGMSAAGSAFSMSSSAMFRNEQLRTLDDRFDQIEKLYDEESDDSWGEGSDDDEGPDPSILPQGAARDDLERIMDDFLAKYEVIGGKYRPALEPLSGGGAGDDSIAANTSRLDRLRAELAKLDLGEEEEGEDPEVTARRREKERILAIVERQQREESSRKKKDRLPMVTIIEDQQKERWDCETVLSTYSNLSNHPRMLRLRDSRGPKPAQIKLDPKTGFPTVNGETVFDGRPSAKKDGDTIMEEDEPEEDEEEEEEYVIRETVKRPRAETADDKKARKAAVKAERAARRQEKKGTKEAFESETKRQKRIQGRRVAEGGAADIRSGQVGVRRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.71
3	0.69
4	0.7
5	0.7
6	0.65
7	0.6
8	0.62
9	0.61
10	0.57
11	0.58
12	0.56
13	0.49
14	0.46
15	0.45
16	0.41
17	0.37
18	0.34
19	0.29
20	0.2
21	0.21
22	0.23
23	0.23
24	0.23
25	0.28
26	0.37
27	0.44
28	0.49
29	0.57
30	0.64
31	0.67
32	0.71
33	0.72
34	0.7
35	0.66
36	0.67
37	0.64
38	0.58
39	0.54
40	0.46
41	0.38
42	0.3
43	0.25
44	0.18
45	0.11
46	0.07
47	0.08
48	0.07
49	0.07
50	0.08
51	0.09
52	0.09
53	0.09
54	0.08
55	0.07
56	0.08
57	0.07
58	0.07
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.06
71	0.05
72	0.06
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.11
77	0.12
78	0.11
79	0.11
80	0.12
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.08
89	0.09
90	0.08
91	0.09
92	0.08
93	0.08
94	0.06
95	0.07
96	0.09
97	0.13
98	0.14
99	0.15
100	0.21
101	0.27
102	0.33
103	0.42
104	0.48
105	0.53
106	0.62
107	0.69
108	0.69
109	0.71
110	0.71
111	0.68
112	0.63
113	0.57
114	0.48
115	0.4
116	0.33
117	0.26
118	0.2
119	0.15
120	0.14
121	0.11
122	0.11
123	0.11
124	0.13
125	0.14
126	0.2
127	0.21
128	0.24
129	0.25
130	0.28
131	0.29
132	0.28
133	0.27
134	0.2
135	0.19
136	0.16
137	0.15
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.09
150	0.11
151	0.13
152	0.14
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.14
157	0.14
158	0.13
159	0.15
160	0.17
161	0.2
162	0.21
163	0.22
164	0.22
165	0.25
166	0.25
167	0.22
168	0.18
169	0.18
170	0.19
171	0.19
172	0.18
173	0.17
174	0.16
175	0.14
176	0.13
177	0.1
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.06
196	0.06
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.06
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.04
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.1
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.12
222	0.11
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.05
227	0.04
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.05
250	0.07
251	0.1
252	0.1
253	0.11
254	0.13
255	0.13
256	0.14
257	0.12
258	0.13
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.08
263	0.08
264	0.06
265	0.06
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.06
289	0.06
290	0.09
291	0.14
292	0.2
293	0.26
294	0.28
295	0.32
296	0.36
297	0.37
298	0.36
299	0.38
300	0.38
301	0.33
302	0.32
303	0.29
304	0.24
305	0.22
306	0.18
307	0.12
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.13
318	0.13
319	0.15
320	0.15
321	0.18
322	0.21
323	0.22
324	0.23
325	0.18
326	0.2
327	0.19
328	0.19
329	0.17
330	0.12
331	0.14
332	0.12
333	0.13
334	0.12
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.08
379	0.1
380	0.11
381	0.13
382	0.13
383	0.14
384	0.16
385	0.17
386	0.15
387	0.16
388	0.16
389	0.14
390	0.15
391	0.12
392	0.12
393	0.11
394	0.1
395	0.08
396	0.07
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.07
407	0.1
408	0.1
409	0.13
410	0.13
411	0.16
412	0.22
413	0.23
414	0.23
415	0.22
416	0.23
417	0.22
418	0.21
419	0.19
420	0.12
421	0.12
422	0.1
423	0.08
424	0.08
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.06
430	0.08
431	0.11
432	0.1
433	0.15
434	0.2
435	0.25
436	0.3
437	0.35
438	0.4
439	0.46
440	0.5
441	0.49
442	0.49
443	0.47
444	0.44
445	0.47
446	0.48
447	0.4
448	0.37
449	0.34
450	0.31
451	0.33
452	0.39
453	0.41
454	0.46
455	0.55
456	0.6
457	0.66
458	0.71
459	0.75
460	0.77
461	0.74
462	0.7
463	0.67
464	0.64
465	0.59
466	0.54
467	0.48
468	0.43
469	0.36
470	0.3
471	0.26
472	0.28
473	0.27
474	0.28
475	0.27
476	0.24
477	0.24
478	0.26
479	0.27
480	0.22
481	0.23
482	0.22
483	0.2
484	0.18
485	0.2
486	0.17
487	0.15
488	0.2
489	0.21
490	0.25
491	0.26
492	0.3
493	0.32
494	0.38
495	0.45
496	0.46
497	0.5
498	0.54
499	0.6
500	0.61
501	0.66
502	0.63
503	0.6
504	0.6
505	0.59
506	0.59
507	0.59
508	0.61
509	0.56
510	0.61
511	0.56
512	0.5
513	0.49
514	0.44
515	0.37
516	0.3
517	0.32
518	0.25
519	0.28
520	0.27
521	0.22
522	0.21
523	0.23
524	0.22
525	0.16
526	0.16
527	0.14
528	0.19
529	0.23
530	0.26
531	0.27
532	0.27
533	0.3
534	0.33
535	0.35
536	0.34
537	0.31
538	0.29
539	0.27
540	0.26
541	0.23
542	0.18
543	0.16
544	0.13
545	0.12
546	0.09
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.08
552	0.08
553	0.07
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.1
558	0.15
559	0.24
560	0.32
561	0.35
562	0.37
563	0.44
564	0.48
565	0.53
566	0.59
567	0.58
568	0.62
569	0.66
570	0.66
571	0.64
572	0.63
573	0.59
574	0.55
575	0.52
576	0.51
577	0.54
578	0.6
579	0.61
580	0.66
581	0.71
582	0.69
583	0.73
584	0.73
585	0.71
586	0.71
587	0.75
588	0.76
589	0.74
590	0.8
591	0.77
592	0.71
593	0.69
594	0.65
595	0.6
596	0.58
597	0.57
598	0.56
599	0.6
600	0.6
601	0.59
602	0.6
603	0.64
604	0.67
605	0.72
606	0.72
607	0.73
608	0.74
609	0.77
610	0.74
611	0.66
612	0.56
613	0.46
614	0.39
615	0.31
616	0.26
617	0.18
618	0.15
619	0.14
620	0.13
621	0.13
622	0.11
623	0.13

G0SWT3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer