FuNGI

A0A2N5U8W6

Protein Details

Accession

A0A2N5U8W6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
117-140	APASQPKKTLPFKKKTKQVYIAAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
63-65	RKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MQANTSKSGPADPKFTDYKLFVGHDSLRKSNILKFAPSSNRKIDLETFVPPIKLNRKDPWAIRKKAEEEKKRLLETTYEKEVKDEANDADMKVDPDTKAATASPNKPIRDESVIAPAPASQPKKTLPFKKKTKQVYIAADQSARMLKKEEYQSWLLEDGSTSGERWVGRYESAGAASGAYTTGSASTSSNNDASNYVLFRMAPDGGAFHVIPCHRFYRFTQRPNYDTLGADEAEAAYEKMQKPTTKEDVGRWFMRRRGTNLSSQSSSQNVNSSQTVKLEEDVKPFFDQSKVSLGTTSKLRSQVEIPSFINGRRNKFTAVQGSTSNFDDEQDRKPNFGQDGDFDEVDYDEQFDDDEEGAGNLNDEAMEEDELKELAEKMKREMLAAGKAGDDEREKEDVDMAKDGLFAEREDLTKEGKAVKKLLMRKGEDNVYDSDDEVRNPYASEEDESDFEEVVPPPPNGAIAVDTKDPGSRSGTPGPGSQPAGSSSKGGKSGTQGTSLKGDKAQSRPPSRSGTPSLPSHSRTNSATHPIIGHAFGVGTTDRSRATSPQLPSSNGPRSRPDSPVVTASLKLHSPKAASTTTTANGKRKQHPNGAVASKEKKLNSGPAPPASTSPSGAAANSDQEPGAITKDQIINLIKLRPLTTKELLSHFKLQLKVESNKGLIFTLIREVANIVGGQLFIKDGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.44
3	0.42
4	0.37
5	0.36
6	0.35
7	0.34
8	0.3
9	0.31
10	0.36
11	0.37
12	0.41
13	0.4
14	0.38
15	0.39
16	0.4
17	0.41
18	0.43
19	0.4
20	0.38
21	0.38
22	0.44
23	0.52
24	0.56
25	0.57
26	0.55
27	0.57
28	0.54
29	0.56
30	0.51
31	0.47
32	0.43
33	0.4
34	0.39
35	0.35
36	0.35
37	0.31
38	0.35
39	0.38
40	0.43
41	0.46
42	0.48
43	0.53
44	0.6
45	0.67
46	0.7
47	0.71
48	0.7
49	0.7
50	0.71
51	0.71
52	0.74
53	0.76
54	0.75
55	0.74
56	0.77
57	0.78
58	0.72
59	0.67
60	0.59
61	0.56
62	0.54
63	0.52
64	0.51
65	0.47
66	0.44
67	0.44
68	0.44
69	0.38
70	0.33
71	0.29
72	0.21
73	0.22
74	0.24
75	0.22
76	0.22
77	0.21
78	0.2
79	0.18
80	0.2
81	0.15
82	0.15
83	0.17
84	0.15
85	0.15
86	0.15
87	0.21
88	0.25
89	0.29
90	0.37
91	0.42
92	0.43
93	0.44
94	0.46
95	0.43
96	0.42
97	0.4
98	0.33
99	0.36
100	0.36
101	0.33
102	0.31
103	0.27
104	0.24
105	0.29
106	0.3
107	0.22
108	0.25
109	0.29
110	0.39
111	0.47
112	0.54
113	0.57
114	0.64
115	0.74
116	0.8
117	0.84
118	0.85
119	0.86
120	0.84
121	0.82
122	0.8
123	0.75
124	0.71
125	0.64
126	0.55
127	0.45
128	0.38
129	0.35
130	0.27
131	0.21
132	0.19
133	0.18
134	0.25
135	0.32
136	0.34
137	0.34
138	0.36
139	0.36
140	0.35
141	0.35
142	0.27
143	0.2
144	0.17
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.1
149	0.09
150	0.12
151	0.12
152	0.13
153	0.15
154	0.14
155	0.14
156	0.15
157	0.16
158	0.15
159	0.16
160	0.15
161	0.12
162	0.1
163	0.1
164	0.09
165	0.07
166	0.05
167	0.05
168	0.04
169	0.04
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.08
174	0.1
175	0.12
176	0.14
177	0.14
178	0.14
179	0.14
180	0.15
181	0.15
182	0.13
183	0.12
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.12
188	0.1
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.1
194	0.09
195	0.07
196	0.11
197	0.11
198	0.13
199	0.15
200	0.17
201	0.16
202	0.19
203	0.22
204	0.3
205	0.39
206	0.45
207	0.52
208	0.55
209	0.56
210	0.58
211	0.58
212	0.48
213	0.4
214	0.35
215	0.27
216	0.22
217	0.2
218	0.15
219	0.11
220	0.09
221	0.09
222	0.07
223	0.05
224	0.1
225	0.11
226	0.14
227	0.18
228	0.2
229	0.23
230	0.3
231	0.36
232	0.36
233	0.37
234	0.4
235	0.44
236	0.48
237	0.48
238	0.45
239	0.44
240	0.42
241	0.47
242	0.44
243	0.4
244	0.44
245	0.43
246	0.46
247	0.48
248	0.48
249	0.43
250	0.41
251	0.38
252	0.31
253	0.3
254	0.23
255	0.21
256	0.17
257	0.18
258	0.18
259	0.18
260	0.17
261	0.17
262	0.18
263	0.15
264	0.16
265	0.17
266	0.17
267	0.19
268	0.19
269	0.2
270	0.18
271	0.19
272	0.18
273	0.16
274	0.15
275	0.12
276	0.17
277	0.16
278	0.16
279	0.17
280	0.17
281	0.17
282	0.2
283	0.2
284	0.17
285	0.21
286	0.21
287	0.2
288	0.22
289	0.26
290	0.25
291	0.28
292	0.25
293	0.23
294	0.23
295	0.23
296	0.29
297	0.26
298	0.28
299	0.27
300	0.28
301	0.28
302	0.3
303	0.33
304	0.33
305	0.32
306	0.29
307	0.27
308	0.27
309	0.27
310	0.24
311	0.21
312	0.13
313	0.12
314	0.13
315	0.14
316	0.17
317	0.23
318	0.23
319	0.24
320	0.24
321	0.27
322	0.24
323	0.24
324	0.2
325	0.14
326	0.18
327	0.18
328	0.18
329	0.15
330	0.14
331	0.12
332	0.12
333	0.1
334	0.06
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.04
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.08
362	0.11
363	0.12
364	0.13
365	0.17
366	0.17
367	0.17
368	0.19
369	0.18
370	0.18
371	0.18
372	0.17
373	0.13
374	0.13
375	0.13
376	0.12
377	0.1
378	0.09
379	0.11
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.15
384	0.16
385	0.16
386	0.15
387	0.13
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.09
392	0.08
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.12
402	0.17
403	0.19
404	0.21
405	0.22
406	0.26
407	0.3
408	0.37
409	0.42
410	0.44
411	0.44
412	0.44
413	0.46
414	0.46
415	0.4
416	0.36
417	0.31
418	0.26
419	0.23
420	0.2
421	0.19
422	0.16
423	0.15
424	0.14
425	0.14
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.1
430	0.1
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.12
438	0.11
439	0.12
440	0.1
441	0.11
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.09
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.16
459	0.16
460	0.2
461	0.25
462	0.27
463	0.27
464	0.29
465	0.3
466	0.29
467	0.29
468	0.24
469	0.2
470	0.2
471	0.21
472	0.2
473	0.19
474	0.17
475	0.18
476	0.21
477	0.2
478	0.19
479	0.21
480	0.28
481	0.27
482	0.32
483	0.3
484	0.28
485	0.34
486	0.34
487	0.31
488	0.26
489	0.28
490	0.27
491	0.32
492	0.38
493	0.42
494	0.48
495	0.51
496	0.53
497	0.56
498	0.53
499	0.54
500	0.51
501	0.48
502	0.45
503	0.45
504	0.46
505	0.44
506	0.45
507	0.44
508	0.41
509	0.39
510	0.35
511	0.36
512	0.35
513	0.37
514	0.34
515	0.3
516	0.28
517	0.26
518	0.25
519	0.22
520	0.17
521	0.1
522	0.09
523	0.08
524	0.09
525	0.07
526	0.08
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.13
531	0.15
532	0.16
533	0.23
534	0.28
535	0.3
536	0.37
537	0.4
538	0.41
539	0.43
540	0.48
541	0.51
542	0.48
543	0.49
544	0.46
545	0.49
546	0.5
547	0.51
548	0.47
549	0.42
550	0.39
551	0.4
552	0.37
553	0.33
554	0.31
555	0.28
556	0.27
557	0.25
558	0.24
559	0.23
560	0.22
561	0.22
562	0.21
563	0.24
564	0.24
565	0.23
566	0.23
567	0.25
568	0.26
569	0.33
570	0.36
571	0.4
572	0.45
573	0.52
574	0.59
575	0.64
576	0.69
577	0.71
578	0.73
579	0.7
580	0.72
581	0.69
582	0.63
583	0.6
584	0.57
585	0.52
586	0.5
587	0.45
588	0.41
589	0.4
590	0.44
591	0.43
592	0.47
593	0.49
594	0.49
595	0.52
596	0.48
597	0.47
598	0.43
599	0.38
600	0.31
601	0.26
602	0.24
603	0.21
604	0.2
605	0.2
606	0.17
607	0.19
608	0.18
609	0.18
610	0.14
611	0.14
612	0.15
613	0.14
614	0.16
615	0.13
616	0.13
617	0.17
618	0.21
619	0.21
620	0.25
621	0.26
622	0.27
623	0.29
624	0.32
625	0.29
626	0.28
627	0.3
628	0.3
629	0.32
630	0.36
631	0.37
632	0.38
633	0.4
634	0.45
635	0.48
636	0.49
637	0.51
638	0.49
639	0.5
640	0.49
641	0.48
642	0.49
643	0.51
644	0.5
645	0.49
646	0.5
647	0.45
648	0.42
649	0.41
650	0.34
651	0.27
652	0.24
653	0.19
654	0.19
655	0.2
656	0.18
657	0.18
658	0.18
659	0.17
660	0.18
661	0.16
662	0.11
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.08

A0A2N5U8W6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer