Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N5U021

Protein Details
Accession A0A2N5U021    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-25STEGKRNRQQDSPKDKQQQASHydrophilic
323-343MGVAKKEKKRKREGPGQLARNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-336VAKKEKKRKREG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSQTSTEGKRNRQQDSPKDKQQQASLALPSHAWKHANPLTTAGNKLGLAGLSNPNDVGSSAAAAADDNRPSASGSGTFASGGATTTNVQTDFDAMNDAVGIAGVDIAAEEELARTQSNLYRSSHRNYNSNPQLPPQPYLKNPRVKILDFLDKPALTLMVQHIAASFQLKTLEPAILDVLTQAAEARMHTVIVDSIGAKDHRVASSHLRAPPLYGGAAGTTTAAAPKGKQKEREPAAMYDQLVYEHPERMLSMLARVEGEEERKARLEREATETEGEGLGLGLDGGGGGQEQQTTADSPAPGGGGVNREQQQQQQTPHEKGGGMGVAKKEKKRKREGPGQLARNMSEDARARQSNQTAMRSVGGRSKYSWLSGGVPSTGLNKAPLPTTLMASLPAPKFAPQAAAAAASSSSSQPGPPVPPPSSSATTAAQDASPHASSTPTGTTTAAAAAAAGTGRAAGAGASWGKKEAAHGHHLGGRLGGALPPKHAASSSPRVGLNDCLFALERERGTGAGKGTGSKSLFKAYLSHNASPTLANPAPSSALLDHRLLHNHPSSTSNYYHSIRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.76
3 0.77
4 0.8
5 0.82
6 0.82
7 0.79
8 0.75
9 0.71
10 0.66
11 0.62
12 0.55
13 0.48
14 0.42
15 0.38
16 0.34
17 0.3
18 0.29
19 0.26
20 0.22
21 0.3
22 0.34
23 0.37
24 0.35
25 0.36
26 0.38
27 0.39
28 0.41
29 0.33
30 0.31
31 0.26
32 0.25
33 0.22
34 0.16
35 0.13
36 0.15
37 0.2
38 0.19
39 0.2
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.17
44 0.15
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.11
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.13
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.03
89 0.03
90 0.02
91 0.02
92 0.02
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.12
104 0.16
105 0.19
106 0.21
107 0.28
108 0.33
109 0.38
110 0.44
111 0.44
112 0.48
113 0.49
114 0.57
115 0.59
116 0.6
117 0.56
118 0.51
119 0.56
120 0.51
121 0.5
122 0.45
123 0.4
124 0.41
125 0.49
126 0.54
127 0.55
128 0.54
129 0.58
130 0.58
131 0.54
132 0.52
133 0.49
134 0.5
135 0.42
136 0.44
137 0.41
138 0.35
139 0.34
140 0.29
141 0.24
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.09
153 0.07
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.15
190 0.2
191 0.26
192 0.32
193 0.32
194 0.32
195 0.31
196 0.3
197 0.29
198 0.24
199 0.17
200 0.11
201 0.09
202 0.07
203 0.08
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.13
213 0.22
214 0.27
215 0.34
216 0.38
217 0.47
218 0.5
219 0.56
220 0.52
221 0.46
222 0.46
223 0.42
224 0.38
225 0.28
226 0.24
227 0.18
228 0.16
229 0.16
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.17
253 0.18
254 0.17
255 0.23
256 0.24
257 0.23
258 0.23
259 0.22
260 0.19
261 0.16
262 0.14
263 0.07
264 0.05
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.01
272 0.01
273 0.01
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.13
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.2
297 0.25
298 0.28
299 0.3
300 0.34
301 0.38
302 0.38
303 0.39
304 0.36
305 0.3
306 0.26
307 0.23
308 0.16
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.18
313 0.22
314 0.27
315 0.35
316 0.4
317 0.49
318 0.57
319 0.65
320 0.67
321 0.75
322 0.8
323 0.81
324 0.83
325 0.79
326 0.73
327 0.65
328 0.56
329 0.47
330 0.38
331 0.27
332 0.22
333 0.2
334 0.18
335 0.22
336 0.22
337 0.23
338 0.26
339 0.28
340 0.3
341 0.32
342 0.32
343 0.27
344 0.28
345 0.27
346 0.24
347 0.23
348 0.22
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.23
353 0.22
354 0.22
355 0.22
356 0.18
357 0.19
358 0.19
359 0.18
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.14
364 0.13
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.14
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.18
379 0.15
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.16
384 0.15
385 0.17
386 0.12
387 0.13
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.1
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.11
401 0.14
402 0.18
403 0.23
404 0.24
405 0.25
406 0.29
407 0.33
408 0.34
409 0.32
410 0.31
411 0.27
412 0.27
413 0.26
414 0.23
415 0.18
416 0.15
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.15
425 0.15
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.1
433 0.08
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.02
445 0.03
446 0.05
447 0.08
448 0.09
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.16
454 0.21
455 0.24
456 0.29
457 0.31
458 0.32
459 0.35
460 0.36
461 0.33
462 0.25
463 0.2
464 0.14
465 0.13
466 0.12
467 0.14
468 0.13
469 0.15
470 0.17
471 0.18
472 0.17
473 0.17
474 0.19
475 0.22
476 0.3
477 0.32
478 0.34
479 0.34
480 0.36
481 0.37
482 0.41
483 0.35
484 0.29
485 0.25
486 0.23
487 0.22
488 0.22
489 0.23
490 0.21
491 0.19
492 0.18
493 0.18
494 0.17
495 0.18
496 0.21
497 0.19
498 0.19
499 0.19
500 0.21
501 0.22
502 0.27
503 0.27
504 0.28
505 0.28
506 0.29
507 0.3
508 0.27
509 0.31
510 0.29
511 0.38
512 0.4
513 0.42
514 0.38
515 0.39
516 0.39
517 0.35
518 0.32
519 0.3
520 0.25
521 0.23
522 0.22
523 0.22
524 0.23
525 0.22
526 0.24
527 0.17
528 0.21
529 0.23
530 0.24
531 0.24
532 0.26
533 0.3
534 0.29
535 0.34
536 0.35
537 0.34
538 0.34
539 0.36
540 0.37
541 0.37
542 0.38
543 0.35
544 0.36