Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6QBK0

Protein Details
Accession A0A2J6QBK0    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
543-566GVSSKPVPKENKQINRKSKKAEFAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 11, cyto 7.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MATPTPGGKHPAAQAVATPPISTPFSTSNHPSHPTFSPHGPRSVVPSPQQVKKSPANSNTLYGYPGGNHPTNSSFGQGYDSPNAAMALGNAPGLEGLGLDGIGSMGTPIPGGVGGALGGARADEDERRRKLGVVMDILKTNKGRLSEAGLERLARRVGLECLWEAHMGSGGSTRTLIIAGNALALDIDFAENVVKKVSLSFPESPEIVTRHTEKAGAILLRDLEFRPNESPLTKMLDRFAANLERLAQLDKLSAIPGLNCHEAIAGIYESLEKLHKWEVERLKDGGEMIERDGDELERTAMCTKSGKPAMHTRDRLGMSLDYWQEKRRIWGRTDEKVWSILVECASLPALGYLPIRISENWISADIQKADPPAEDMLLAPGPILDWLEPENTLLPSTEPSKSDAMEGVEQALGQKYPEVMFVAKFDPPVIVPYSLAAQIYHSTNTTIDMFQTTTFDGLMIPVLLGEPTPGEVRTVHREVTVPIFTRNGDKILRVHQPMLLVEKIDYGRSLTELPFSHPRQLVEMLPALRQYAFLSTLLGKSFGVSSKPVPKENKQINRKSKKAEFAAFMAKGAISEDRPMRYDVALQTQPTLQLRVGFQLKGRDANVLFEIKLNGVVEVVGQNILNTKARNEGKGFQKALTVADLGKMLEISEDIGIWLEFVKGRLEQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.34
4 0.3
5 0.26
6 0.19
7 0.22
8 0.24
9 0.21
10 0.21
11 0.21
12 0.24
13 0.29
14 0.35
15 0.37
16 0.41
17 0.45
18 0.43
19 0.43
20 0.44
21 0.46
22 0.45
23 0.48
24 0.51
25 0.5
26 0.54
27 0.52
28 0.48
29 0.49
30 0.5
31 0.48
32 0.42
33 0.49
34 0.51
35 0.55
36 0.6
37 0.56
38 0.57
39 0.6
40 0.63
41 0.62
42 0.61
43 0.62
44 0.58
45 0.57
46 0.54
47 0.46
48 0.39
49 0.31
50 0.25
51 0.19
52 0.21
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.24
57 0.25
58 0.28
59 0.27
60 0.26
61 0.2
62 0.19
63 0.22
64 0.22
65 0.24
66 0.24
67 0.23
68 0.21
69 0.21
70 0.2
71 0.16
72 0.14
73 0.1
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.05
110 0.1
111 0.18
112 0.27
113 0.3
114 0.34
115 0.35
116 0.35
117 0.38
118 0.4
119 0.38
120 0.36
121 0.37
122 0.36
123 0.39
124 0.38
125 0.37
126 0.32
127 0.27
128 0.22
129 0.2
130 0.2
131 0.18
132 0.24
133 0.29
134 0.31
135 0.33
136 0.31
137 0.31
138 0.3
139 0.31
140 0.25
141 0.17
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.14
148 0.15
149 0.17
150 0.16
151 0.14
152 0.12
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.05
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.11
185 0.13
186 0.18
187 0.21
188 0.23
189 0.25
190 0.25
191 0.24
192 0.24
193 0.23
194 0.19
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.2
200 0.17
201 0.18
202 0.19
203 0.17
204 0.14
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.17
217 0.18
218 0.16
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.2
223 0.22
224 0.22
225 0.22
226 0.23
227 0.2
228 0.19
229 0.18
230 0.19
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.13
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.07
261 0.1
262 0.13
263 0.15
264 0.23
265 0.29
266 0.33
267 0.36
268 0.35
269 0.32
270 0.3
271 0.28
272 0.22
273 0.16
274 0.12
275 0.09
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.05
285 0.06
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.18
292 0.23
293 0.23
294 0.24
295 0.33
296 0.39
297 0.45
298 0.46
299 0.4
300 0.42
301 0.42
302 0.39
303 0.32
304 0.26
305 0.18
306 0.2
307 0.2
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.23
314 0.25
315 0.28
316 0.28
317 0.37
318 0.41
319 0.44
320 0.46
321 0.42
322 0.37
323 0.34
324 0.32
325 0.22
326 0.17
327 0.12
328 0.1
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.16
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.03
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.14
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.13
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.09
424 0.08
425 0.09
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.08
459 0.12
460 0.19
461 0.21
462 0.21
463 0.21
464 0.22
465 0.22
466 0.26
467 0.26
468 0.21
469 0.2
470 0.21
471 0.2
472 0.23
473 0.23
474 0.22
475 0.19
476 0.2
477 0.21
478 0.26
479 0.32
480 0.31
481 0.31
482 0.29
483 0.3
484 0.28
485 0.3
486 0.24
487 0.18
488 0.15
489 0.18
490 0.17
491 0.15
492 0.14
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.14
497 0.11
498 0.15
499 0.15
500 0.2
501 0.27
502 0.29
503 0.34
504 0.35
505 0.35
506 0.34
507 0.36
508 0.32
509 0.27
510 0.29
511 0.23
512 0.22
513 0.22
514 0.19
515 0.16
516 0.16
517 0.13
518 0.11
519 0.12
520 0.11
521 0.13
522 0.13
523 0.15
524 0.15
525 0.15
526 0.12
527 0.11
528 0.13
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.18
533 0.27
534 0.31
535 0.38
536 0.43
537 0.47
538 0.56
539 0.64
540 0.7
541 0.7
542 0.77
543 0.81
544 0.85
545 0.86
546 0.84
547 0.81
548 0.8
549 0.77
550 0.72
551 0.64
552 0.58
553 0.59
554 0.5
555 0.43
556 0.35
557 0.27
558 0.21
559 0.19
560 0.17
561 0.1
562 0.15
563 0.19
564 0.2
565 0.22
566 0.24
567 0.24
568 0.23
569 0.27
570 0.25
571 0.29
572 0.3
573 0.29
574 0.29
575 0.28
576 0.32
577 0.28
578 0.28
579 0.2
580 0.21
581 0.21
582 0.26
583 0.28
584 0.25
585 0.27
586 0.33
587 0.34
588 0.35
589 0.35
590 0.34
591 0.32
592 0.34
593 0.34
594 0.28
595 0.26
596 0.23
597 0.24
598 0.18
599 0.2
600 0.17
601 0.13
602 0.11
603 0.11
604 0.1
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.07
609 0.08
610 0.1
611 0.13
612 0.15
613 0.16
614 0.16
615 0.25
616 0.29
617 0.34
618 0.36
619 0.41
620 0.46
621 0.55
622 0.55
623 0.47
624 0.47
625 0.43
626 0.4
627 0.35
628 0.27
629 0.18
630 0.18
631 0.18
632 0.14
633 0.14
634 0.12
635 0.1
636 0.09
637 0.08
638 0.08
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.1
649 0.12