Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N5V6J8

Protein Details
Accession A0A2N5V6J8    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48APQPKKTIPGQQPKRDRGDYHydrophilic
253-272FQPKEKKTTQTAKKVKEKTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-115RAERRGGPRGGRGARGRGAGRGRGGGRPDER
281-331RPPRAGGDRGGRGRGRGRGDRDGGERREFDNSRGAPRGGRGRAGPRDGSGR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MDKGDSDDEGGATRSSAPVKSTKGPVAAAPQPKKTIPGQQPKRDRGDYPSRGAPRKVYGGQSGGAETEVIGSKPAGMTEQGRDDRAERRGGPRGGRGARGRGAGRGRGGGRPDERPDRHSATGTHDTDRKVASGWGAEEGKQELQAETEGYGDAAAALTPADADDGWGAKAEDGAPVANGHAKNVDGAGDSREEEEEDKTKTFEEYLAEKAGAANALPSLKKDARKPNEGADDSQWKNAVKFVKGEEEEEMFFQPKEKKTTQTAKKVKEKTYIEVEPLGYRPPRAGGDRGGRGRGRGRGDRDGGERREFDNSRGAPRGGRGRAGPRDGSGRGSKELNTEDANAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.15
4 0.17
5 0.22
6 0.27
7 0.33
8 0.38
9 0.39
10 0.4
11 0.39
12 0.39
13 0.4
14 0.42
15 0.46
16 0.46
17 0.47
18 0.48
19 0.47
20 0.49
21 0.46
22 0.48
23 0.49
24 0.55
25 0.6
26 0.66
27 0.76
28 0.8
29 0.84
30 0.78
31 0.7
32 0.67
33 0.68
34 0.64
35 0.6
36 0.61
37 0.6
38 0.61
39 0.61
40 0.57
41 0.51
42 0.51
43 0.5
44 0.45
45 0.41
46 0.38
47 0.37
48 0.34
49 0.29
50 0.22
51 0.18
52 0.14
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.11
65 0.13
66 0.21
67 0.22
68 0.24
69 0.25
70 0.26
71 0.3
72 0.31
73 0.33
74 0.28
75 0.32
76 0.4
77 0.43
78 0.44
79 0.43
80 0.48
81 0.46
82 0.5
83 0.47
84 0.44
85 0.42
86 0.43
87 0.39
88 0.36
89 0.37
90 0.33
91 0.31
92 0.31
93 0.3
94 0.28
95 0.3
96 0.3
97 0.29
98 0.31
99 0.35
100 0.4
101 0.4
102 0.41
103 0.45
104 0.45
105 0.44
106 0.41
107 0.37
108 0.35
109 0.42
110 0.4
111 0.36
112 0.34
113 0.33
114 0.33
115 0.32
116 0.25
117 0.17
118 0.15
119 0.13
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.03
149 0.02
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.09
200 0.07
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.13
207 0.17
208 0.21
209 0.28
210 0.38
211 0.43
212 0.5
213 0.51
214 0.52
215 0.57
216 0.55
217 0.5
218 0.44
219 0.46
220 0.4
221 0.4
222 0.35
223 0.27
224 0.25
225 0.27
226 0.26
227 0.19
228 0.2
229 0.21
230 0.27
231 0.27
232 0.28
233 0.26
234 0.25
235 0.24
236 0.22
237 0.22
238 0.15
239 0.14
240 0.17
241 0.21
242 0.23
243 0.3
244 0.31
245 0.35
246 0.42
247 0.53
248 0.58
249 0.63
250 0.68
251 0.71
252 0.78
253 0.81
254 0.78
255 0.77
256 0.71
257 0.66
258 0.65
259 0.57
260 0.5
261 0.45
262 0.4
263 0.33
264 0.3
265 0.29
266 0.22
267 0.2
268 0.19
269 0.19
270 0.22
271 0.23
272 0.26
273 0.28
274 0.35
275 0.43
276 0.46
277 0.49
278 0.46
279 0.46
280 0.49
281 0.48
282 0.48
283 0.47
284 0.5
285 0.52
286 0.55
287 0.56
288 0.58
289 0.6
290 0.57
291 0.54
292 0.5
293 0.44
294 0.49
295 0.45
296 0.4
297 0.41
298 0.39
299 0.4
300 0.42
301 0.42
302 0.35
303 0.4
304 0.47
305 0.4
306 0.41
307 0.41
308 0.45
309 0.52
310 0.56
311 0.51
312 0.45
313 0.48
314 0.46
315 0.46
316 0.43
317 0.39
318 0.37
319 0.38
320 0.36
321 0.36
322 0.37
323 0.35
324 0.31
325 0.31
326 0.29
327 0.28
328 0.29