FuNGI

A0A2N5USM7

Protein Details

Accession

A0A2N5USM7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
791-814	VGQSVKLRNKKYTKGHPRWFGPFE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17919 RT_RNaseH_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MDHAFPVVCRAAPLSQYDVILGRDWIAANVSSTDWTSNEWVMKTPDGKTFSFFPKSSDCSPSFIHTLRTFAADPELIPLSRKAFRREMKKSHTEVFVCSILEGSLNVLGPREAPQASFPTMFSSSEPFGSRLRSLVSKYDDLFTPIDSVSHKERVIEHLIDTADAKPVYQNVRQMSPLLLQELKIRLHKLQSTGFIRPSTSAWSSPILFAKNASGSLRFCVDYRALNSVTKKDRHPLPLIQECFDALQGAKFFSKIDLQQGFHQMKISSADVPKTAFGTKYGHYEWLVMPFGLVNAPSTFQRMMTHILLLSLLQAEELRCSGHKCSFGLEEIQYVGHLVSQNGIRPMPEKLEAVESWPRPSNVHDVRSFLGLCGFYRRYVKNFAKIAAPLHDLTGGNVTKRQVIQWFPLHEKAFLELKRALVTAPVLLMPDSMKPYTIETDASDFAIGAVLLQLGLDNLPHPVAFESSKLNSAQRNYPAQERELLAIIHAWHLFVIQPVSDDLHPSDWPLLIPYIIDKADIPTTISPSLILTAKENCQFFHYDADDEIFCTLCTILLVIVVGMQRWLSFVAEDGGLTGPLTLKTISVPLPAVGPFERWSADFIMAIPMKEATASAIADALLQHVIIPFGTPHEFLTDRGSNFLSKGLLKFLANSNIDKINTSGYHPQSNGKNERYNGILEAAIFRLNTTGDPSKWESVLPVALYSTRIHASDSSGFSPFELTYGVSPPLALDCVKAIAADPVCPGEDELRARIKQINETRCKSLLKVSARSAKNKKSFDDKLGPDVITYDVGQSVKLRNKKYTKGHPRWFGPFEVSKKLDNNVYILVSPDGEEYSRPVNGNNLRQVSLRSLITNDMWATPPAIAQNIRQKDARVAREALAKTKAIAKLTVPPRRLRVKFDGKFINGGTGSAPQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.25
3	0.25
4	0.25
5	0.24
6	0.23
7	0.22
8	0.19
9	0.15
10	0.15
11	0.15
12	0.14
13	0.14
14	0.13
15	0.13
16	0.14
17	0.13
18	0.13
19	0.13
20	0.14
21	0.13
22	0.15
23	0.17
24	0.19
25	0.22
26	0.22
27	0.24
28	0.26
29	0.31
30	0.32
31	0.32
32	0.35
33	0.36
34	0.36
35	0.36
36	0.38
37	0.41
38	0.45
39	0.42
40	0.39
41	0.41
42	0.46
43	0.47
44	0.49
45	0.44
46	0.4
47	0.42
48	0.43
49	0.41
50	0.37
51	0.4
52	0.34
53	0.35
54	0.32
55	0.34
56	0.3
57	0.25
58	0.27
59	0.21
60	0.19
61	0.2
62	0.21
63	0.17
64	0.18
65	0.2
66	0.21
67	0.27
68	0.31
69	0.34
70	0.41
71	0.49
72	0.58
73	0.66
74	0.71
75	0.74
76	0.79
77	0.78
78	0.75
79	0.75
80	0.66
81	0.58
82	0.53
83	0.46
84	0.36
85	0.31
86	0.25
87	0.17
88	0.15
89	0.12
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.1
97	0.13
98	0.15
99	0.14
100	0.14
101	0.17
102	0.21
103	0.24
104	0.24
105	0.22
106	0.23
107	0.24
108	0.24
109	0.22
110	0.22
111	0.2
112	0.22
113	0.24
114	0.21
115	0.21
116	0.24
117	0.24
118	0.21
119	0.23
120	0.24
121	0.25
122	0.3
123	0.33
124	0.34
125	0.34
126	0.35
127	0.32
128	0.32
129	0.3
130	0.23
131	0.2
132	0.16
133	0.16
134	0.14
135	0.18
136	0.2
137	0.24
138	0.23
139	0.23
140	0.25
141	0.29
142	0.34
143	0.31
144	0.27
145	0.26
146	0.26
147	0.24
148	0.24
149	0.19
150	0.17
151	0.15
152	0.15
153	0.12
154	0.16
155	0.21
156	0.23
157	0.28
158	0.27
159	0.3
160	0.31
161	0.31
162	0.29
163	0.27
164	0.25
165	0.23
166	0.2
167	0.18
168	0.22
169	0.24
170	0.25
171	0.26
172	0.27
173	0.26
174	0.31
175	0.34
176	0.34
177	0.34
178	0.39
179	0.4
180	0.42
181	0.43
182	0.38
183	0.36
184	0.32
185	0.3
186	0.27
187	0.25
188	0.22
189	0.2
190	0.22
191	0.22
192	0.24
193	0.26
194	0.22
195	0.2
196	0.19
197	0.2
198	0.18
199	0.19
200	0.18
201	0.17
202	0.16
203	0.17
204	0.19
205	0.17
206	0.16
207	0.17
208	0.18
209	0.19
210	0.2
211	0.23
212	0.23
213	0.26
214	0.29
215	0.33
216	0.38
217	0.38
218	0.39
219	0.41
220	0.46
221	0.49
222	0.52
223	0.49
224	0.51
225	0.56
226	0.56
227	0.5
228	0.43
229	0.37
230	0.32
231	0.27
232	0.19
233	0.1
234	0.1
235	0.09
236	0.11
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.11
241	0.14
242	0.13
243	0.21
244	0.24
245	0.25
246	0.28
247	0.37
248	0.36
249	0.33
250	0.34
251	0.26
252	0.23
253	0.24
254	0.22
255	0.18
256	0.19
257	0.19
258	0.18
259	0.19
260	0.18
261	0.17
262	0.17
263	0.13
264	0.14
265	0.16
266	0.16
267	0.2
268	0.21
269	0.21
270	0.21
271	0.22
272	0.21
273	0.21
274	0.21
275	0.15
276	0.14
277	0.12
278	0.11
279	0.1
280	0.09
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.12
289	0.12
290	0.16
291	0.16
292	0.17
293	0.14
294	0.14
295	0.13
296	0.12
297	0.1
298	0.06
299	0.05
300	0.04
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.09
308	0.12
309	0.15
310	0.17
311	0.17
312	0.19
313	0.2
314	0.2
315	0.21
316	0.19
317	0.16
318	0.14
319	0.13
320	0.11
321	0.1
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.08
327	0.09
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.12
333	0.13
334	0.14
335	0.14
336	0.13
337	0.12
338	0.16
339	0.16
340	0.18
341	0.23
342	0.21
343	0.23
344	0.24
345	0.24
346	0.21
347	0.24
348	0.29
349	0.29
350	0.33
351	0.31
352	0.31
353	0.31
354	0.32
355	0.3
356	0.2
357	0.17
358	0.13
359	0.12
360	0.15
361	0.15
362	0.15
363	0.2
364	0.22
365	0.22
366	0.31
367	0.35
368	0.37
369	0.38
370	0.37
371	0.35
372	0.34
373	0.33
374	0.26
375	0.25
376	0.18
377	0.16
378	0.17
379	0.14
380	0.13
381	0.17
382	0.14
383	0.12
384	0.14
385	0.14
386	0.14
387	0.15
388	0.16
389	0.15
390	0.16
391	0.21
392	0.24
393	0.27
394	0.27
395	0.33
396	0.32
397	0.29
398	0.27
399	0.24
400	0.25
401	0.22
402	0.23
403	0.19
404	0.19
405	0.19
406	0.18
407	0.16
408	0.11
409	0.11
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.09
427	0.12
428	0.11
429	0.11
430	0.1
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.03
436	0.03
437	0.02
438	0.02
439	0.02
440	0.02
441	0.02
442	0.02
443	0.02
444	0.02
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.04
449	0.04
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.09
454	0.1
455	0.12
456	0.12
457	0.14
458	0.15
459	0.17
460	0.2
461	0.22
462	0.26
463	0.25
464	0.3
465	0.29
466	0.28
467	0.28
468	0.24
469	0.21
470	0.18
471	0.16
472	0.11
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.08
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.06
505	0.08
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.08
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.09
514	0.09
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.11
520	0.14
521	0.18
522	0.18
523	0.17
524	0.17
525	0.19
526	0.18
527	0.2
528	0.18
529	0.15
530	0.15
531	0.17
532	0.14
533	0.13
534	0.12
535	0.08
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.05
553	0.06
554	0.04
555	0.04
556	0.05
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.06
571	0.08
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.1
577	0.1
578	0.11
579	0.1
580	0.11
581	0.11
582	0.12
583	0.12
584	0.11
585	0.13
586	0.13
587	0.13
588	0.11
589	0.1
590	0.15
591	0.15
592	0.15
593	0.13
594	0.12
595	0.11
596	0.11
597	0.1
598	0.05
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.05
608	0.04
609	0.05
610	0.04
611	0.05
612	0.04
613	0.05
614	0.04
615	0.06
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.12
620	0.13
621	0.13
622	0.2
623	0.22
624	0.21
625	0.22
626	0.23
627	0.2
628	0.2
629	0.21
630	0.16
631	0.13
632	0.14
633	0.14
634	0.15
635	0.14
636	0.16
637	0.18
638	0.24
639	0.24
640	0.24
641	0.24
642	0.26
643	0.26
644	0.25
645	0.22
646	0.18
647	0.17
648	0.2
649	0.25
650	0.25
651	0.28
652	0.29
653	0.34
654	0.36
655	0.44
656	0.48
657	0.45
658	0.48
659	0.45
660	0.47
661	0.43
662	0.38
663	0.3
664	0.24
665	0.19
666	0.14
667	0.14
668	0.13
669	0.11
670	0.1
671	0.09
672	0.08
673	0.08
674	0.08
675	0.12
676	0.16
677	0.15
678	0.2
679	0.24
680	0.25
681	0.25
682	0.25
683	0.21
684	0.18
685	0.2
686	0.16
687	0.12
688	0.11
689	0.11
690	0.13
691	0.12
692	0.13
693	0.12
694	0.12
695	0.13
696	0.13
697	0.17
698	0.2
699	0.23
700	0.22
701	0.22
702	0.22
703	0.21
704	0.22
705	0.17
706	0.13
707	0.1
708	0.09
709	0.09
710	0.11
711	0.12
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.1
716	0.11
717	0.09
718	0.08
719	0.08
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.08
724	0.12
725	0.12
726	0.13
727	0.13
728	0.13
729	0.13
730	0.14
731	0.14
732	0.11
733	0.15
734	0.16
735	0.19
736	0.25
737	0.25
738	0.27
739	0.31
740	0.31
741	0.36
742	0.43
743	0.5
744	0.52
745	0.57
746	0.6
747	0.59
748	0.58
749	0.5
750	0.49
751	0.47
752	0.45
753	0.47
754	0.5
755	0.55
756	0.58
757	0.66
758	0.67
759	0.69
760	0.7
761	0.69
762	0.65
763	0.66
764	0.67
765	0.66
766	0.67
767	0.59
768	0.56
769	0.55
770	0.51
771	0.41
772	0.37
773	0.29
774	0.21
775	0.18
776	0.13
777	0.12
778	0.12
779	0.13
780	0.14
781	0.2
782	0.27
783	0.34
784	0.37
785	0.45
786	0.52
787	0.61
788	0.69
789	0.73
790	0.76
791	0.8
792	0.85
793	0.85
794	0.84
795	0.83
796	0.76
797	0.68
798	0.63
799	0.6
800	0.55
801	0.54
802	0.5
803	0.46
804	0.45
805	0.46
806	0.43
807	0.37
808	0.35
809	0.29
810	0.27
811	0.24
812	0.23
813	0.2
814	0.16
815	0.15
816	0.13
817	0.12
818	0.11
819	0.11
820	0.12
821	0.15
822	0.17
823	0.17
824	0.17
825	0.25
826	0.32
827	0.39
828	0.45
829	0.44
830	0.43
831	0.44
832	0.46
833	0.42
834	0.39
835	0.32
836	0.26
837	0.24
838	0.26
839	0.25
840	0.26
841	0.22
842	0.2
843	0.2
844	0.19
845	0.19
846	0.16
847	0.16
848	0.14
849	0.18
850	0.17
851	0.22
852	0.32
853	0.36
854	0.39
855	0.4
856	0.4
857	0.46
858	0.53
859	0.53
860	0.48
861	0.46
862	0.46
863	0.53
864	0.53
865	0.49
866	0.44
867	0.38
868	0.34
869	0.37
870	0.38
871	0.32
872	0.32
873	0.29
874	0.34
875	0.44
876	0.51
877	0.49
878	0.51
879	0.57
880	0.66
881	0.67
882	0.66
883	0.66
884	0.69
885	0.69
886	0.72
887	0.73
888	0.65
889	0.66
890	0.58
891	0.55
892	0.43
893	0.39
894	0.31

A0A2N5USM7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer