Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N5VRT0

Protein Details
Accession A0A2N5VRT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-141GEGWYKRKRAPQPPTPVKIKSKNEERDPKKRRLKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-141KRKRAPQPPTPVKIKSKNEERDPKKRRLKE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024738  Hfi1/Tada1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF12767  SAGA-Tad1  
Amino Acid Sequences MLDPFVGTLPSHIYPPPPNKRADTLAIKQSIADELSEDDGLAYWSALVTFLKGQLDRTEFEAQTARLLKSEKLVSLHNALILSILYNTTRTDLPTANLSQEHNPTTGEGWYKRKRAPQPPTPVKIKSKNEERDPKKRRLKEAVMALGQRERNRLKQIASLKEKELEQQLKLNSQSSATRHLSSSHHYVFPERAENVMNTPLASKMKISSSTLYQDYMRCQQAPICSESKQLPDFDTLKDRMSLIAYDSGLSNGVDSAASSLALIALEVHLKTLLGDLLSLIRADRSVANTVEADEVASTAPGWPNGSVQHEESVAQPPVASTSVGPNSPSTTLPRPDPTSTSPAKQPAPISLAQQAYQASSNLRLRDLKTQGLAPHLTSRDVTALAEISPHAFVRTHPAALERLIANKKIETPFFPFLFSVDLFFLPLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.39
3 0.48
4 0.49
5 0.53
6 0.56
7 0.6
8 0.61
9 0.61
10 0.59
11 0.55
12 0.59
13 0.56
14 0.52
15 0.46
16 0.42
17 0.36
18 0.28
19 0.21
20 0.13
21 0.12
22 0.14
23 0.14
24 0.12
25 0.1
26 0.09
27 0.1
28 0.09
29 0.07
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.08
37 0.11
38 0.14
39 0.15
40 0.17
41 0.22
42 0.25
43 0.24
44 0.28
45 0.33
46 0.29
47 0.31
48 0.33
49 0.27
50 0.31
51 0.34
52 0.29
53 0.25
54 0.27
55 0.25
56 0.27
57 0.3
58 0.26
59 0.24
60 0.27
61 0.27
62 0.29
63 0.29
64 0.24
65 0.21
66 0.18
67 0.17
68 0.14
69 0.11
70 0.08
71 0.08
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.2
82 0.21
83 0.21
84 0.22
85 0.23
86 0.24
87 0.27
88 0.27
89 0.23
90 0.22
91 0.2
92 0.2
93 0.2
94 0.21
95 0.22
96 0.3
97 0.37
98 0.42
99 0.46
100 0.54
101 0.61
102 0.66
103 0.71
104 0.71
105 0.75
106 0.79
107 0.81
108 0.78
109 0.76
110 0.74
111 0.74
112 0.71
113 0.69
114 0.69
115 0.71
116 0.75
117 0.78
118 0.78
119 0.79
120 0.79
121 0.81
122 0.81
123 0.79
124 0.78
125 0.77
126 0.76
127 0.72
128 0.73
129 0.68
130 0.61
131 0.55
132 0.47
133 0.42
134 0.38
135 0.33
136 0.31
137 0.28
138 0.3
139 0.35
140 0.37
141 0.34
142 0.38
143 0.44
144 0.47
145 0.51
146 0.49
147 0.44
148 0.44
149 0.42
150 0.38
151 0.38
152 0.32
153 0.26
154 0.28
155 0.27
156 0.28
157 0.29
158 0.27
159 0.2
160 0.19
161 0.21
162 0.18
163 0.24
164 0.23
165 0.23
166 0.22
167 0.25
168 0.25
169 0.26
170 0.31
171 0.25
172 0.25
173 0.24
174 0.25
175 0.24
176 0.24
177 0.23
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.13
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.21
204 0.2
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.21
210 0.22
211 0.19
212 0.18
213 0.2
214 0.22
215 0.23
216 0.21
217 0.2
218 0.17
219 0.2
220 0.21
221 0.2
222 0.23
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.19
227 0.15
228 0.15
229 0.13
230 0.09
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.12
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.1
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.12
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.21
301 0.18
302 0.15
303 0.14
304 0.12
305 0.14
306 0.14
307 0.13
308 0.08
309 0.13
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.18
315 0.19
316 0.2
317 0.2
318 0.23
319 0.26
320 0.29
321 0.34
322 0.37
323 0.38
324 0.41
325 0.4
326 0.42
327 0.42
328 0.42
329 0.41
330 0.43
331 0.42
332 0.41
333 0.38
334 0.35
335 0.36
336 0.34
337 0.32
338 0.32
339 0.31
340 0.28
341 0.28
342 0.24
343 0.21
344 0.21
345 0.19
346 0.15
347 0.2
348 0.24
349 0.23
350 0.26
351 0.29
352 0.3
353 0.39
354 0.41
355 0.38
356 0.36
357 0.39
358 0.37
359 0.38
360 0.37
361 0.3
362 0.33
363 0.3
364 0.3
365 0.26
366 0.26
367 0.22
368 0.21
369 0.19
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.12
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.19
382 0.23
383 0.22
384 0.21
385 0.24
386 0.25
387 0.25
388 0.29
389 0.21
390 0.26
391 0.29
392 0.32
393 0.32
394 0.32
395 0.38
396 0.39
397 0.41
398 0.37
399 0.41
400 0.44
401 0.43
402 0.43
403 0.36
404 0.32
405 0.33
406 0.28
407 0.23
408 0.18
409 0.17